More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2560 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2560  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 284 aa  569  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2251  pantoate--beta-alanine ligase  63.8 
 
 		 307 aa  340  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3439  pantoate--beta-alanine ligase  58.21 
 
 		 280 aa  323  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2495  pantoate--beta-alanine ligase  62.14 
 
 		 280 aa  316  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1658  pantoate--beta-alanine ligase  61.79 
 
 		 282 aa  313  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.752293 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0403  pantoate--beta-alanine ligase  63.54 
 
 		 279 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  56.94 
 
 		 288 aa  303  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1757  pantoate--beta-alanine ligase  62.82 
 
 		 279 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  56.54 
 
 		 290 aa  294  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1396  pantoate--beta-alanine ligase  55.15 
 
 		 288 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.262573  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  54.04 
 
 		 290 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3149  pantoate--beta-alanine ligase  51.25 
 
 		 290 aa  265  7e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  53.21 
 
 		 282 aa  256  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  50.91 
 
 		 285 aa  256  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  50.91 
 
 		 285 aa  255  7e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  50.55 
 
 		 285 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  51.99 
 
 		 283 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  51.62 
 
 		 285 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  49.82 
 
 		 281 aa  251  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  51.62 
 
 		 283 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  52.54 
 
 		 279 aa  249  5e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  49.27 
 
 		 283 aa  248  7e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 283 aa  248  8e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  50.73 
 
 		 286 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4542  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 285 aa  246  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3319  pantoate--beta-alanine ligase  51.99 
 
 		 286 aa  246  3e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 282 aa  246  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  47.45 
 
 		 281 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3564  pantoate--beta-alanine ligase  48.59 
 
 		 283 aa  241  7e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  43.38 
 
 		 281 aa  241  7.999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1644  pantoate/beta-alanine ligase  53.96 
 
 		 295 aa  241  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.742057  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  46.79 
 
 		 284 aa  241  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3063  pantoate--beta-alanine ligase  49.28 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 287 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 287 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4783  pantoate--beta-alanine ligase  48.2 
 
 		 283 aa  239  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 287 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 283 aa  239  5e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 287 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  48.2 
 
 		 287 aa  237  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1721  pantothenate synthetase  47.72 
 
 		 288 aa  236  3e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.308068  normal  0.216295 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  46.24 
 
 		 284 aa  235  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  41.11 
 
 		 280 aa  235  7e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2314  pantoate/beta-alanine ligase  50.54 
 
 		 284 aa  234  9e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000496833  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  46.18 
 
 		 283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4085  pantoate--beta-alanine ligase  51.47 
 
 		 282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0133419 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  45.39 
 
 		 282 aa  232  6e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2891  pantoate/beta-alanine ligase  52.35 
 
 		 290 aa  230  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150324  normal  0.438724 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  40.07 
 
 		 282 aa  229  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 		 286 aa  229  4e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  45.59 
 
 		 281 aa  229  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 		 284 aa  228  9e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  45.29 
 
 		 284 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  47.65 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  45.29 
 
 		 284 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  47.1 
 
 		 284 aa  227  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  43.77 
 
 		 282 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  48.36 
 
 		 282 aa  227  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  44.89 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1498  pantoate--beta-alanine ligase  46.59 
 
 		 281 aa  226  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00126611  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  42.75 
 
 		 280 aa  226  3e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  46.55 
 
 		 286 aa  226  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  46.69 
 
 		 281 aa  226  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  44.93 
 
 		 284 aa  226  4e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  45.22 
 
 		 281 aa  226  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  42.75 
 
 		 280 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  45.22 
 
 		 281 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  41.28 
 
 		 281 aa  225  6e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  46.38 
 
 		 284 aa  224  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1702  pantoate--beta-alanine ligase  49.42 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.238045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  44.36 
 
 		 280 aa  224  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3332  pantoate--beta-alanine ligase  47.12 
 
 		 311 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  44.85 
 
 		 281 aa  223  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2423  pantoate--beta-alanine ligase  47.12 
 
 		 283 aa  222  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  42.34 
 
 		 281 aa  222  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1134  pantoate/beta-alanine ligase  47 
 
 		 283 aa  222  4.9999999999999996e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  41.67 
 
 		 283 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  44.49 
 
 		 281 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2388  pantoate--beta-alanine ligase  49.42 
 
 		 283 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0472601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  42.44 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  44.73 
 
 		 291 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  44.12 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  44.12 
 
 		 281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2430  pantoate/beta-alanine ligase  48.56 
 
 		 288 aa  219  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  43.38 
 
 		 281 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  47.51 
 
 		 284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  45.22 
 
 		 281 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  43.75 
 
 		 281 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  46.3 
 
 		 290 aa  218  7e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  44.6 
 
 		 300 aa  218  8.999999999999998e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  43.43 
 
 		 283 aa  217  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  43.43 
 
 		 284 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  43.84 
 
 		 284 aa  217  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  43.84 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  43.84 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  44.93 
 
 		 293 aa  216  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  43.84 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  43.84 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  48.03 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  43.84 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>