More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3439 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3439  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 280 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2560  pantoate--beta-alanine ligase  58.21 
 
 		 284 aa  323  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1658  pantoate--beta-alanine ligase  56.07 
 
 		 282 aa  318  7.999999999999999e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.752293 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0403  pantoate--beta-alanine ligase  57.19 
 
 		 279 aa  308  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2495  pantoate--beta-alanine ligase  58.21 
 
 		 280 aa  308  9e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1757  pantoate--beta-alanine ligase  56.83 
 
 		 279 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  53.62 
 
 		 290 aa  285  7e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2251  pantoate--beta-alanine ligase  54.32 
 
 		 307 aa  283  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  52.33 
 
 		 288 aa  276  3e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1396  pantoate--beta-alanine ligase  50.35 
 
 		 288 aa  263  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.262573  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3149  pantoate--beta-alanine ligase  49.11 
 
 		 290 aa  257  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  49.11 
 
 		 290 aa  249  5e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3319  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 286 aa  248  6e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  47.62 
 
 		 281 aa  246  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  46.89 
 
 		 281 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  46.52 
 
 		 281 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  47.69 
 
 		 281 aa  242  6e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  46.52 
 
 		 281 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  46.52 
 
 		 281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  50 
 
 		 282 aa  238  8e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  44.69 
 
 		 281 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  44.32 
 
 		 281 aa  234  8e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  46.38 
 
 		 285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  46.74 
 
 		 285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  47.1 
 
 		 285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  44.32 
 
 		 281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  43.96 
 
 		 281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1721  pantothenate synthetase  47.04 
 
 		 288 aa  231  7.000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.308068  normal  0.216295 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  43.48 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  45.88 
 
 		 284 aa  230  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  48 
 
 		 282 aa  229  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  44.44 
 
 		 283 aa  229  4e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  46.52 
 
 		 286 aa  228  6e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  48.55 
 
 		 286 aa  228  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4542  pantoate--beta-alanine ligase  44.33 
 
 		 285 aa  226  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2891  pantoate/beta-alanine ligase  48.92 
 
 		 290 aa  227  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150324  normal  0.438724 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  44.13 
 
 		 282 aa  227  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4783  pantoate--beta-alanine ligase  47.72 
 
 		 283 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  46.1 
 
 		 284 aa  225  8e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3564  pantoate--beta-alanine ligase  47.7 
 
 		 283 aa  224  9e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  45.74 
 
 		 284 aa  223  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  45.65 
 
 		 284 aa  224  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  48.35 
 
 		 283 aa  223  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  42.49 
 
 		 284 aa  222  4e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  40.88 
 
 		 281 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2314  pantoate/beta-alanine ligase  47.48 
 
 		 284 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000496833  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  46.76 
 
 		 284 aa  221  8e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3063  pantoate--beta-alanine ligase  47.7 
 
 		 283 aa  221  9e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  45.29 
 
 		 284 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  45.29 
 
 		 284 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  45.59 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  42.18 
 
 		 281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  40.36 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  45.04 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  38.63 
 
 		 282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  45.04 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  45.04 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  42.18 
 
 		 281 aa  219  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  40.44 
 
 		 281 aa  219  3e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  44.57 
 
 		 280 aa  219  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2042  pantoate/beta-alanine ligase  44.41 
 
 		 293 aa  219  3e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2388  pantoate--beta-alanine ligase  49.22 
 
 		 283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0472601  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  44.68 
 
 		 283 aa  219  5e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  44.68 
 
 		 283 aa  219  5e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  44.68 
 
 		 283 aa  219  5e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  45.39 
 
 		 284 aa  218  6e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  43.62 
 
 		 284 aa  218  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2423  pantoate--beta-alanine ligase  48.23 
 
 		 283 aa  218  7.999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  44.33 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  41.97 
 
 		 280 aa  218  1e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  44.33 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  44.33 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  41.97 
 
 		 280 aa  218  1e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  43.62 
 
 		 284 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  43.62 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  46.64 
 
 		 278 aa  217  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  43.62 
 
 		 284 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  48.46 
 
 		 279 aa  216  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  39.71 
 
 		 281 aa  216  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  45.9 
 
 		 296 aa  216  4e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  45.39 
 
 		 284 aa  215  5e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  44.96 
 
 		 287 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  43.62 
 
 		 284 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  40.88 
 
 		 282 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  47.27 
 
 		 277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  44.2 
 
 		 282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  45.35 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  44.49 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3332  pantoate--beta-alanine ligase  46.85 
 
 		 311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  41.52 
 
 		 291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  44.85 
 
 		 301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  43.43 
 
 		 282 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  45.29 
 
 		 283 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  42.45 
 
 		 276 aa  212  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  46.39 
 
 		 284 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  44.6 
 
 		 285 aa  212  7e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  40 
 
 		 281 aa  211  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  41.01 
 
 		 282 aa  211  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  43.22 
 
 		 278 aa  211  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0198  pantoate--beta-alanine ligase  44.69 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.795684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>