More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2286 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2286  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 282 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000010295  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2942  pantoate--beta-alanine ligase  61.79 
 
 		 283 aa  358  4e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17212 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0787  pantoate--beta-alanine ligase  60.36 
 
 		 283 aa  356  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.232916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1498  pantoate--beta-alanine ligase  57.5 
 
 		 281 aa  334  7.999999999999999e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00126611  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1683  pantoate--beta-alanine ligase  51.62 
 
 		 287 aa  297  2e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.708165  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  52.99 
 
 		 282 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  45.91 
 
 		 281 aa  260  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  46.59 
 
 		 281 aa  259  3e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  50.18 
 
 		 283 aa  259  3e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  51.67 
 
 		 290 aa  259  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  48.57 
 
 		 283 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 		 283 aa  255  5e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  46.29 
 
 		 281 aa  254  8e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  48.21 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  46.64 
 
 		 281 aa  253  3e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  44.24 
 
 		 280 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  45.36 
 
 		 280 aa  252  6e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  43.57 
 
 		 280 aa  251  8.000000000000001e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  45.36 
 
 		 280 aa  250  1e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  43.11 
 
 		 280 aa  250  2e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  48.01 
 
 		 281 aa  249  5e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  48.94 
 
 		 291 aa  249  5e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  46.48 
 
 		 283 aa  247  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  48.71 
 
 		 282 aa  246  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  51.43 
 
 		 288 aa  247  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0117  pantoate/beta-alanine ligase  46.67 
 
 		 279 aa  246  2e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  47.53 
 
 		 283 aa  246  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0404  pantoate/beta-alanine ligase  47.7 
 
 		 281 aa  246  4e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  43.86 
 
 		 282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  44.68 
 
 		 282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  43.88 
 
 		 281 aa  241  7.999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  46.93 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  39.86 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  47.16 
 
 		 281 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0320  pantoate--beta-alanine ligase  40.21 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  45.77 
 
 		 273 aa  239  4e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  51.35 
 
 		 288 aa  239  4e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  45.55 
 
 		 282 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  39.5 
 
 		 282 aa  238  9e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  50.19 
 
 		 279 aa  236  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1423  pantoate--beta-alanine ligase  43.21 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  49.04 
 
 		 277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1669  pantoate--beta-alanine ligase  43.21 
 
 		 282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  45.82 
 
 		 285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  44.48 
 
 		 276 aa  233  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  46.26 
 
 		 283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1422  pantoate--beta-alanine ligase  43.21 
 
 		 282 aa  233  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1634  pantoate--beta-alanine ligase  43.21 
 
 		 282 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0402516 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  46.55 
 
 		 285 aa  232  5e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1450  pantoate--beta-alanine ligase  42.86 
 
 		 282 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1563  pantoate--beta-alanine ligase  42.86 
 
 		 282 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.371985  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  45.49 
 
 		 309 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  44.84 
 
 		 289 aa  230  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  48.65 
 
 		 279 aa  230  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  45.09 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  43.46 
 
 		 284 aa  230  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1396  pantoate--beta-alanine ligase  48.89 
 
 		 288 aa  229  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.262573  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1465  pantoate--beta-alanine ligase  43.21 
 
 		 282 aa  228  8e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  46.76 
 
 		 289 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1707  pantoate--beta-alanine ligase  42.14 
 
 		 282 aa  226  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3808  pantoate--beta-alanine ligase  45.8 
 
 		 289 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471604 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  45.26 
 
 		 286 aa  226  3e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  45.04 
 
 		 278 aa  226  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  46.15 
 
 		 277 aa  226  4e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0502  pantoate--beta-alanine ligase  46.86 
 
 		 300 aa  226  4e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  42.14 
 
 		 282 aa  226  4e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3749  pantoate--beta-alanine ligase  42.5 
 
 		 282 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.94763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3739  pantoate--beta-alanine ligase  47.7 
 
 		 289 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.28887  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3822  pantoate--beta-alanine ligase  47.7 
 
 		 289 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  46.79 
 
 		 279 aa  224  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  44.33 
 
 		 278 aa  223  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1596  pantoate--beta-alanine ligase  42.86 
 
 		 282 aa  223  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0472681  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1263  pantoate--beta-alanine ligase  42.4 
 
 		 282 aa  223  4e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.933341  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2254  pantoate/beta-alanine ligase  46.89 
 
 		 289 aa  221  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3681  pantoate--beta-alanine ligase  47.35 
 
 		 289 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.963286  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  44.73 
 
 		 288 aa  217  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2430  pantoate/beta-alanine ligase  44.48 
 
 		 288 aa  217  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  44.4 
 
 		 289 aa  218  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2891  pantoate/beta-alanine ligase  47.89 
 
 		 290 aa  217  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150324  normal  0.438724 
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  45.32 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  44.23 
 
 		 277 aa  217  2e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  42.8 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  44.09 
 
 		 290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  44.6 
 
 		 291 aa  216  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.16 
 
 		 534 aa  216  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  45.32 
 
 		 293 aa  216  4e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  43.42 
 
 		 284 aa  215  5e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  42.76 
 
 		 288 aa  215  5.9999999999999996e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0101  pantoate--beta-alanine ligase  47.89 
 
 		 327 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.74 
 
 		 528 aa  214  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  47.17 
 
 		 287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  48.84 
 
 		 287 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  44.17 
 
 		 283 aa  212  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  44.62 
 
 		 268 aa  211  7.999999999999999e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  44.1 
 
 		 289 aa  211  9e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.83 
 
 		 526 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  41.64 
 
 		 282 aa  209  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  42.34 
 
 		 281 aa  209  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2884  pantothenate synthetase  46.97 
 
 		 296 aa  209  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  46.74 
 
 		 296 aa  209  4e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>