More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0749 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  100 
 
 		 289 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  54.93 
 
 		 280 aa  316  3e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  54.58 
 
 		 280 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  54.39 
 
 		 281 aa  307  1.0000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 283 aa  300  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  51.74 
 
 		 280 aa  298  6e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  50.53 
 
 		 280 aa  295  4e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  52.08 
 
 		 291 aa  292  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  52.98 
 
 		 283 aa  291  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  51.06 
 
 		 283 aa  290  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  51.55 
 
 		 288 aa  290  3e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  51.25 
 
 		 273 aa  287  1e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  53.17 
 
 		 283 aa  285  5.999999999999999e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  47.55 
 
 		 282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 280 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  53.93 
 
 		 288 aa  281  6.000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 		 282 aa  278  8e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  53.5 
 
 		 278 aa  275  6e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 283 aa  275  7e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  48.94 
 
 		 283 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 281 aa  271  8.000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  47.9 
 
 		 281 aa  271  1e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  48.95 
 
 		 282 aa  270  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  48.95 
 
 		 281 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  52.45 
 
 		 278 aa  269  4e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2430  pantoate/beta-alanine ligase  51.23 
 
 		 288 aa  265  5e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 		 283 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  48.58 
 
 		 282 aa  264  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0101  pantoate--beta-alanine ligase  51.9 
 
 		 327 aa  264  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  47.37 
 
 		 282 aa  264  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  47.55 
 
 		 281 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  49.11 
 
 		 279 aa  264  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 279 aa  264  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  46.48 
 
 		 284 aa  263  3e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  47.16 
 
 		 281 aa  262  4e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  44.06 
 
 		 282 aa  259  4e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  43.71 
 
 		 282 aa  258  6e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 283 aa  258  9e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  55.04 
 
 		 277 aa  258  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  49.29 
 
 		 276 aa  256  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0320  pantoate--beta-alanine ligase  43.71 
 
 		 282 aa  255  5e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  48.58 
 
 		 283 aa  255  7e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0117  pantoate/beta-alanine ligase  48.4 
 
 		 279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  52.77 
 
 		 294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.91 
 
 		 526 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3681  pantoate--beta-alanine ligase  52.96 
 
 		 289 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.963286  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  53.87 
 
 		 287 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  50 
 
 		 282 aa  251  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3739  pantoate--beta-alanine ligase  52.96 
 
 		 289 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.28887  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3822  pantoate--beta-alanine ligase  52.96 
 
 		 289 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  49.11 
 
 		 309 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  43.97 
 
 		 279 aa  249  4e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  48.75 
 
 		 300 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  48.94 
 
 		 286 aa  248  7e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3319  pantoate--beta-alanine ligase  51.2 
 
 		 286 aa  248  7e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0507  pantoate--beta-alanine ligase  44.48 
 
 		 288 aa  248  9e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  46.83 
 
 		 277 aa  247  1e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  47.72 
 
 		 283 aa  248  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  47.72 
 
 		 283 aa  248  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  47.72 
 
 		 283 aa  248  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  47.72 
 
 		 283 aa  248  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  47.72 
 
 		 283 aa  247  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  47.18 
 
 		 277 aa  247  2e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  47.37 
 
 		 283 aa  247  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0039  pantothenate synthetase  50.74 
 
 		 289 aa  246  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  47.37 
 
 		 283 aa  246  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3808  pantoate--beta-alanine ligase  51.04 
 
 		 289 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471604 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 		 291 aa  246  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  47.37 
 
 		 283 aa  246  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  47.37 
 
 		 283 aa  246  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2942  pantoate--beta-alanine ligase  46.32 
 
 		 283 aa  246  4e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17212 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0476  pantoate--beta-alanine ligase  47.37 
 
 		 281 aa  246  4e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  46.62 
 
 		 293 aa  245  6e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  49.43 
 
 		 268 aa  244  9e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.11 
 
 		 511 aa  244  9e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  46.62 
 
 		 293 aa  244  9e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2884  pantothenate synthetase  50.7 
 
 		 296 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  47.16 
 
 		 290 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  49.3 
 
 		 287 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9160  Pantoate--beta-alanine ligase  51.53 
 
 		 285 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  47.04 
 
 		 283 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2151  pantoate--beta-alanine ligase  43.46 
 
 		 286 aa  242  6e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  50.53 
 
 		 285 aa  242  6e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  45.39 
 
 		 289 aa  242  6e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  45.74 
 
 		 282 aa  241  7e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  47.24 
 
 		 283 aa  241  7.999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.73 
 
 		 511 aa  241  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  46.98 
 
 		 289 aa  241  7.999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  47.33 
 
 		 284 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  47.33 
 
 		 284 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  47.54 
 
 		 287 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  47.33 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  47.37 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  48.23 
 
 		 279 aa  240  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  48.07 
 
 		 287 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  48.42 
 
 		 301 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  48.39 
 
 		 284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  47.18 
 
 		 287 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>