More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0174 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0174  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 
281 aa  573  1.0000000000000001e-162  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0198  pantoate--beta-alanine ligase  98.22 
 
 
281 aa  560  1.0000000000000001e-159  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.795684  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00689  pantoate--beta-alanine ligase  72.95 
 
 
280 aa  415  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.591476  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  67.02 
 
 
279 aa  394  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 
283 aa  258  6e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  49.65 
 
 
287 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  52.38 
 
 
290 aa  256  4e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  50.35 
 
 
287 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  49.64 
 
 
283 aa  254  8e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 
287 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 
287 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  50.54 
 
 
283 aa  253  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 
283 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 
283 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  48.08 
 
 
283 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  47.48 
 
 
281 aa  250  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3186  pantoate--beta-alanine ligase  52.12 
 
 
274 aa  250  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.722916  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  47.9 
 
 
286 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  48.19 
 
 
283 aa  250  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  52.4 
 
 
288 aa  249  5e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  50.73 
 
 
286 aa  247  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 
286 aa  246  4e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  46.24 
 
 
281 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  49.1 
 
 
285 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 
282 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  47.1 
 
 
283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  46.21 
 
 
298 aa  242  5e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  46.76 
 
 
283 aa  242  5e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 
281 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  46.4 
 
 
284 aa  241  7.999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0644  pantoate--beta-alanine ligase  47.06 
 
 
283 aa  241  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2774  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 
280 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.8833 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  48.04 
 
 
281 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  50.73 
 
 
290 aa  240  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2387  pantoate--beta-alanine ligase  47.22 
 
 
283 aa  240  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513339 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1061  pantoate--beta-alanine ligase  45.49 
 
 
284 aa  240  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3175  pantoate--beta-alanine ligase  47.84 
 
 
281 aa  240  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  48.04 
 
 
281 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  47.33 
 
 
281 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0848  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 
279 aa  239  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.889171  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1212  pantoate--beta-alanine ligase  46.32 
 
 
283 aa  239  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0119566  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  48.35 
 
 
285 aa  239  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 
285 aa  239  5e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  47.67 
 
 
300 aa  238  5.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  46.4 
 
 
301 aa  238  6.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  47.81 
 
 
287 aa  238  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  44.21 
 
 
288 aa  237  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  47.99 
 
 
293 aa  237  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1177  pantoate--beta-alanine ligase  48.6 
 
 
286 aa  236  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  46.98 
 
 
281 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  47.62 
 
 
285 aa  236  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4094  pantoate--beta-alanine ligase  49.46 
 
 
283 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2196  pantoate--beta-alanine ligase  47.92 
 
 
283 aa  235  6e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  45.32 
 
 
283 aa  235  7e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  47.79 
 
 
286 aa  234  8e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3063  pantoate--beta-alanine ligase  48.36 
 
 
283 aa  234  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.217741  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  43.17 
 
 
284 aa  234  9e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  46.84 
 
 
284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 
281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2197  pantoate--beta-alanine ligase  49.06 
 
 
277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347128  normal  0.875229 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  44.37 
 
 
282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1821  pantoate--beta-alanine ligase  50.56 
 
 
283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0333652  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2054  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 
283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  46.62 
 
 
281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  46.62 
 
 
281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  46.81 
 
 
281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2600  pantoate--beta-alanine ligase  49.45 
 
 
283 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.174782  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  46.13 
 
 
276 aa  233  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1010  pantoate--beta-alanine ligase  50.19 
 
 
277 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  46.79 
 
 
283 aa  233  4.0000000000000004e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  48.24 
 
 
285 aa  232  5e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3564  pantoate--beta-alanine ligase  46.69 
 
 
283 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 
281 aa  232  5e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1049  pantoate--beta-alanine ligase  47.55 
 
 
279 aa  232  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0701  pantoate--beta-alanine ligase  47.55 
 
 
279 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.307086  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1204  pantoate--beta-alanine ligase  47.55 
 
 
279 aa  232  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2312  pantoate--beta-alanine ligase  47.55 
 
 
279 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0189212  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1043  pantoate--beta-alanine ligase  47.55 
 
 
279 aa  232  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1624  pantoate--beta-alanine ligase  47.55 
 
 
279 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00769335  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2975  pantoate--beta-alanine ligase  47.55 
 
 
279 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00455305  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  48.01 
 
 
282 aa  232  6e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0668  pantoate--beta-alanine ligase  48.9 
 
 
282 aa  231  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0596  pantoate--beta-alanine ligase  46.26 
 
 
278 aa  231  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.242968 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  46.1 
 
 
284 aa  230  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  44.88 
 
 
282 aa  230  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  46.55 
 
 
283 aa  230  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  46.55 
 
 
283 aa  230  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3149  pantoate--beta-alanine ligase  48.92 
 
 
290 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  44 
 
 
284 aa  230  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  45.35 
 
 
284 aa  229  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2130  pantoate--beta-alanine ligase  46.99 
 
 
286 aa  229  3e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000332887 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  46.91 
 
 
283 aa  229  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 
279 aa  229  4e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  43.11 
 
 
280 aa  229  4e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1702  pantoate--beta-alanine ligase  48.63 
 
 
283 aa  229  5e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.238045  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3034  pantoate--beta-alanine ligase  50.57 
 
 
282 aa  229  5e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  44 
 
 
284 aa  228  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  44 
 
 
284 aa  228  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1721  pantothenate synthetase  48.21 
 
 
288 aa  229  6e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.308068  normal  0.216295 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0555  pantoate--beta-alanine ligase  48.06 
 
 
278 aa  228  7e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>