More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2423 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2423  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 283 aa  570  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1702  pantoate--beta-alanine ligase  84.45 
 
 		 283 aa  462  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.238045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3564  pantoate--beta-alanine ligase  73.85 
 
 		 283 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3063  pantoate--beta-alanine ligase  73.5 
 
 		 283 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4783  pantoate--beta-alanine ligase  73.14 
 
 		 283 aa  431  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2388  pantoate--beta-alanine ligase  77.03 
 
 		 283 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0472601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3332  pantoate--beta-alanine ligase  71.38 
 
 		 311 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  56.74 
 
 		 287 aa  318  7e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4542  pantoate--beta-alanine ligase  54.9 
 
 		 285 aa  304  9.000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  51.99 
 
 		 284 aa  293  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  52.48 
 
 		 290 aa  277  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  53.41 
 
 		 288 aa  268  8e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  52.28 
 
 		 290 aa  266  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  52.73 
 
 		 285 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  51.81 
 
 		 285 aa  258  8e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1396  pantoate--beta-alanine ligase  51.9 
 
 		 288 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.262573  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  50.91 
 
 		 285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  50.35 
 
 		 282 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4085  pantoate--beta-alanine ligase  55.27 
 
 		 282 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0133419 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  51.79 
 
 		 279 aa  247  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0555  pantoate--beta-alanine ligase  51.08 
 
 		 278 aa  244  8e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3149  pantoate--beta-alanine ligase  49.65 
 
 		 290 aa  242  6e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1721  pantothenate synthetase  48.2 
 
 		 288 aa  241  1e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.308068  normal  0.216295 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  46.74 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  46.74 
 
 		 283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3319  pantoate--beta-alanine ligase  50.72 
 
 		 286 aa  239  4e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  46.38 
 
 		 283 aa  239  5e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  46.38 
 
 		 283 aa  238  8e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  46.38 
 
 		 283 aa  238  8e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  46.38 
 
 		 283 aa  238  8e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  46.38 
 
 		 283 aa  238  9e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  46.38 
 
 		 283 aa  238  9e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  46.38 
 
 		 283 aa  238  9e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  46.18 
 
 		 283 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  46.21 
 
 		 287 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  46.38 
 
 		 280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  46.38 
 
 		 280 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  44.8 
 
 		 284 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  46.57 
 
 		 286 aa  232  5e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  46.18 
 
 		 283 aa  232  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  46.59 
 
 		 281 aa  232  6e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  44.8 
 
 		 284 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2251  pantoate--beta-alanine ligase  48.03 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  44.8 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  44.8 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  43.88 
 
 		 282 aa  230  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  44.8 
 
 		 284 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  47.06 
 
 		 283 aa  229  4e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  48.24 
 
 		 284 aa  229  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  45.45 
 
 		 287 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  46.72 
 
 		 282 aa  229  5e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  46.59 
 
 		 283 aa  229  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  45.82 
 
 		 286 aa  228  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  46.47 
 
 		 284 aa  228  7e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  44.12 
 
 		 279 aa  227  2e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  45.09 
 
 		 287 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  44.98 
 
 		 284 aa  226  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  42.65 
 
 		 283 aa  226  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  45.35 
 
 		 284 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3175  pantoate--beta-alanine ligase  45.82 
 
 		 281 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0632  pantoate/beta-alanine ligase  51.56 
 
 		 276 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  43.07 
 
 		 281 aa  225  6e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0090  pantoate/beta-alanine ligase  52.12 
 
 		 273 aa  225  8e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  43.48 
 
 		 284 aa  225  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  43.48 
 
 		 284 aa  225  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  45.85 
 
 		 285 aa  224  9e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  44.64 
 
 		 288 aa  224  9e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  45.09 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  42.96 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  46.4 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  42.75 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  49.25 
 
 		 279 aa  223  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0198  pantoate--beta-alanine ligase  46.69 
 
 		 281 aa  223  3e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.795684  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2560  pantoate--beta-alanine ligase  47.12 
 
 		 284 aa  222  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  46.4 
 
 		 283 aa  222  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  44.93 
 
 		 282 aa  223  4e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  41.61 
 
 		 281 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  48.11 
 
 		 287 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  42.75 
 
 		 284 aa  222  6e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0126  pantoate--beta-alanine ligase  45.71 
 
 		 287 aa  222  6e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0231  pantoate--beta-alanine ligase  40.5 
 
 		 285 aa  222  6e-57  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  43.12 
 
 		 284 aa  221  8e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  44.89 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  45.56 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0174  pantoate--beta-alanine ligase  46.32 
 
 		 281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0117  pantoate--beta-alanine ligase  44.88 
 
 		 288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00689  pantoate--beta-alanine ligase  45.59 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.591476  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  43.38 
 
 		 281 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  45.35 
 
 		 281 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  43.84 
 
 		 284 aa  219  5e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3439  pantoate--beta-alanine ligase  48.23 
 
 		 280 aa  218  7.999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  44.98 
 
 		 281 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  44.98 
 
 		 281 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  44.98 
 
 		 281 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  44.98 
 
 		 281 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  46.01 
 
 		 281 aa  217  1e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  44.85 
 
 		 281 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  44.98 
 
 		 281 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  41.03 
 
 		 284 aa  217  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  42.7 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>