More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2515 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 285 aa  569  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  97.89 
 
 		 285 aa  557  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  91.9 
 
 		 285 aa  527  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  64.77 
 
 		 290 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1396  pantoate--beta-alanine ligase  65.58 
 
 		 288 aa  330  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.262573  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4085  pantoate--beta-alanine ligase  67.49 
 
 		 282 aa  324  9e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0133419 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  53.65 
 
 		 290 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  54.41 
 
 		 284 aa  280  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  53.9 
 
 		 279 aa  268  7e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  51.07 
 
 		 283 aa  265  5.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  50.18 
 
 		 282 aa  265  8e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  54.41 
 
 		 287 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  53.26 
 
 		 282 aa  264  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  53.51 
 
 		 288 aa  263  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  53.26 
 
 		 283 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4783  pantoate--beta-alanine ligase  51.41 
 
 		 283 aa  261  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  53.26 
 
 		 283 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  52.92 
 
 		 287 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3063  pantoate--beta-alanine ligase  52.73 
 
 		 283 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  52.55 
 
 		 287 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  53.28 
 
 		 287 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3319  pantoate--beta-alanine ligase  52.48 
 
 		 286 aa  260  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0555  pantoate--beta-alanine ligase  57.78 
 
 		 278 aa  259  4e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  50.73 
 
 		 283 aa  257  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  51.09 
 
 		 287 aa  254  9e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3564  pantoate--beta-alanine ligase  50.55 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4542  pantoate--beta-alanine ligase  51.28 
 
 		 285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2423  pantoate--beta-alanine ligase  50.91 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2560  pantoate--beta-alanine ligase  50.55 
 
 		 284 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 286 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  50.72 
 
 		 286 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  45.63 
 
 		 280 aa  251  6e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  49.27 
 
 		 283 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3149  pantoate--beta-alanine ligase  51.45 
 
 		 290 aa  250  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3332  pantoate--beta-alanine ligase  52.28 
 
 		 311 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  47.62 
 
 		 280 aa  249  5e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  44.32 
 
 		 279 aa  248  7e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  47.62 
 
 		 280 aa  248  8e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00689  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 280 aa  248  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.591476  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  47.86 
 
 		 282 aa  246  2e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1702  pantoate--beta-alanine ligase  53.7 
 
 		 283 aa  246  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.238045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  45.82 
 
 		 283 aa  246  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  51.1 
 
 		 286 aa  246  4e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  46.4 
 
 		 283 aa  245  6.999999999999999e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  44.93 
 
 		 283 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2388  pantoate--beta-alanine ligase  52.92 
 
 		 283 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0472601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  50.74 
 
 		 283 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  46.15 
 
 		 281 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  47.1 
 
 		 283 aa  243  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  45.79 
 
 		 283 aa  243  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  45.42 
 
 		 281 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  48.55 
 
 		 279 aa  242  3.9999999999999997e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  47.81 
 
 		 281 aa  242  5e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  46.89 
 
 		 284 aa  242  6e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  46.01 
 
 		 281 aa  241  9e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  43.91 
 
 		 280 aa  240  2e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0231  pantoate--beta-alanine ligase  44.29 
 
 		 285 aa  240  2e-62  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 289 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  42.86 
 
 		 282 aa  239  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  48.53 
 
 		 284 aa  239  5e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  48.73 
 
 		 276 aa  239  5e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  43.73 
 
 		 283 aa  239  5e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  45.74 
 
 		 280 aa  238  1e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  46.35 
 
 		 283 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  48.9 
 
 		 281 aa  237  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  49.28 
 
 		 285 aa  236  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0174  pantoate--beta-alanine ligase  47.62 
 
 		 281 aa  236  4e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  46.13 
 
 		 281 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  46.07 
 
 		 284 aa  235  7e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  46.07 
 
 		 284 aa  235  7e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  42.24 
 
 		 281 aa  235  7e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  47.46 
 
 		 282 aa  234  9e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  46.98 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  45.71 
 
 		 288 aa  234  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  46.69 
 
 		 281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  45.71 
 
 		 284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  46.98 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2251  pantoate--beta-alanine ligase  49.09 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3439  pantoate--beta-alanine ligase  46.38 
 
 		 280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  46.98 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  49.45 
 
 		 281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  46.98 
 
 		 283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  46.98 
 
 		 283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  45.58 
 
 		 284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0198  pantoate--beta-alanine ligase  47.62 
 
 		 281 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.795684  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  46.98 
 
 		 283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  45.96 
 
 		 281 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  46.62 
 
 		 283 aa  232  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  46.83 
 
 		 277 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  45.96 
 
 		 281 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  47.91 
 
 		 284 aa  232  5e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  45.91 
 
 		 288 aa  232  5e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  45.96 
 
 		 281 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  45.96 
 
 		 281 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  46.62 
 
 		 283 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  45.23 
 
 		 284 aa  231  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  47.06 
 
 		 281 aa  231  9e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  46.62 
 
 		 283 aa  231  9e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  47.62 
 
 		 284 aa  231  9e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>