More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3134 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 282 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  74.02 
 
 		 281 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  70.82 
 
 		 281 aa  431  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  73.4 
 
 		 283 aa  428  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  71.53 
 
 		 281 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  71.17 
 
 		 281 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  70.82 
 
 		 281 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  71.17 
 
 		 281 aa  412  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  71.89 
 
 		 281 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  71.53 
 
 		 281 aa  411  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  70.71 
 
 		 281 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  71.53 
 
 		 281 aa  412  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  70.46 
 
 		 281 aa  407  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  72.24 
 
 		 281 aa  408  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  66.55 
 
 		 284 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3175  pantoate--beta-alanine ligase  69.75 
 
 		 281 aa  389  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  59.03 
 
 		 288 aa  342  4e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  58.06 
 
 		 283 aa  330  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  58.63 
 
 		 287 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  57.19 
 
 		 286 aa  329  4e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  58.3 
 
 		 285 aa  328  7e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  58.63 
 
 		 287 aa  328  7e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  57.91 
 
 		 287 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  57.91 
 
 		 287 aa  326  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  57.35 
 
 		 283 aa  326  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  57.45 
 
 		 283 aa  325  6e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  58.84 
 
 		 300 aa  325  6e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  58.84 
 
 		 293 aa  322  5e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  55.67 
 
 		 282 aa  319  3e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  55.12 
 
 		 283 aa  317  9e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  56.12 
 
 		 283 aa  317  2e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  56.32 
 
 		 301 aa  316  3e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  55.12 
 
 		 283 aa  315  5e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  52.84 
 
 		 282 aa  311  5.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  52.88 
 
 		 283 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  51.45 
 
 		 298 aa  298  5e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  50.9 
 
 		 284 aa  298  7e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  53.36 
 
 		 284 aa  297  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  53.43 
 
 		 284 aa  296  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  53.43 
 
 		 284 aa  296  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  53.07 
 
 		 284 aa  295  4e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  56.03 
 
 		 284 aa  293  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  52.99 
 
 		 284 aa  293  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  56.11 
 
 		 286 aa  291  7e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1061  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 284 aa  291  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  52.24 
 
 		 284 aa  289  3e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 282 aa  285  8e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  50.54 
 
 		 284 aa  284  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 283 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 283 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 283 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 283 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 284 aa  281  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 283 aa  281  7.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 283 aa  281  7.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  50.18 
 
 		 283 aa  281  7.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 283 aa  281  7.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 283 aa  281  9e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 284 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0579  pantoate--beta-alanine ligase  51.49 
 
 		 289 aa  281  1e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 284 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 284 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 		 284 aa  279  5e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0596  pantoate--beta-alanine ligase  52.35 
 
 		 278 aa  276  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.242968 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  49.47 
 
 		 286 aa  277  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  47.84 
 
 		 286 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  51.99 
 
 		 279 aa  270  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  50.55 
 
 		 285 aa  267  2e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0878  Pantoate--beta-alanine ligase  51.96 
 
 		 286 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  47.89 
 
 		 283 aa  265  5e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3186  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 		 274 aa  263  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.722916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2042  pantoate/beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 293 aa  263  3e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00689  pantoate--beta-alanine ligase  51.8 
 
 		 280 aa  263  3e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.591476  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2054  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 283 aa  262  4.999999999999999e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0174  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 281 aa  262  4.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0198  pantoate--beta-alanine ligase  50.35 
 
 		 281 aa  261  8e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.795684  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  45.52 
 
 		 283 aa  260  1e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  47.35 
 
 		 282 aa  261  1e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3319  pantoate--beta-alanine ligase  50.7 
 
 		 286 aa  260  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0231  pantoate--beta-alanine ligase  43.32 
 
 		 285 aa  260  2e-68  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  48.55 
 
 		 290 aa  257  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  50.88 
 
 		 282 aa  256  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0039  pantothenate synthetase  49.82 
 
 		 289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  47.48 
 
 		 284 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  46.1 
 
 		 282 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  46.45 
 
 		 283 aa  251  7e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  47.1 
 
 		 281 aa  250  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  47.12 
 
 		 282 aa  249  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  48.57 
 
 		 283 aa  249  5e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2130  pantoate--beta-alanine ligase  50.19 
 
 		 286 aa  246  3e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332887 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  45.16 
 
 		 283 aa  246  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  48.39 
 
 		 291 aa  246  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  44.68 
 
 		 282 aa  244  8e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  45.68 
 
 		 284 aa  244  9e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  44.68 
 
 		 281 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  45.71 
 
 		 283 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1396  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 288 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.262573  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  46.15 
 
 		 285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  45.94 
 
 		 289 aa  243  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>