More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4981 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  100 
 
 		 289 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2884  pantothenate synthetase  67.13 
 
 		 296 aa  350  1e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  64.83 
 
 		 294 aa  348  6e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  63.12 
 
 		 287 aa  328  6e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8383  pantoate/beta-alanine ligase  62.86 
 
 		 288 aa  325  6e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.857994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9160  Pantoate--beta-alanine ligase  62.95 
 
 		 285 aa  317  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0090  pantoate/beta-alanine ligase  59.71 
 
 		 273 aa  291  9e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0211  pantothenate synthetase  59.01 
 
 		 303 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.120689 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  48.86 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0575  pantoate--beta-alanine ligase  60.84 
 
 		 288 aa  265  5.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.447307  normal  0.0256844 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  46.27 
 
 		 282 aa  260  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0200  pantoate--beta-alanine ligase  58.69 
 
 		 360 aa  258  8e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4283  pantoate--beta-alanine ligase  57.35 
 
 		 282 aa  256  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  55.29 
 
 		 334 aa  256  4e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4718  pantoate--beta-alanine ligase  57.5 
 
 		 282 aa  255  7e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32010  pantothenate synthetase  60.69 
 
 		 321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0325  pantoate--beta-alanine ligase  55.83 
 
 		 296 aa  252  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  50.56 
 
 		 284 aa  251  7e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  50.35 
 
 		 288 aa  251  8.000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  53.76 
 
 		 296 aa  251  1e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  50.57 
 
 		 283 aa  250  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  51.74 
 
 		 283 aa  250  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  47.5 
 
 		 281 aa  249  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  47.15 
 
 		 280 aa  249  4e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2975  pantoate--beta-alanine ligase  52.14 
 
 		 279 aa  248  9e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00455305  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0701  pantoate--beta-alanine ligase  52.14 
 
 		 279 aa  248  9e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.307086  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1204  pantoate--beta-alanine ligase  52.14 
 
 		 279 aa  248  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1624  pantoate--beta-alanine ligase  52.14 
 
 		 279 aa  248  9e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00769335  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1049  pantoate--beta-alanine ligase  52.14 
 
 		 279 aa  248  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1043  pantoate--beta-alanine ligase  52.14 
 
 		 279 aa  248  9e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2312  pantoate--beta-alanine ligase  52.14 
 
 		 279 aa  248  9e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0189212  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  49.25 
 
 		 281 aa  247  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  50.37 
 
 		 291 aa  246  4e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  45.76 
 
 		 289 aa  246  4e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  51.89 
 
 		 282 aa  246  4e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  45.56 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5148  pantoate--beta-alanine ligase  55.31 
 
 		 313 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  49.09 
 
 		 279 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4762  pantoate--beta-alanine ligase  55.31 
 
 		 313 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4848  pantoate--beta-alanine ligase  55.31 
 
 		 313 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0717789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2096  pantoate/beta-alanine ligase  55.6 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.985614 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35550  pantoate--beta-alanine ligase  55.76 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0479281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0632  pantoate/beta-alanine ligase  57.79 
 
 		 276 aa  243  3e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0848  pantoate--beta-alanine ligase  51.06 
 
 		 279 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.889171  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3488  pantoate--beta-alanine ligase  50.92 
 
 		 277 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.529268 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 279 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  48.21 
 
 		 283 aa  242  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  47.49 
 
 		 280 aa  241  7e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  47.49 
 
 		 280 aa  241  7e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  48.47 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  51.11 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  43.57 
 
 		 280 aa  240  2e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.9 
 
 		 526 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  48.48 
 
 		 282 aa  239  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  51.71 
 
 		 278 aa  238  5.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2197  pantoate--beta-alanine ligase  50.54 
 
 		 277 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347128  normal  0.875229 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  48.46 
 
 		 290 aa  238  9e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.88 
 
 		 534 aa  238  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5773  pantoate--beta-alanine ligase  50.72 
 
 		 279 aa  237  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417001  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0117  pantoate/beta-alanine ligase  48.2 
 
 		 279 aa  238  1e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  51.14 
 
 		 289 aa  237  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  50.38 
 
 		 511 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  50.92 
 
 		 283 aa  237  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  47.46 
 
 		 281 aa  236  3e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  46.99 
 
 		 539 aa  236  3e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1010  pantoate--beta-alanine ligase  49.45 
 
 		 277 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  50.94 
 
 		 283 aa  236  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  47.67 
 
 		 293 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1424  pantoate--beta-alanine ligase  52.96 
 
 		 314 aa  235  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.172502 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  47.31 
 
 		 293 aa  235  5.0000000000000005e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0101  pantoate--beta-alanine ligase  51.6 
 
 		 327 aa  235  7e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0852  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 279 aa  234  9e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  46.39 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0667  pantoate--beta-alanine ligase  45.91 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0323  pantoate--beta-alanine ligase  49.66 
 
 		 301 aa  233  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2054  pantoate--beta-alanine ligase  51.26 
 
 		 283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  44.53 
 
 		 280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  49.62 
 
 		 511 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4375  pantoate--beta-alanine ligase  57.53 
 
 		 381 aa  233  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2489  pantoate--beta-alanine ligase  49.12 
 
 		 279 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2387  pantoate--beta-alanine ligase  49.31 
 
 		 283 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513339 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  49.3 
 
 		 283 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2447  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 		 279 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.124687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2196  pantoate--beta-alanine ligase  49.12 
 
 		 283 aa  232  6e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0567  pantoate/beta-alanine ligase  51.01 
 
 		 308 aa  232  7.000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2357  pantoate--beta-alanine ligase  48.76 
 
 		 279 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.705598  normal  0.238844 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0787  pantoate--beta-alanine ligase  48.84 
 
 		 283 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.232916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1831  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 		 279 aa  231  9e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686834  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2442  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 		 279 aa  231  9e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0290531  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.73 
 
 		 529 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4094  pantoate--beta-alanine ligase  49.46 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0878  pantoate--beta-alanine ligase  46.52 
 
 		 279 aa  231  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2774  pantoate--beta-alanine ligase  51.08 
 
 		 280 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.8833 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  45.05 
 
 		 281 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2600  pantoate--beta-alanine ligase  49.12 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.174782  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  50.57 
 
 		 279 aa  230  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0668  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 282 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 288 aa  230  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3564  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 283 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>