More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2357 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2489  pantoate--beta-alanine ligase  99.64 
 
 		 279 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2357  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 279 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.705598  normal  0.238844 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2447  pantoate--beta-alanine ligase  97.13 
 
 		 279 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.124687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1831  pantoate--beta-alanine ligase  97.13 
 
 		 279 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686834  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2442  pantoate--beta-alanine ligase  97.13 
 
 		 279 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0290531  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5773  pantoate--beta-alanine ligase  94.27 
 
 		 279 aa  544  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417001  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0852  pantoate--beta-alanine ligase  93.55 
 
 		 279 aa  535  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2312  pantoate--beta-alanine ligase  89.25 
 
 		 279 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0189212  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0701  pantoate--beta-alanine ligase  89.25 
 
 		 279 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.307086  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1204  pantoate--beta-alanine ligase  89.25 
 
 		 279 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1043  pantoate--beta-alanine ligase  89.25 
 
 		 279 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1049  pantoate--beta-alanine ligase  89.25 
 
 		 279 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2975  pantoate--beta-alanine ligase  89.25 
 
 		 279 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00455305  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1624  pantoate--beta-alanine ligase  89.25 
 
 		 279 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00769335  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0848  pantoate--beta-alanine ligase  88.17 
 
 		 279 aa  511  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.889171  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2197  pantoate--beta-alanine ligase  84.59 
 
 		 277 aa  481  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347128  normal  0.875229 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1010  pantoate--beta-alanine ligase  82.08 
 
 		 277 aa  463  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0668  pantoate--beta-alanine ligase  80.5 
 
 		 282 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3488  pantoate--beta-alanine ligase  81.36 
 
 		 277 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.529268 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2387  pantoate--beta-alanine ligase  78.8 
 
 		 283 aa  450  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513339 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2774  pantoate--beta-alanine ligase  80.36 
 
 		 280 aa  447  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.8833 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2600  pantoate--beta-alanine ligase  77.74 
 
 		 283 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.174782  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2196  pantoate--beta-alanine ligase  77.74 
 
 		 283 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0644  pantoate--beta-alanine ligase  73.5 
 
 		 283 aa  426  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1212  pantoate--beta-alanine ligase  71.73 
 
 		 283 aa  421  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0119566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4094  pantoate--beta-alanine ligase  62.01 
 
 		 283 aa  347  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1155  pantothenate synthetase  59.86 
 
 		 281 aa  345  5e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.914913 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3186  pantoate--beta-alanine ligase  60.93 
 
 		 274 aa  345  6e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.722916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3034  pantoate--beta-alanine ligase  58.16 
 
 		 282 aa  333  2e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0933  pantoate--beta-alanine ligase  59.65 
 
 		 283 aa  327  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1821  pantoate--beta-alanine ligase  57.24 
 
 		 283 aa  326  3e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0333652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0895  pantoate--beta-alanine ligase  58.45 
 
 		 282 aa  321  7e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136564  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1177  pantoate--beta-alanine ligase  55.09 
 
 		 286 aa  310  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2767  pantoate--beta-alanine ligase  57.71 
 
 		 275 aa  310  2e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.1934  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0878  pantoate--beta-alanine ligase  56.99 
 
 		 279 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3853  pantoate--beta-alanine ligase  54.93 
 
 		 282 aa  288  9e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0029  pantoate--beta-alanine ligase  53.9 
 
 		 280 aa  280  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2054  pantoate--beta-alanine ligase  52.33 
 
 		 283 aa  277  1e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0596  pantoate--beta-alanine ligase  50.54 
 
 		 278 aa  270  1e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.242968 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2823  pantoate--beta-alanine ligase  53.08 
 
 		 290 aa  265  5e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3500  pantoate--beta-alanine ligase  53.26 
 
 		 289 aa  264  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 285 aa  250  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1061  pantoate--beta-alanine ligase  47.9 
 
 		 284 aa  250  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 		 287 aa  248  6e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 287 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  45.94 
 
 		 283 aa  248  1e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 287 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  49.12 
 
 		 287 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  48.77 
 
 		 282 aa  242  3.9999999999999997e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  47.02 
 
 		 286 aa  240  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  46.13 
 
 		 298 aa  239  5e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  46.64 
 
 		 300 aa  238  9e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  48.42 
 
 		 286 aa  237  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  48.07 
 
 		 283 aa  235  5.0000000000000005e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  45.96 
 
 		 301 aa  235  7e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  44.41 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  44.8 
 
 		 284 aa  233  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  45.1 
 
 		 286 aa  232  5e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  47.39 
 
 		 283 aa  232  5e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  48.93 
 
 		 309 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  48.4 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  45.94 
 
 		 293 aa  230  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  49.11 
 
 		 289 aa  228  7e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  45.23 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  45.23 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  45.42 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  45.23 
 
 		 283 aa  227  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  45.45 
 
 		 284 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  45.23 
 
 		 283 aa  227  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  45.23 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  44.21 
 
 		 281 aa  227  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  45.23 
 
 		 283 aa  226  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  42.96 
 
 		 281 aa  227  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  43.6 
 
 		 282 aa  227  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  45.26 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  45.23 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  45.26 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  45.23 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  45.23 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  46.26 
 
 		 289 aa  226  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  42.96 
 
 		 282 aa  225  6e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0198  pantoate--beta-alanine ligase  47.41 
 
 		 281 aa  225  6e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.795684  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  45.61 
 
 		 283 aa  224  9e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9160  Pantoate--beta-alanine ligase  47.17 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  46.98 
 
 		 291 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0174  pantoate--beta-alanine ligase  47.23 
 
 		 281 aa  223  3e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0117  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 		 288 aa  223  3e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  43.21 
 
 		 283 aa  223  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  44.88 
 
 		 284 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  45.3 
 
 		 279 aa  222  4e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  44.37 
 
 		 281 aa  222  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  44.88 
 
 		 284 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  44.37 
 
 		 281 aa  222  4e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  44.37 
 
 		 281 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  44.88 
 
 		 284 aa  222  4.9999999999999996e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2884  pantothenate synthetase  48.23 
 
 		 296 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  47.16 
 
 		 293 aa  222  6e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  47.16 
 
 		 293 aa  221  8e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  44.37 
 
 		 281 aa  221  8e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  47 
 
 		 281 aa  221  8e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>