More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0895 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0895  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 282 aa  574  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136564  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0933  pantoate--beta-alanine ligase  85.87 
 
 		 283 aa  503  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4094  pantoate--beta-alanine ligase  70.67 
 
 		 283 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1821  pantoate--beta-alanine ligase  67.96 
 
 		 283 aa  387  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0333652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3034  pantoate--beta-alanine ligase  64.81 
 
 		 282 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3853  pantoate--beta-alanine ligase  64.54 
 
 		 282 aa  374  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0029  pantoate--beta-alanine ligase  67.38 
 
 		 280 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3500  pantoate--beta-alanine ligase  67.47 
 
 		 289 aa  346  2e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1155  pantothenate synthetase  62.59 
 
 		 281 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.914913 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1177  pantoate--beta-alanine ligase  63.45 
 
 		 286 aa  341  9e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2823  pantoate--beta-alanine ligase  66.55 
 
 		 290 aa  338  5e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2387  pantoate--beta-alanine ligase  59.23 
 
 		 283 aa  333  2e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513339 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0701  pantoate--beta-alanine ligase  60.21 
 
 		 279 aa  332  5e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.307086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1624  pantoate--beta-alanine ligase  60.21 
 
 		 279 aa  332  5e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00769335  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1204  pantoate--beta-alanine ligase  60.21 
 
 		 279 aa  332  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2975  pantoate--beta-alanine ligase  60.21 
 
 		 279 aa  332  5e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00455305  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1049  pantoate--beta-alanine ligase  60.21 
 
 		 279 aa  332  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2312  pantoate--beta-alanine ligase  60.21 
 
 		 279 aa  332  5e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0189212  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1043  pantoate--beta-alanine ligase  60.21 
 
 		 279 aa  332  5e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2197  pantoate--beta-alanine ligase  57.8 
 
 		 277 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347128  normal  0.875229 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0848  pantoate--beta-alanine ligase  58.8 
 
 		 279 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.889171  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0668  pantoate--beta-alanine ligase  58.74 
 
 		 282 aa  326  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0644  pantoate--beta-alanine ligase  57.49 
 
 		 283 aa  325  6e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2774  pantoate--beta-alanine ligase  58.45 
 
 		 280 aa  324  8.000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.8833 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2447  pantoate--beta-alanine ligase  59.15 
 
 		 279 aa  323  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.124687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1010  pantoate--beta-alanine ligase  59.93 
 
 		 277 aa  322  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2357  pantoate--beta-alanine ligase  58.45 
 
 		 279 aa  321  7e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.705598  normal  0.238844 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1831  pantoate--beta-alanine ligase  58.8 
 
 		 279 aa  321  7e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686834  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2442  pantoate--beta-alanine ligase  58.8 
 
 		 279 aa  321  7e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0290531  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2489  pantoate--beta-alanine ligase  58.45 
 
 		 279 aa  321  8e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2196  pantoate--beta-alanine ligase  57.49 
 
 		 283 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2600  pantoate--beta-alanine ligase  57.49 
 
 		 283 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.174782  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3488  pantoate--beta-alanine ligase  59.22 
 
 		 277 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.529268 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0852  pantoate--beta-alanine ligase  58.1 
 
 		 279 aa  318  6e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1212  pantoate--beta-alanine ligase  56.79 
 
 		 283 aa  318  7e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0119566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5773  pantoate--beta-alanine ligase  57.75 
 
 		 279 aa  317  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417001  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3186  pantoate--beta-alanine ligase  57.45 
 
 		 274 aa  309  4e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.722916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2767  pantoate--beta-alanine ligase  55.32 
 
 		 275 aa  277  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.1934  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0878  pantoate--beta-alanine ligase  51.06 
 
 		 279 aa  272  5.000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2054  pantoate--beta-alanine ligase  52.84 
 
 		 283 aa  257  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0596  pantoate--beta-alanine ligase  48.4 
 
 		 278 aa  249  3e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.242968 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  47.37 
 
 		 287 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  47.72 
 
 		 287 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  48.62 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  47.74 
 
 		 287 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1061  pantoate--beta-alanine ligase  44.03 
 
 		 284 aa  229  5e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  48.44 
 
 		 283 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  47.37 
 
 		 287 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  48.44 
 
 		 283 aa  227  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  49.48 
 
 		 283 aa  227  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0198  pantoate--beta-alanine ligase  46.48 
 
 		 281 aa  225  6e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.795684  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0174  pantoate--beta-alanine ligase  46.13 
 
 		 281 aa  222  7e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  44.95 
 
 		 281 aa  219  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  47.92 
 
 		 285 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  43.21 
 
 		 282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  48.78 
 
 		 281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3175  pantoate--beta-alanine ligase  46.01 
 
 		 281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  46.45 
 
 		 281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  43.75 
 
 		 284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  43.64 
 
 		 286 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  44.95 
 
 		 286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  46.81 
 
 		 281 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  46.83 
 
 		 281 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00689  pantoate--beta-alanine ligase  49.44 
 
 		 280 aa  211  7.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.591476  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  43.9 
 
 		 281 aa  211  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  45.33 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  45.74 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  46.48 
 
 		 281 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  45.39 
 
 		 281 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  43.15 
 
 		 282 aa  209  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  45.39 
 
 		 281 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  45.39 
 
 		 281 aa  208  7e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 		 283 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  46.81 
 
 		 287 aa  208  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  46.18 
 
 		 282 aa  207  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  42.56 
 
 		 283 aa  206  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  45.8 
 
 		 284 aa  206  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  43.24 
 
 		 288 aa  205  9e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  45.8 
 
 		 284 aa  205  9e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  45.8 
 
 		 284 aa  205  9e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  45.1 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0134  pantoate/beta-alanine ligase  42.86 
 
 		 279 aa  204  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3149  pantoate--beta-alanine ligase  45.1 
 
 		 290 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  44.1 
 
 		 286 aa  203  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  45.74 
 
 		 281 aa  201  8e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  44.37 
 
 		 288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  44.41 
 
 		 300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2130  pantoate--beta-alanine ligase  43.36 
 
 		 286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332887 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  43.51 
 
 		 289 aa  198  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  48.33 
 
 		 285 aa  198  7e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  44.01 
 
 		 289 aa  198  9e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  41.81 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  41.61 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  42.01 
 
 		 301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3564  pantoate--beta-alanine ligase  43.73 
 
 		 283 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  42.56 
 
 		 284 aa  196  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  42.21 
 
 		 286 aa  195  6e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4542  pantoate--beta-alanine ligase  44.1 
 
 		 285 aa  195  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  42.86 
 
 		 280 aa  195  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  44.21 
 
 		 287 aa  195  6e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>