More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0901 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 281 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  63.57 
 
 		 282 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  62.63 
 
 		 283 aa  374  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  58.93 
 
 		 281 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  63.67 
 
 		 283 aa  357  9e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  60.22 
 
 		 280 aa  353  2e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  60.22 
 
 		 280 aa  352  2.9999999999999997e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  58.21 
 
 		 281 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  58.57 
 
 		 282 aa  350  2e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  59.86 
 
 		 280 aa  349  3e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  57.14 
 
 		 283 aa  342  5e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  58.42 
 
 		 283 aa  341  8e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  57.45 
 
 		 282 aa  337  9.999999999999999e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  56.43 
 
 		 278 aa  333  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  56.79 
 
 		 281 aa  331  1e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  56.27 
 
 		 282 aa  330  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  58.57 
 
 		 281 aa  328  6e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  55.71 
 
 		 278 aa  326  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  56.64 
 
 		 288 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  58.16 
 
 		 280 aa  321  8e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  53.02 
 
 		 291 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  52.31 
 
 		 282 aa  315  6e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  53.99 
 
 		 283 aa  315  7e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  52.5 
 
 		 276 aa  315  8e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  54.68 
 
 		 280 aa  312  4.999999999999999e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  54.12 
 
 		 279 aa  310  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  55 
 
 		 281 aa  310  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  52.69 
 
 		 277 aa  308  5e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  54.39 
 
 		 289 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  54.12 
 
 		 279 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0502  pantoate--beta-alanine ligase  51.96 
 
 		 300 aa  306  3e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  51.79 
 
 		 282 aa  305  7e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0320  pantoate--beta-alanine ligase  51.79 
 
 		 282 aa  304  1.0000000000000001e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  51.79 
 
 		 282 aa  303  3.0000000000000004e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  55.25 
 
 		 281 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1423  pantoate--beta-alanine ligase  52.67 
 
 		 282 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  51.96 
 
 		 284 aa  302  5.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  53.41 
 
 		 283 aa  301  6.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  52.17 
 
 		 288 aa  301  9e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1422  pantoate--beta-alanine ligase  52.67 
 
 		 282 aa  301  1e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1634  pantoate--beta-alanine ligase  52.67 
 
 		 282 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0402516 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1669  pantoate--beta-alanine ligase  52.67 
 
 		 282 aa  300  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  50.9 
 
 		 277 aa  300  2e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1707  pantoate--beta-alanine ligase  52.31 
 
 		 282 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1450  pantoate--beta-alanine ligase  52.31 
 
 		 282 aa  299  3e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1563  pantoate--beta-alanine ligase  52.31 
 
 		 282 aa  299  3e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.371985  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0101  pantoate--beta-alanine ligase  51.96 
 
 		 327 aa  297  1e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  53.76 
 
 		 300 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0117  pantoate/beta-alanine ligase  56.12 
 
 		 279 aa  296  2e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  54.69 
 
 		 268 aa  295  5e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1596  pantoate--beta-alanine ligase  50.89 
 
 		 282 aa  295  6e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0472681  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3749  pantoate--beta-alanine ligase  50.89 
 
 		 282 aa  294  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.94763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  53.7 
 
 		 277 aa  291  7e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  51.43 
 
 		 289 aa  289  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1263  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 282 aa  289  3e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.933341  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  51.35 
 
 		 273 aa  289  3e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1465  pantoate--beta-alanine ligase  51.62 
 
 		 282 aa  289  3e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  50.9 
 
 		 283 aa  288  5.0000000000000004e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  51.07 
 
 		 291 aa  288  5.0000000000000004e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  48.21 
 
 		 289 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  51.07 
 
 		 309 aa  285  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2620  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 283 aa  283  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2674  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 283 aa  283  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 289 aa  283  3.0000000000000004e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2151  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 286 aa  280  2e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  48.57 
 
 		 293 aa  278  7e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1683  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 287 aa  278  8e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.708165  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  48.57 
 
 		 293 aa  277  1e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3808  pantoate--beta-alanine ligase  49.83 
 
 		 289 aa  276  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471604 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  49.1 
 
 		 279 aa  276  3e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  49.43 
 
 		 539 aa  275  7e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  49.06 
 
 		 534 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  48.93 
 
 		 280 aa  272  4.0000000000000004e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  51.25 
 
 		 296 aa  271  6e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.26 
 
 		 529 aa  271  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0476  pantoate--beta-alanine ligase  46.98 
 
 		 281 aa  271  1e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1498  pantoate--beta-alanine ligase  45.36 
 
 		 281 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00126611  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2891  pantoate/beta-alanine ligase  48.39 
 
 		 290 aa  267  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150324  normal  0.438724 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.92 
 
 		 527 aa  266  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2942  pantoate--beta-alanine ligase  48.45 
 
 		 283 aa  266  4e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17212 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2254  pantoate/beta-alanine ligase  47.67 
 
 		 289 aa  265  8e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2314  pantoate/beta-alanine ligase  49.65 
 
 		 284 aa  264  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000496833  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3739  pantoate--beta-alanine ligase  50.35 
 
 		 289 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.28887  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3822  pantoate--beta-alanine ligase  50.35 
 
 		 289 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3681  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 289 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.963286  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  48.43 
 
 		 285 aa  262  4e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0787  pantoate--beta-alanine ligase  47.62 
 
 		 283 aa  262  6e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.232916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  47.16 
 
 		 290 aa  261  6.999999999999999e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  45.58 
 
 		 283 aa  260  1e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2469  pantothenate synthetase  46.67 
 
 		 291 aa  260  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163424  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2286  pantoate--beta-alanine ligase  45.91 
 
 		 282 aa  260  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000010295  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  49.03 
 
 		 294 aa  260  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.89 
 
 		 511 aa  259  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1634  pantoate--beta-alanine ligase  44.29 
 
 		 283 aa  259  4e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.54 
 
 		 511 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  47.35 
 
 		 283 aa  259  4e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  44.61 
 
 		 282 aa  257  1e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  45.71 
 
 		 282 aa  256  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2430  pantoate/beta-alanine ligase  44.77 
 
 		 288 aa  256  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  47.14 
 
 		 286 aa  256  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>