More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2884 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2884  pantothenate synthetase  100 
 
 		 296 aa  593  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  65.88 
 
 		 294 aa  368  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  64.81 
 
 		 287 aa  347  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  67.61 
 
 		 289 aa  346  3e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9160  Pantoate--beta-alanine ligase  63.97 
 
 		 285 aa  325  5e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8383  pantoate/beta-alanine ligase  63.94 
 
 		 288 aa  323  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.857994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0090  pantoate/beta-alanine ligase  54.93 
 
 		 273 aa  277  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0211  pantothenate synthetase  55.02 
 
 		 303 aa  271  1e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.120689 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  56.12 
 
 		 334 aa  270  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0575  pantoate--beta-alanine ligase  59.15 
 
 		 288 aa  269  4e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.447307  normal  0.0256844 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  49.62 
 
 		 283 aa  258  7e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  46.91 
 
 		 280 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  50.87 
 
 		 289 aa  251  7e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4283  pantoate--beta-alanine ligase  55.97 
 
 		 282 aa  249  4e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  47.37 
 
 		 289 aa  249  5e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  45.07 
 
 		 282 aa  248  7e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0200  pantoate--beta-alanine ligase  52.92 
 
 		 360 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  46.29 
 
 		 281 aa  247  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  45.61 
 
 		 280 aa  246  4e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  45.61 
 
 		 280 aa  245  6e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0635  pantoate/beta-alanine ligase  56.54 
 
 		 324 aa  244  8e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.53875  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  50 
 
 		 283 aa  244  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4718  pantoate--beta-alanine ligase  53.87 
 
 		 282 aa  242  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  48.34 
 
 		 539 aa  242  6e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2096  pantoate/beta-alanine ligase  53.93 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.985614 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  45.62 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32010  pantothenate synthetase  55.12 
 
 		 321 aa  238  5.999999999999999e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0325  pantoate--beta-alanine ligase  50.51 
 
 		 296 aa  238  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.9 
 
 		 526 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.3 
 
 		 534 aa  236  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  45.8 
 
 		 280 aa  236  4e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  47.22 
 
 		 291 aa  236  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  45.26 
 
 		 281 aa  235  8e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0632  pantoate/beta-alanine ligase  52.63 
 
 		 276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1424  pantoate--beta-alanine ligase  53.62 
 
 		 314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.172502 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  45.33 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0848  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 279 aa  232  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.889171  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  43.73 
 
 		 282 aa  231  8.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  47.45 
 
 		 283 aa  231  9e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0117  pantoate/beta-alanine ligase  45.58 
 
 		 279 aa  230  2e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.75 
 
 		 528 aa  230  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.74 
 
 		 511 aa  229  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  47.67 
 
 		 284 aa  229  4e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  49.43 
 
 		 277 aa  229  5e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1624  pantoate--beta-alanine ligase  51.24 
 
 		 279 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00769335  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0701  pantoate--beta-alanine ligase  51.24 
 
 		 279 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.307086  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1204  pantoate--beta-alanine ligase  51.24 
 
 		 279 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2312  pantoate--beta-alanine ligase  51.24 
 
 		 279 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0189212  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1049  pantoate--beta-alanine ligase  51.24 
 
 		 279 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2489  pantoate--beta-alanine ligase  48.58 
 
 		 279 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2975  pantoate--beta-alanine ligase  51.24 
 
 		 279 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00455305  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1043  pantoate--beta-alanine ligase  51.24 
 
 		 279 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2357  pantoate--beta-alanine ligase  48.23 
 
 		 279 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.705598  normal  0.238844 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  47.04 
 
 		 288 aa  228  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2054  pantoate--beta-alanine ligase  49.3 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.39 
 
 		 511 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.14 
 
 		 527 aa  226  3e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2774  pantoate--beta-alanine ligase  49.65 
 
 		 280 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.8833 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  47.57 
 
 		 287 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  45.77 
 
 		 283 aa  226  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0101  pantoate--beta-alanine ligase  51.12 
 
 		 327 aa  226  4e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  47.71 
 
 		 283 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  44.44 
 
 		 276 aa  225  6e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35550  pantoate--beta-alanine ligase  53.43 
 
 		 302 aa  225  6e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0479281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2469  pantothenate synthetase  50.57 
 
 		 291 aa  225  6e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163424  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  40.75 
 
 		 279 aa  225  7e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  47.5 
 
 		 279 aa  225  9e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0668  pantoate--beta-alanine ligase  49.12 
 
 		 282 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3564  pantoate--beta-alanine ligase  47.4 
 
 		 283 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  46.53 
 
 		 287 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  45.74 
 
 		 281 aa  224  2e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3332  pantoate--beta-alanine ligase  47.4 
 
 		 311 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  49.26 
 
 		 288 aa  224  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2197  pantoate--beta-alanine ligase  48.39 
 
 		 277 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347128  normal  0.875229 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5773  pantoate--beta-alanine ligase  47.87 
 
 		 279 aa  222  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417001  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  44.74 
 
 		 280 aa  223  4e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2387  pantoate--beta-alanine ligase  47.57 
 
 		 283 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513339 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2254  pantoate/beta-alanine ligase  44.95 
 
 		 289 aa  222  4.9999999999999996e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1634  pantoate--beta-alanine ligase  45.94 
 
 		 283 aa  222  7e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0878  pantoate--beta-alanine ligase  45.74 
 
 		 279 aa  222  8e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  47.2 
 
 		 287 aa  221  8e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  48.13 
 
 		 283 aa  221  8e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2447  pantoate--beta-alanine ligase  47.37 
 
 		 279 aa  221  9e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.124687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0126  pantoate--beta-alanine ligase  46.1 
 
 		 287 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1831  pantoate--beta-alanine ligase  47.39 
 
 		 279 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686834  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2442  pantoate--beta-alanine ligase  47.39 
 
 		 279 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0290531  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1010  pantoate--beta-alanine ligase  48.03 
 
 		 277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3488  pantoate--beta-alanine ligase  47.67 
 
 		 277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.529268 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  48.08 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.59 
 
 		 529 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 		 279 aa  219  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00689  pantoate--beta-alanine ligase  49.81 
 
 		 280 aa  220  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.591476  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0667  pantoate--beta-alanine ligase  43.64 
 
 		 283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  43.91 
 
 		 281 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  46.53 
 
 		 286 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  45.11 
 
 		 282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4007  pantoate/beta-alanine ligase  49.66 
 
 		 318 aa  219  5e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  46.88 
 
 		 287 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2196  pantoate--beta-alanine ligase  46.88 
 
 		 283 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  43.8 
 
 		 273 aa  218  7e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>