More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3332 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3332  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 311 aa  621  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3564  pantoate--beta-alanine ligase  74.56 
 
 		 283 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3063  pantoate--beta-alanine ligase  72.79 
 
 		 283 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2423  pantoate--beta-alanine ligase  71.38 
 
 		 283 aa  420  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4783  pantoate--beta-alanine ligase  71.02 
 
 		 283 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2388  pantoate--beta-alanine ligase  74.91 
 
 		 283 aa  407  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0472601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1702  pantoate--beta-alanine ligase  68.9 
 
 		 283 aa  378  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.238045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  57.19 
 
 		 287 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4542  pantoate--beta-alanine ligase  53.5 
 
 		 285 aa  291  9e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  53.79 
 
 		 284 aa  290  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  54.12 
 
 		 288 aa  270  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  48.44 
 
 		 290 aa  258  8e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  51.76 
 
 		 285 aa  253  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  52.63 
 
 		 285 aa  253  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 286 aa  250  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  51.77 
 
 		 282 aa  250  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  52.28 
 
 		 285 aa  251  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  52.5 
 
 		 279 aa  248  8e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1721  pantothenate synthetase  49.64 
 
 		 288 aa  247  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.308068  normal  0.216295 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3319  pantoate--beta-alanine ligase  50.53 
 
 		 286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  47.46 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  48.19 
 
 		 283 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3149  pantoate--beta-alanine ligase  47.92 
 
 		 290 aa  239  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4085  pantoate--beta-alanine ligase  53.09 
 
 		 282 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0133419 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  50.72 
 
 		 290 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  50.52 
 
 		 287 aa  237  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3175  pantoate--beta-alanine ligase  47.62 
 
 		 281 aa  235  9e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  43.59 
 
 		 284 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0555  pantoate--beta-alanine ligase  51.25 
 
 		 278 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  42.29 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  50.57 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1396  pantoate--beta-alanine ligase  48.92 
 
 		 288 aa  229  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.262573  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2251  pantoate--beta-alanine ligase  47.67 
 
 		 307 aa  229  3e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  47.46 
 
 		 287 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  44.64 
 
 		 283 aa  229  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  44.64 
 
 		 283 aa  229  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  44.29 
 
 		 283 aa  229  5e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  47.1 
 
 		 287 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  44.29 
 
 		 283 aa  228  9e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  44.29 
 
 		 283 aa  228  9e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  44.29 
 
 		 283 aa  228  9e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  47.83 
 
 		 287 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  44.48 
 
 		 282 aa  228  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  43.93 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  43.93 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  43.93 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0632  pantoate/beta-alanine ligase  51.56 
 
 		 276 aa  226  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  44.8 
 
 		 291 aa  226  5.0000000000000005e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  46.76 
 
 		 287 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  41.37 
 
 		 281 aa  224  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  44.4 
 
 		 280 aa  224  1e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  44.96 
 
 		 281 aa  223  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  44.4 
 
 		 280 aa  224  2e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  43.26 
 
 		 283 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2560  pantoate--beta-alanine ligase  47.12 
 
 		 284 aa  223  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  47.4 
 
 		 334 aa  223  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  42.7 
 
 		 281 aa  223  4e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  44.61 
 
 		 281 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  44.61 
 
 		 281 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  44.29 
 
 		 284 aa  222  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  44.29 
 
 		 284 aa  222  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  46.76 
 
 		 285 aa  222  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  44.68 
 
 		 283 aa  222  6e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  46.04 
 
 		 283 aa  222  6e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  44.61 
 
 		 281 aa  222  7e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  46.52 
 
 		 279 aa  222  7e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  46.86 
 
 		 283 aa  222  8e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  42.25 
 
 		 282 aa  221  9e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  44.61 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  45.49 
 
 		 280 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  40.91 
 
 		 279 aa  221  9.999999999999999e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  46.29 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  44.93 
 
 		 286 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  43.93 
 
 		 284 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0507  pantoate--beta-alanine ligase  44.81 
 
 		 288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0090  pantoate/beta-alanine ligase  49.26 
 
 		 273 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9160  Pantoate--beta-alanine ligase  49.81 
 
 		 285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  46.04 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  48.11 
 
 		 283 aa  219  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  42.76 
 
 		 288 aa  220  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  44.24 
 
 		 281 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  44.98 
 
 		 281 aa  220  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  44.98 
 
 		 281 aa  219  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0567  pantoate/beta-alanine ligase  46.6 
 
 		 308 aa  219  5e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  45.96 
 
 		 281 aa  219  6e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  44.61 
 
 		 281 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0600  pantoate--beta-alanine ligase  45.09 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  40.29 
 
 		 281 aa  218  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  43.37 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  41.43 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  41.43 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  45.35 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  44.52 
 
 		 289 aa  217  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  41.43 
 
 		 284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  41.58 
 
 		 283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1212  pantoate--beta-alanine ligase  41.46 
 
 		 283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0119566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  44.6 
 
 		 282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  41.43 
 
 		 284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2884  pantothenate synthetase  47.39 
 
 		 296 aa  216  4e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  42.96 
 
 		 282 aa  216  4e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>