More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4683 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 
300 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  85.44 
 
 
309 aa  518  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  70 
 
 
291 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  65.95 
 
 
289 aa  386  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  64.64 
 
 
293 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  64.29 
 
 
293 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  65 
 
 
289 aa  374  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  53.76 
 
 
281 aa  296  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  50.9 
 
 
281 aa  291  8e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  52.33 
 
 
282 aa  288  6e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  48.75 
 
 
281 aa  287  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  48.94 
 
 
283 aa  287  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  51.06 
 
 
283 aa  281  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  48.93 
 
 
282 aa  280  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  48.39 
 
 
280 aa  278  8e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  48.39 
 
 
280 aa  278  1e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  46.57 
 
 
280 aa  276  2e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  50.9 
 
 
278 aa  277  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  51.81 
 
 
288 aa  276  3e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  49.29 
 
 
276 aa  275  5e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  51.61 
 
 
278 aa  275  6e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  48.39 
 
 
280 aa  275  9e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 
282 aa  270  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  48.55 
 
 
281 aa  270  2.9999999999999997e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  46.74 
 
 
281 aa  267  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0117  pantoate/beta-alanine ligase  49.29 
 
 
279 aa  267  2e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  50.88 
 
 
288 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  47.86 
 
 
291 aa  261  8e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  45.65 
 
 
282 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  53.31 
 
 
277 aa  261  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 
281 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.29 
 
 
529 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0476  pantoate--beta-alanine ligase  47.33 
 
 
281 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 
283 aa  258  7e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  51.67 
 
 
281 aa  257  1e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  48.01 
 
 
277 aa  256  3e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  47.5 
 
 
280 aa  255  7e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 
283 aa  255  8e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  44.48 
 
 
282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 
283 aa  253  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  50.59 
 
 
268 aa  252  6e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  43.21 
 
 
282 aa  251  1e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 
280 aa  250  2e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0320  pantoate--beta-alanine ligase  43.77 
 
 
282 aa  251  2e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  46.07 
 
 
289 aa  250  2e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  43.37 
 
 
284 aa  250  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  45.39 
 
 
283 aa  249  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  48.75 
 
 
289 aa  249  4e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  45.16 
 
 
282 aa  249  6e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2151  pantoate--beta-alanine ligase  42.61 
 
 
286 aa  249  6e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1423  pantoate--beta-alanine ligase  44.57 
 
 
282 aa  247  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  46.21 
 
 
277 aa  246  3e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1422  pantoate--beta-alanine ligase  44.57 
 
 
282 aa  246  4e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1634  pantoate--beta-alanine ligase  44.57 
 
 
282 aa  246  4e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0402516 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  48.94 
 
 
287 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  51.45 
 
 
296 aa  245  6.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1669  pantoate--beta-alanine ligase  44.2 
 
 
282 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1450  pantoate--beta-alanine ligase  44.2 
 
 
282 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1563  pantoate--beta-alanine ligase  44.2 
 
 
282 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.371985  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0231  pantoate--beta-alanine ligase  43.88 
 
 
285 aa  244  9.999999999999999e-64  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2942  pantoate--beta-alanine ligase  45.55 
 
 
283 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17212 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  45.2 
 
 
284 aa  244  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1683  pantoate--beta-alanine ligase  46.76 
 
 
287 aa  243  3e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.708165  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  47.69 
 
 
282 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1707  pantoate--beta-alanine ligase  43.84 
 
 
282 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  44.64 
 
 
283 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  48.92 
 
 
287 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  48.19 
 
 
279 aa  241  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  47.48 
 
 
283 aa  240  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  48.92 
 
 
287 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2286  pantoate--beta-alanine ligase  46.93 
 
 
282 aa  240  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000010295  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0502  pantoate--beta-alanine ligase  44.71 
 
 
300 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  45.74 
 
 
293 aa  240  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  46.4 
 
 
282 aa  240  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  48.56 
 
 
287 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  45.32 
 
 
282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2620  pantoate--beta-alanine ligase  43.53 
 
 
283 aa  239  4e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2674  pantoate--beta-alanine ligase  43.53 
 
 
283 aa  239  4e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  47.48 
 
 
286 aa  239  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  46.4 
 
 
283 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3186  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 
274 aa  238  5.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.722916  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0039  pantothenate synthetase  49.81 
 
 
289 aa  238  9e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  47.67 
 
 
283 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1465  pantoate--beta-alanine ligase  43.48 
 
 
282 aa  238  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3749  pantoate--beta-alanine ligase  43.12 
 
 
282 aa  238  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.94763  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  45.68 
 
 
283 aa  238  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2254  pantoate/beta-alanine ligase  44.88 
 
 
289 aa  238  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  44.77 
 
 
282 aa  237  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  45.04 
 
 
300 aa  236  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0101  pantoate--beta-alanine ligase  45.85 
 
 
327 aa  237  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  43.01 
 
 
279 aa  236  3e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.18 
 
 
526 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  46.62 
 
 
539 aa  236  5.0000000000000005e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1596  pantoate--beta-alanine ligase  42.75 
 
 
282 aa  235  6e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0472681  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  46.45 
 
 
285 aa  235  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  45.04 
 
 
301 aa  235  7e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1061  pantoate--beta-alanine ligase  44.24 
 
 
284 aa  235  8e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.75 
 
 
528 aa  235  8e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  46.32 
 
 
284 aa  235  9e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  46.39 
 
 
286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>