More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2791 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 288 aa  575  1.0000000000000001e-163  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  58.93 
 
 		 290 aa  328  6e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  60.52 
 
 		 290 aa  304  9.000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2560  pantoate--beta-alanine ligase  56.94 
 
 		 284 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1396  pantoate--beta-alanine ligase  58.3 
 
 		 288 aa  293  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.262573  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3149  pantoate--beta-alanine ligase  56.58 
 
 		 290 aa  291  7e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3564  pantoate--beta-alanine ligase  56.27 
 
 		 283 aa  291  7e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4783  pantoate--beta-alanine ligase  56.27 
 
 		 283 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3063  pantoate--beta-alanine ligase  56.63 
 
 		 283 aa  288  6e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  57.55 
 
 		 282 aa  286  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  53.9 
 
 		 284 aa  280  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3439  pantoate--beta-alanine ligase  52.33 
 
 		 280 aa  276  3e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2251  pantoate--beta-alanine ligase  53.05 
 
 		 307 aa  273  3e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  55.83 
 
 		 279 aa  273  3e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1721  pantothenate synthetase  52.46 
 
 		 288 aa  271  9e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.308068  normal  0.216295 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2388  pantoate--beta-alanine ligase  57.35 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0472601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3332  pantoate--beta-alanine ligase  54.12 
 
 		 311 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2495  pantoate--beta-alanine ligase  53.96 
 
 		 280 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2423  pantoate--beta-alanine ligase  53.41 
 
 		 283 aa  268  8e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  54.61 
 
 		 285 aa  268  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1702  pantoate--beta-alanine ligase  55.98 
 
 		 283 aa  265  7e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.238045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3319  pantoate--beta-alanine ligase  54.87 
 
 		 286 aa  264  1e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  53.38 
 
 		 287 aa  264  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  53.51 
 
 		 285 aa  263  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  52.77 
 
 		 285 aa  259  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1757  pantoate--beta-alanine ligase  54.48 
 
 		 279 aa  258  6e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0403  pantoate--beta-alanine ligase  54.12 
 
 		 279 aa  258  7e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  50.36 
 
 		 281 aa  256  3e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  50.73 
 
 		 281 aa  256  4e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4542  pantoate--beta-alanine ligase  52.19 
 
 		 285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4085  pantoate--beta-alanine ligase  53.51 
 
 		 282 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0133419 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 286 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0198  pantoate--beta-alanine ligase  52.77 
 
 		 281 aa  251  9.000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.795684  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 282 aa  250  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00689  pantoate--beta-alanine ligase  51.28 
 
 		 280 aa  249  4e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.591476  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0174  pantoate--beta-alanine ligase  52.4 
 
 		 281 aa  249  5e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  47.31 
 
 		 283 aa  247  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  50.55 
 
 		 281 aa  246  4e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  50.54 
 
 		 283 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 281 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  48.54 
 
 		 284 aa  243  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  49.46 
 
 		 283 aa  241  9e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  49.46 
 
 		 283 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1658  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 282 aa  241  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.752293 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  47.16 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  49.46 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0555  pantoate--beta-alanine ligase  51.25 
 
 		 278 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  48.74 
 
 		 283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  46.76 
 
 		 281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  50.92 
 
 		 281 aa  239  4e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  49.81 
 
 		 282 aa  239  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  48.54 
 
 		 284 aa  238  5.999999999999999e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  49.63 
 
 		 281 aa  238  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  49.1 
 
 		 285 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  46.52 
 
 		 281 aa  237  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  49.28 
 
 		 288 aa  237  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  48.56 
 
 		 287 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0787  pantoate--beta-alanine ligase  47.23 
 
 		 283 aa  236  3e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.232916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  48.9 
 
 		 281 aa  236  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  48.54 
 
 		 284 aa  235  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  47.29 
 
 		 283 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  48.54 
 
 		 284 aa  235  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  49.45 
 
 		 283 aa  235  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  46.43 
 
 		 281 aa  235  6e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  48.2 
 
 		 287 aa  235  7e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  48.34 
 
 		 283 aa  235  7e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  48.56 
 
 		 287 aa  235  8e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  48.53 
 
 		 281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1498  pantoate--beta-alanine ligase  48.36 
 
 		 281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00126611  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  49.64 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  48.53 
 
 		 281 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2942  pantoate--beta-alanine ligase  47.23 
 
 		 283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17212 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  48.16 
 
 		 281 aa  233  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  48.53 
 
 		 281 aa  232  6e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  44.77 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  48.3 
 
 		 273 aa  230  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  48.59 
 
 		 288 aa  230  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  48.16 
 
 		 281 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  46.55 
 
 		 283 aa  229  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  42.5 
 
 		 280 aa  229  4e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 282 aa  229  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  49.26 
 
 		 279 aa  229  6e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  47.81 
 
 		 284 aa  228  9e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  43.73 
 
 		 282 aa  228  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  46.79 
 
 		 281 aa  228  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  45.56 
 
 		 284 aa  227  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  49.43 
 
 		 284 aa  227  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  44.68 
 
 		 282 aa  227  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  48.74 
 
 		 278 aa  226  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  50.54 
 
 		 289 aa  226  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  46.48 
 
 		 282 aa  226  3e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  46.48 
 
 		 289 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  48.16 
 
 		 285 aa  225  5.0000000000000005e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  46.43 
 
 		 287 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  46.79 
 
 		 280 aa  225  6e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  46.79 
 
 		 280 aa  225  6e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  47.97 
 
 		 283 aa  225  7e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  45.76 
 
 		 281 aa  225  7e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  47.81 
 
 		 283 aa  225  8e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>