More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2251 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2251  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 307 aa  615  1e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2560  pantoate--beta-alanine ligase  63.8 
 
 		 284 aa  340  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2495  pantoate--beta-alanine ligase  59.71 
 
 		 280 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0403  pantoate--beta-alanine ligase  58.27 
 
 		 279 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1757  pantoate--beta-alanine ligase  57.91 
 
 		 279 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3439  pantoate--beta-alanine ligase  54.32 
 
 		 280 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1658  pantoate--beta-alanine ligase  56.99 
 
 		 282 aa  277  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.752293 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  53.05 
 
 		 288 aa  273  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  52.16 
 
 		 281 aa  271  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  52.88 
 
 		 290 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  55.9 
 
 		 282 aa  269  5e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1396  pantoate--beta-alanine ligase  53.47 
 
 		 288 aa  264  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.262573  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3319  pantoate--beta-alanine ligase  50.7 
 
 		 286 aa  259  4e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3149  pantoate--beta-alanine ligase  50.53 
 
 		 290 aa  258  7e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  50.34 
 
 		 290 aa  257  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 282 aa  251  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2314  pantoate/beta-alanine ligase  51.96 
 
 		 284 aa  249  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000496833  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  48.4 
 
 		 284 aa  246  4.9999999999999997e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  48.2 
 
 		 281 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  46.43 
 
 		 281 aa  243  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  48.61 
 
 		 285 aa  241  9e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3564  pantoate--beta-alanine ligase  47.16 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  45.39 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  43.82 
 
 		 281 aa  240  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  48.03 
 
 		 283 aa  239  4e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  49.65 
 
 		 287 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  49.12 
 
 		 283 aa  238  5.999999999999999e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  49.27 
 
 		 281 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  47.84 
 
 		 281 aa  238  8e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2388  pantoate--beta-alanine ligase  53.67 
 
 		 283 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0472601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  50.91 
 
 		 285 aa  237  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  48.96 
 
 		 287 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  49.29 
 
 		 279 aa  237  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  48.54 
 
 		 281 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  48.24 
 
 		 287 aa  237  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  48.96 
 
 		 287 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  48.54 
 
 		 281 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  48.54 
 
 		 281 aa  235  6e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  47.86 
 
 		 286 aa  235  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  48.54 
 
 		 281 aa  235  6e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 281 aa  235  9e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  48.18 
 
 		 281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  49.09 
 
 		 285 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3063  pantoate--beta-alanine ligase  48.23 
 
 		 283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  40.85 
 
 		 282 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  49.45 
 
 		 282 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0555  pantoate--beta-alanine ligase  52.48 
 
 		 278 aa  232  5e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  47.14 
 
 		 283 aa  232  6e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  44.88 
 
 		 282 aa  232  6e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  47.81 
 
 		 281 aa  231  9e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  47.57 
 
 		 287 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  47.37 
 
 		 288 aa  231  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2423  pantoate--beta-alanine ligase  48.03 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  47.87 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  46.55 
 
 		 280 aa  230  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3332  pantoate--beta-alanine ligase  47.67 
 
 		 311 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  47.45 
 
 		 281 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  46.78 
 
 		 291 aa  229  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  43.51 
 
 		 283 aa  229  5e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  42.65 
 
 		 283 aa  229  5e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  45.32 
 
 		 284 aa  229  5e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4783  pantoate--beta-alanine ligase  48.21 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1644  pantoate/beta-alanine ligase  52.03 
 
 		 295 aa  228  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.742057  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  41.99 
 
 		 280 aa  227  2e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  47.14 
 
 		 282 aa  227  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  46.43 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  43.17 
 
 		 283 aa  226  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  47.52 
 
 		 283 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  46.4 
 
 		 300 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1721  pantothenate synthetase  47.45 
 
 		 288 aa  225  7e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.308068  normal  0.216295 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  46.64 
 
 		 284 aa  225  7e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  43.84 
 
 		 279 aa  225  8e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  41.79 
 
 		 281 aa  225  9e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  44.4 
 
 		 284 aa  225  9e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  46.53 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  48.41 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3175  pantoate--beta-alanine ligase  45.62 
 
 		 281 aa  224  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0476  pantoate--beta-alanine ligase  44.8 
 
 		 281 aa  224  1e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4542  pantoate--beta-alanine ligase  46.64 
 
 		 285 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  49.29 
 
 		 278 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  42.4 
 
 		 281 aa  223  3e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0134  pantoate/beta-alanine ligase  41.9 
 
 		 279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  45.45 
 
 		 283 aa  222  6e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  43.6 
 
 		 288 aa  222  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  43.16 
 
 		 279 aa  222  6e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  46.64 
 
 		 284 aa  221  9e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  48.21 
 
 		 278 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  43.26 
 
 		 282 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  42.09 
 
 		 280 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  41.13 
 
 		 282 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1702  pantoate--beta-alanine ligase  49.03 
 
 		 283 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.238045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  50.19 
 
 		 287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  42.09 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  41.34 
 
 		 539 aa  220  3e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  47.84 
 
 		 288 aa  220  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  44.72 
 
 		 286 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  44.96 
 
 		 283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4557  pantoate/beta-alanine ligase  45.14 
 
 		 280 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.146553  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  44.6 
 
 		 289 aa  219  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>