More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2774 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_2774  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 
280 aa  573  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.8833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0668  pantoate--beta-alanine ligase  87.94 
 
 
282 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2387  pantoate--beta-alanine ligase  83.1 
 
 
283 aa  476  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513339 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2196  pantoate--beta-alanine ligase  82.04 
 
 
283 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2600  pantoate--beta-alanine ligase  82.04 
 
 
283 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.174782  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0701  pantoate--beta-alanine ligase  82.14 
 
 
279 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.307086  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1204  pantoate--beta-alanine ligase  82.14 
 
 
279 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2312  pantoate--beta-alanine ligase  82.14 
 
 
279 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0189212  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2975  pantoate--beta-alanine ligase  82.14 
 
 
279 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00455305  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1043  pantoate--beta-alanine ligase  82.14 
 
 
279 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1049  pantoate--beta-alanine ligase  82.14 
 
 
279 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1624  pantoate--beta-alanine ligase  82.14 
 
 
279 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00769335  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0848  pantoate--beta-alanine ligase  81.43 
 
 
279 aa  463  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.889171  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2197  pantoate--beta-alanine ligase  79.64 
 
 
277 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347128  normal  0.875229 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2489  pantoate--beta-alanine ligase  80.71 
 
 
279 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2357  pantoate--beta-alanine ligase  80.36 
 
 
279 aa  447  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.705598  normal  0.238844 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0852  pantoate--beta-alanine ligase  78.93 
 
 
279 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0644  pantoate--beta-alanine ligase  75.62 
 
 
283 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5773  pantoate--beta-alanine ligase  78.57 
 
 
279 aa  442  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417001  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1831  pantoate--beta-alanine ligase  79.29 
 
 
279 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686834  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1212  pantoate--beta-alanine ligase  75.62 
 
 
283 aa  442  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0119566  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2442  pantoate--beta-alanine ligase  79.29 
 
 
279 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0290531  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2447  pantoate--beta-alanine ligase  79.29 
 
 
279 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.124687  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3488  pantoate--beta-alanine ligase  78.21 
 
 
277 aa  435  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.529268 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1010  pantoate--beta-alanine ligase  78.21 
 
 
277 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3186  pantoate--beta-alanine ligase  62.5 
 
 
274 aa  359  3e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.722916  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1155  pantothenate synthetase  61.27 
 
 
281 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.914913 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4094  pantoate--beta-alanine ligase  61.07 
 
 
283 aa  335  5e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3034  pantoate--beta-alanine ligase  58.66 
 
 
282 aa  330  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1821  pantoate--beta-alanine ligase  58.45 
 
 
283 aa  328  6e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0333652  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0895  pantoate--beta-alanine ligase  58.45 
 
 
282 aa  324  8.000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136564  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2767  pantoate--beta-alanine ligase  60 
 
 
275 aa  324  1e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.1934  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0878  pantoate--beta-alanine ligase  57.5 
 
 
279 aa  324  1e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0933  pantoate--beta-alanine ligase  58.95 
 
 
283 aa  323  1e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1177  pantoate--beta-alanine ligase  56.64 
 
 
286 aa  318  3.9999999999999996e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3853  pantoate--beta-alanine ligase  54.93 
 
 
282 aa  293  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2054  pantoate--beta-alanine ligase  54.29 
 
 
283 aa  285  4e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0029  pantoate--beta-alanine ligase  53.31 
 
 
280 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0596  pantoate--beta-alanine ligase  51.97 
 
 
278 aa  276  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.242968 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2823  pantoate--beta-alanine ligase  56.13 
 
 
290 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3500  pantoate--beta-alanine ligase  55.56 
 
 
289 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  50.35 
 
 
287 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 
287 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 
287 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  44.83 
 
 
288 aa  246  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  48.6 
 
 
286 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  48.75 
 
 
287 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  47.89 
 
 
298 aa  242  5e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0198  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 
281 aa  241  7e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.795684  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0174  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 
281 aa  241  1e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  49.24 
 
 
283 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  48.4 
 
 
285 aa  240  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  47 
 
 
283 aa  239  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1061  pantoate--beta-alanine ligase  45.64 
 
 
284 aa  239  4e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  46.85 
 
 
279 aa  238  8e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  46.85 
 
 
283 aa  238  9e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  46.88 
 
 
283 aa  238  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  47.7 
 
 
300 aa  237  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  46.5 
 
 
286 aa  236  3e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  45.8 
 
 
282 aa  235  5.0000000000000005e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  47.35 
 
 
301 aa  235  8e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  46.34 
 
 
283 aa  234  9e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  46.34 
 
 
283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  44.91 
 
 
282 aa  233  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 
309 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  45.42 
 
 
281 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  43.51 
 
 
284 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  44.41 
 
 
283 aa  229  5e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00689  pantoate--beta-alanine ligase  46.15 
 
 
280 aa  228  7e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.591476  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  45.94 
 
 
293 aa  228  7e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  44.06 
 
 
282 aa  227  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  47.89 
 
 
289 aa  226  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  46.83 
 
 
284 aa  226  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  46.83 
 
 
284 aa  226  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  42.96 
 
 
283 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  45.77 
 
 
281 aa  224  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2130  pantoate--beta-alanine ligase  44.76 
 
 
286 aa  224  1e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000332887 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  42.61 
 
 
281 aa  224  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  49.46 
 
 
289 aa  224  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  46.83 
 
 
284 aa  224  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  46.13 
 
 
281 aa  224  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  45.77 
 
 
281 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  45.77 
 
 
281 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  45.07 
 
 
281 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4783  pantoate--beta-alanine ligase  45.07 
 
 
283 aa  223  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  45.07 
 
 
281 aa  222  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  45.77 
 
 
282 aa  222  6e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  46.69 
 
 
284 aa  221  9e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  48.87 
 
 
284 aa  221  9e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  44.25 
 
 
283 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  46.13 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2884  pantothenate synthetase  48.94 
 
 
296 aa  219  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  46.45 
 
 
291 aa  219  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0126  pantoate--beta-alanine ligase  46.64 
 
 
287 aa  219  3e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  47.35 
 
 
300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  47.04 
 
 
285 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  48.51 
 
 
334 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  46.81 
 
 
290 aa  219  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3063  pantoate--beta-alanine ligase  47.83 
 
 
283 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.217741  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  47.48 
 
 
282 aa  219  5e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>