More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0666 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 
282 aa  575  1.0000000000000001e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  64.29 
 
 
286 aa  378  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  62.5 
 
 
287 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  61.43 
 
 
287 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  61.79 
 
 
283 aa  363  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  60.36 
 
 
287 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  61.79 
 
 
283 aa  363  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  60.36 
 
 
287 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  61.79 
 
 
285 aa  358  5e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  59.57 
 
 
283 aa  357  9e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  59.57 
 
 
283 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  57.5 
 
 
283 aa  336  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  56.38 
 
 
282 aa  330  1e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  51.4 
 
 
288 aa  320  1.9999999999999998e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  52.84 
 
 
281 aa  310  2e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1061  pantoate--beta-alanine ligase  51.96 
 
 
284 aa  308  8e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  54.45 
 
 
283 aa  306  3e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  52.14 
 
 
282 aa  300  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  54.61 
 
 
281 aa  299  3e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  53.55 
 
 
281 aa  298  6e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  53.57 
 
 
286 aa  298  9e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  53.93 
 
 
301 aa  298  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  52.86 
 
 
300 aa  298  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  51.79 
 
 
283 aa  296  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  50.35 
 
 
284 aa  296  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  50.88 
 
 
281 aa  296  3e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  53.19 
 
 
281 aa  296  4e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  52.84 
 
 
282 aa  295  6e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  52.98 
 
 
281 aa  295  7e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  52.48 
 
 
281 aa  295  8e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  51.77 
 
 
281 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  52.84 
 
 
281 aa  294  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  51.77 
 
 
281 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  53.36 
 
 
281 aa  291  6e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  52.52 
 
 
281 aa  290  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3175  pantoate--beta-alanine ligase  51.59 
 
 
281 aa  287  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  52.71 
 
 
293 aa  286  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  51.62 
 
 
284 aa  286  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  51.62 
 
 
284 aa  286  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  51.62 
 
 
284 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  51.66 
 
 
298 aa  285  7e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  48.93 
 
 
286 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  49.11 
 
 
283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  51.07 
 
 
284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  53.36 
 
 
284 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  54.28 
 
 
284 aa  280  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  51.99 
 
 
283 aa  278  5e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  51.99 
 
 
283 aa  278  8e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  51.99 
 
 
283 aa  278  8e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  51.99 
 
 
283 aa  278  8e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 
284 aa  278  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  51.99 
 
 
283 aa  278  8e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  51.99 
 
 
283 aa  278  9e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0596  pantoate--beta-alanine ligase  50.89 
 
 
278 aa  278  9e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.242968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 
284 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  51.99 
 
 
283 aa  277  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  51.99 
 
 
283 aa  277  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  51.99 
 
 
283 aa  277  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 
284 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  53.51 
 
 
284 aa  276  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 
284 aa  275  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 
284 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  53.05 
 
 
284 aa  272  5.000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0579  pantoate--beta-alanine ligase  46.93 
 
 
289 aa  270  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0117  pantoate--beta-alanine ligase  50.53 
 
 
288 aa  266  4e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0126  pantoate--beta-alanine ligase  47.92 
 
 
287 aa  265  7e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  46.62 
 
 
282 aa  265  8.999999999999999e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 
284 aa  263  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  49.11 
 
 
286 aa  263  3e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 
284 aa  263  3e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  47.16 
 
 
280 aa  262  4e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  47.7 
 
 
283 aa  261  8.999999999999999e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  49.1 
 
 
283 aa  259  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  50.89 
 
 
290 aa  259  3e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  49.65 
 
 
291 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0231  pantoate--beta-alanine ligase  42.35 
 
 
285 aa  256  2e-67  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  48.39 
 
 
283 aa  256  4e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  48.04 
 
 
281 aa  256  4e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  46.67 
 
 
288 aa  255  7e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2130  pantoate--beta-alanine ligase  49.3 
 
 
286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000332887 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  48.56 
 
 
281 aa  253  3e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3319  pantoate--beta-alanine ligase  49.12 
 
 
286 aa  252  5.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  46.62 
 
 
280 aa  251  8.000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2251  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 
307 aa  251  9.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0878  Pantoate--beta-alanine ligase  51.79 
 
 
286 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2054  pantoate--beta-alanine ligase  48.58 
 
 
283 aa  251  1e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  46.4 
 
 
280 aa  251  1e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  43.93 
 
 
281 aa  251  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  46.26 
 
 
281 aa  251  1e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  47.86 
 
 
283 aa  250  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  48.03 
 
 
285 aa  250  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  46.4 
 
 
280 aa  250  2e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2560  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 
284 aa  246  3e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  49.46 
 
 
291 aa  245  4.9999999999999997e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  48.91 
 
 
285 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  47.31 
 
 
283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  47.37 
 
 
288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  46.76 
 
 
281 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3808  pantoate--beta-alanine ligase  52.59 
 
 
289 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0471604 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  48.91 
 
 
285 aa  243  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>