More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4542 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4542  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 285 aa  570  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3063  pantoate--beta-alanine ligase  58.04 
 
 		 283 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3564  pantoate--beta-alanine ligase  57.24 
 
 		 283 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2423  pantoate--beta-alanine ligase  54.9 
 
 		 283 aa  304  9.000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1702  pantoate--beta-alanine ligase  58.02 
 
 		 283 aa  299  3e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.238045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2388  pantoate--beta-alanine ligase  58.49 
 
 		 283 aa  299  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0472601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4783  pantoate--beta-alanine ligase  54.9 
 
 		 283 aa  298  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  58.61 
 
 		 287 aa  296  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3332  pantoate--beta-alanine ligase  53.5 
 
 		 311 aa  291  8e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  53.48 
 
 		 284 aa  280  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3149  pantoate--beta-alanine ligase  54.23 
 
 		 290 aa  275  6e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  54.35 
 
 		 290 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  52.33 
 
 		 290 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  53.55 
 
 		 283 aa  260  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  52.65 
 
 		 283 aa  258  7e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  48.58 
 
 		 283 aa  258  9e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  52.01 
 
 		 285 aa  256  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  53.09 
 
 		 285 aa  255  5e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  52.3 
 
 		 283 aa  255  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1396  pantoate--beta-alanine ligase  52.98 
 
 		 288 aa  255  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.262573  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 		 283 aa  255  6e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  52.19 
 
 		 288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  51.28 
 
 		 285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 287 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 		 286 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1721  pantothenate synthetase  51.48 
 
 		 288 aa  249  5e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.308068  normal  0.216295 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4085  pantoate--beta-alanine ligase  53.9 
 
 		 282 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0133419 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2560  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 284 aa  246  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  49.11 
 
 		 287 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  51.94 
 
 		 282 aa  244  9e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  49.29 
 
 		 287 aa  244  9e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  47.7 
 
 		 281 aa  240  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  48.04 
 
 		 287 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  49.27 
 
 		 283 aa  239  5e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 		 286 aa  236  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  48.75 
 
 		 286 aa  236  4e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  47.35 
 
 		 285 aa  234  9e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  46.69 
 
 		 283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  46.55 
 
 		 284 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  47.06 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  47.06 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1757  pantoate--beta-alanine ligase  50.88 
 
 		 279 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  47.06 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  47.06 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  47.06 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  46.18 
 
 		 284 aa  232  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  46.69 
 
 		 283 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  46.69 
 
 		 283 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  46.69 
 
 		 283 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  43.75 
 
 		 288 aa  231  8.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0403  pantoate--beta-alanine ligase  50.53 
 
 		 279 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  46.18 
 
 		 284 aa  231  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  48.74 
 
 		 283 aa  231  9e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2495  pantoate--beta-alanine ligase  50.35 
 
 		 280 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  46.29 
 
 		 282 aa  229  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  45.45 
 
 		 284 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  43.71 
 
 		 279 aa  228  6e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  45.45 
 
 		 284 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3439  pantoate--beta-alanine ligase  44.33 
 
 		 280 aa  226  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0198  pantoate--beta-alanine ligase  47.79 
 
 		 281 aa  226  4e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.795684  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  44.49 
 
 		 284 aa  224  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2251  pantoate--beta-alanine ligase  46.64 
 
 		 307 aa  224  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0174  pantoate--beta-alanine ligase  47.06 
 
 		 281 aa  223  2e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  46.69 
 
 		 279 aa  223  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0555  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 		 278 aa  223  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  44.17 
 
 		 282 aa  223  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0090  pantoate/beta-alanine ligase  51.8 
 
 		 273 aa  223  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  43.46 
 
 		 283 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  47.62 
 
 		 293 aa  222  4.9999999999999996e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0126  pantoate--beta-alanine ligase  43.06 
 
 		 287 aa  221  8e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  49.42 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  43.86 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  44.69 
 
 		 284 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  45.96 
 
 		 301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  49.46 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  41.45 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  41.58 
 
 		 281 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0117  pantoate--beta-alanine ligase  44.13 
 
 		 288 aa  219  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  45.45 
 
 		 300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  45.79 
 
 		 284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  45.96 
 
 		 289 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  41.45 
 
 		 281 aa  219  5e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00689  pantoate--beta-alanine ligase  47.62 
 
 		 280 aa  219  5e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.591476  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3175  pantoate--beta-alanine ligase  45.82 
 
 		 281 aa  218  7e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  44.57 
 
 		 281 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  44.57 
 
 		 281 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  41.7 
 
 		 282 aa  218  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  44.32 
 
 		 284 aa  218  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  44.17 
 
 		 282 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  43.84 
 
 		 281 aa  216  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  45.23 
 
 		 286 aa  216  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  44.13 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  44.12 
 
 		 284 aa  216  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2042  pantoate/beta-alanine ligase  46.97 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  45.36 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  42.7 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  42.6 
 
 		 283 aa  216  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  45.59 
 
 		 284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  41.28 
 
 		 283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2130  pantoate--beta-alanine ligase  43.17 
 
 		 286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>