More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3319 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3319  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 286 aa  577  1e-164  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  61.27 
 
 		 279 aa  308  5.9999999999999995e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  59.65 
 
 		 282 aa  305  4.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  57.04 
 
 		 290 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  53 
 
 		 281 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  54.74 
 
 		 290 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  53 
 
 		 281 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  52.96 
 
 		 281 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  52.96 
 
 		 281 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  47.18 
 
 		 282 aa  272  4.0000000000000004e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  54.87 
 
 		 288 aa  270  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  52.46 
 
 		 283 aa  268  7e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  51.25 
 
 		 283 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2251  pantoate--beta-alanine ligase  50.7 
 
 		 307 aa  265  8.999999999999999e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  53.55 
 
 		 285 aa  264  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  48.42 
 
 		 283 aa  263  3e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  52.48 
 
 		 285 aa  262  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  51.24 
 
 		 281 aa  262  4e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  52.11 
 
 		 287 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  51.93 
 
 		 287 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  51.24 
 
 		 281 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  50.88 
 
 		 283 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  52.3 
 
 		 281 aa  261  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  52.48 
 
 		 285 aa  261  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  48.06 
 
 		 281 aa  261  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  51.59 
 
 		 281 aa  261  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  51.41 
 
 		 287 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  50.88 
 
 		 281 aa  260  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  51.76 
 
 		 287 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  50.88 
 
 		 283 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  50.88 
 
 		 283 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  46.48 
 
 		 281 aa  258  5.0000000000000005e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0039  pantothenate synthetase  50.92 
 
 		 289 aa  258  7e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  51.94 
 
 		 281 aa  258  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  49.12 
 
 		 282 aa  257  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 283 aa  257  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  48.73 
 
 		 281 aa  256  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3564  pantoate--beta-alanine ligase  51.44 
 
 		 283 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 286 aa  255  7e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  46.15 
 
 		 280 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  51.2 
 
 		 289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0555  pantoate--beta-alanine ligase  54.74 
 
 		 278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  47.35 
 
 		 284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  45.26 
 
 		 280 aa  253  3e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  48.95 
 
 		 282 aa  253  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3439  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 280 aa  253  3e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  46.26 
 
 		 281 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  48.61 
 
 		 284 aa  252  5.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4783  pantoate--beta-alanine ligase  51.08 
 
 		 283 aa  252  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  49.12 
 
 		 281 aa  252  6e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1396  pantoate--beta-alanine ligase  52.3 
 
 		 288 aa  251  7e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.262573  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3063  pantoate--beta-alanine ligase  50.72 
 
 		 283 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2560  pantoate--beta-alanine ligase  51.99 
 
 		 284 aa  251  9.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  48.25 
 
 		 283 aa  251  9.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  50.35 
 
 		 285 aa  251  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  46.32 
 
 		 282 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  44.79 
 
 		 283 aa  250  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0403  pantoate--beta-alanine ligase  54.91 
 
 		 279 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  50.52 
 
 		 288 aa  248  6e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3332  pantoate--beta-alanine ligase  50.53 
 
 		 311 aa  248  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  45.04 
 
 		 283 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  45.23 
 
 		 280 aa  246  2e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  53.79 
 
 		 287 aa  247  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  50.7 
 
 		 282 aa  246  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3149  pantoate--beta-alanine ligase  49.13 
 
 		 290 aa  246  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 283 aa  246  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  44.91 
 
 		 280 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  44.91 
 
 		 280 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2423  pantoate--beta-alanine ligase  50.72 
 
 		 283 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  45.55 
 
 		 281 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2495  pantoate--beta-alanine ligase  53.09 
 
 		 280 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1757  pantoate--beta-alanine ligase  53.45 
 
 		 279 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  49.45 
 
 		 287 aa  243  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  42.66 
 
 		 279 aa  243  3.9999999999999997e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  47.04 
 
 		 283 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  46.81 
 
 		 283 aa  241  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  48.77 
 
 		 301 aa  241  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1702  pantoate--beta-alanine ligase  51.15 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.238045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1658  pantoate--beta-alanine ligase  51.43 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.752293 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4085  pantoate--beta-alanine ligase  52.3 
 
 		 282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0133419 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  48.42 
 
 		 300 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 288 aa  239  5e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  49.3 
 
 		 296 aa  239  5e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  45.64 
 
 		 283 aa  238  8e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  46.34 
 
 		 283 aa  238  9e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2388  pantoate--beta-alanine ligase  51.15 
 
 		 283 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0472601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  46.47 
 
 		 273 aa  235  6e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  45.36 
 
 		 288 aa  235  7e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3175  pantoate--beta-alanine ligase  47.7 
 
 		 281 aa  234  8e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  46.81 
 
 		 291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  44.56 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  51.32 
 
 		 294 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  44.88 
 
 		 282 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  47.64 
 
 		 284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  48.94 
 
 		 293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1721  pantothenate synthetase  48.03 
 
 		 288 aa  233  3e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.308068  normal  0.216295 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  48.09 
 
 		 279 aa  232  6e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  45.77 
 
 		 281 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  47 
 
 		 286 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  47.33 
 
 		 279 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>