More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00689 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00689  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 280 aa  573  1.0000000000000001e-163  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.591476  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0174  pantoate--beta-alanine ligase  72.95 
 
 		 281 aa  415  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  71.17 
 
 		 279 aa  413  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0198  pantoate--beta-alanine ligase  72.6 
 
 		 281 aa  413  1e-114  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.795684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  50.88 
 
 		 283 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  51.09 
 
 		 283 aa  259  4e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  51.24 
 
 		 283 aa  258  9e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  51.11 
 
 		 281 aa  257  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  48.01 
 
 		 281 aa  256  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  48.93 
 
 		 283 aa  255  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  50.88 
 
 		 283 aa  255  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  52.9 
 
 		 290 aa  252  6e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  52.16 
 
 		 290 aa  252  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  50.54 
 
 		 287 aa  251  7e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  48.36 
 
 		 283 aa  251  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  48.57 
 
 		 286 aa  249  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  51.28 
 
 		 288 aa  249  4e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  50.18 
 
 		 286 aa  249  5e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  51.09 
 
 		 281 aa  248  6e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 283 aa  248  7e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  50.74 
 
 		 281 aa  248  8e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  51.48 
 
 		 281 aa  248  8e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  46.83 
 
 		 288 aa  247  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3186  pantoate--beta-alanine ligase  51.09 
 
 		 274 aa  248  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.722916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  50.74 
 
 		 281 aa  247  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  46.76 
 
 		 281 aa  247  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 285 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  51.8 
 
 		 282 aa  247  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 285 aa  246  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  51.11 
 
 		 281 aa  246  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 287 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  46.93 
 
 		 283 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  46.59 
 
 		 282 aa  245  6e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  50.35 
 
 		 287 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4085  pantoate--beta-alanine ligase  53.99 
 
 		 282 aa  244  9e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0133419 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  49.08 
 
 		 283 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  49.08 
 
 		 283 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  49.08 
 
 		 283 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  51.43 
 
 		 285 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  48.76 
 
 		 300 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  48.52 
 
 		 284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  49.65 
 
 		 287 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  48.52 
 
 		 284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 285 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  49.26 
 
 		 281 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  48.76 
 
 		 301 aa  243  3e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  47.48 
 
 		 282 aa  243  3e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  48.89 
 
 		 281 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  48.03 
 
 		 286 aa  242  5e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  47.14 
 
 		 298 aa  242  5e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  48.71 
 
 		 283 aa  242  6e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  48.71 
 
 		 283 aa  242  6e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  44.64 
 
 		 283 aa  242  6e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  48.71 
 
 		 283 aa  242  6e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  48.71 
 
 		 283 aa  242  6e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  48.71 
 
 		 283 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  48.71 
 
 		 283 aa  241  7.999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2130  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 286 aa  241  1e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332887 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  47.43 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  48.52 
 
 		 281 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  47.43 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0555  pantoate--beta-alanine ligase  49.65 
 
 		 278 aa  240  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  48.52 
 
 		 281 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  48.76 
 
 		 293 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  48.4 
 
 		 285 aa  239  4e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  46.79 
 
 		 286 aa  239  4e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3175  pantoate--beta-alanine ligase  47.29 
 
 		 281 aa  239  4e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 279 aa  239  5e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0117  pantoate--beta-alanine ligase  48.38 
 
 		 288 aa  238  8e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  46.69 
 
 		 284 aa  237  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  47.04 
 
 		 284 aa  237  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  46.62 
 
 		 284 aa  237  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  47.06 
 
 		 284 aa  236  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2387  pantoate--beta-alanine ligase  48.1 
 
 		 283 aa  236  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513339 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  47.16 
 
 		 283 aa  236  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  47.27 
 
 		 287 aa  236  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  45.49 
 
 		 284 aa  236  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  46.43 
 
 		 282 aa  236  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  46.13 
 
 		 284 aa  235  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  50.58 
 
 		 284 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  45.32 
 
 		 279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  49.29 
 
 		 288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  45.76 
 
 		 284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  46.13 
 
 		 284 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  45.76 
 
 		 284 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  45.76 
 
 		 284 aa  231  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0126  pantoate--beta-alanine ligase  46.57 
 
 		 287 aa  231  9e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3564  pantoate--beta-alanine ligase  46.55 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1061  pantoate--beta-alanine ligase  44.89 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  47.23 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1721  pantothenate synthetase  48.36 
 
 		 288 aa  231  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.308068  normal  0.216295 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  45.77 
 
 		 276 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  45.79 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0668  pantoate--beta-alanine ligase  47.06 
 
 		 282 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0644  pantoate--beta-alanine ligase  46.37 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1212  pantoate--beta-alanine ligase  45.67 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0119566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  45.71 
 
 		 281 aa  229  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1204  pantoate--beta-alanine ligase  47.55 
 
 		 279 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1049  pantoate--beta-alanine ligase  47.55 
 
 		 279 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2312  pantoate--beta-alanine ligase  47.55 
 
 		 279 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0189212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>