More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3488 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3488  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 277 aa  569  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.529268 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1010  pantoate--beta-alanine ligase  96.03 
 
 		 277 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2197  pantoate--beta-alanine ligase  87.36 
 
 		 277 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347128  normal  0.875229 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0701  pantoate--beta-alanine ligase  82.8 
 
 		 279 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.307086  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1204  pantoate--beta-alanine ligase  82.8 
 
 		 279 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0848  pantoate--beta-alanine ligase  82.8 
 
 		 279 aa  479  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.889171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1049  pantoate--beta-alanine ligase  82.8 
 
 		 279 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1043  pantoate--beta-alanine ligase  82.8 
 
 		 279 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2312  pantoate--beta-alanine ligase  82.8 
 
 		 279 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0189212  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2975  pantoate--beta-alanine ligase  82.8 
 
 		 279 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00455305  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1624  pantoate--beta-alanine ligase  82.8 
 
 		 279 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00769335  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5773  pantoate--beta-alanine ligase  81 
 
 		 279 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417001  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2357  pantoate--beta-alanine ligase  81.36 
 
 		 279 aa  467  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.705598  normal  0.238844 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2489  pantoate--beta-alanine ligase  81.72 
 
 		 279 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0852  pantoate--beta-alanine ligase  81.36 
 
 		 279 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2447  pantoate--beta-alanine ligase  80.65 
 
 		 279 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.124687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1831  pantoate--beta-alanine ligase  80.65 
 
 		 279 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686834  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2442  pantoate--beta-alanine ligase  80.65 
 
 		 279 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0290531  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2387  pantoate--beta-alanine ligase  79.15 
 
 		 283 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513339 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0668  pantoate--beta-alanine ligase  78.01 
 
 		 282 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2774  pantoate--beta-alanine ligase  78.21 
 
 		 280 aa  444  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.8833 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2196  pantoate--beta-alanine ligase  77.39 
 
 		 283 aa  441  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2600  pantoate--beta-alanine ligase  77.39 
 
 		 283 aa  441  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.174782  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0644  pantoate--beta-alanine ligase  72.79 
 
 		 283 aa  422  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1212  pantoate--beta-alanine ligase  71.73 
 
 		 283 aa  421  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0119566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3186  pantoate--beta-alanine ligase  65.34 
 
 		 274 aa  365  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.722916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1155  pantothenate synthetase  62.9 
 
 		 281 aa  353  1e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.914913 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4094  pantoate--beta-alanine ligase  64.39 
 
 		 283 aa  351  7e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3034  pantoate--beta-alanine ligase  60.99 
 
 		 282 aa  346  3e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0933  pantoate--beta-alanine ligase  61.13 
 
 		 283 aa  338  4e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0878  pantoate--beta-alanine ligase  59.93 
 
 		 279 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1821  pantoate--beta-alanine ligase  60.42 
 
 		 283 aa  334  7.999999999999999e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0333652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0895  pantoate--beta-alanine ligase  59.22 
 
 		 282 aa  328  8e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136564  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2767  pantoate--beta-alanine ligase  60.65 
 
 		 275 aa  317  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.1934  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1177  pantoate--beta-alanine ligase  56.84 
 
 		 286 aa  314  9.999999999999999e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3853  pantoate--beta-alanine ligase  57.45 
 
 		 282 aa  305  6e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0029  pantoate--beta-alanine ligase  56.43 
 
 		 280 aa  302  4.0000000000000003e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2054  pantoate--beta-alanine ligase  54.87 
 
 		 283 aa  289  4e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2823  pantoate--beta-alanine ligase  55.86 
 
 		 290 aa  278  5e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3500  pantoate--beta-alanine ligase  55.71 
 
 		 289 aa  276  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0596  pantoate--beta-alanine ligase  51.81 
 
 		 278 aa  275  5e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.242968 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  50.53 
 
 		 287 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1061  pantoate--beta-alanine ligase  46.48 
 
 		 284 aa  248  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 		 287 aa  245  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 287 aa  244  8e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  46.81 
 
 		 286 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  48.41 
 
 		 286 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  51.29 
 
 		 289 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  45.94 
 
 		 283 aa  242  5e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  48.41 
 
 		 283 aa  242  5e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  49.11 
 
 		 287 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  44.48 
 
 		 283 aa  241  1e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  48.06 
 
 		 285 aa  239  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  46.64 
 
 		 283 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  46.64 
 
 		 283 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  48.06 
 
 		 283 aa  237  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  47.35 
 
 		 283 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  46.26 
 
 		 298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  48.42 
 
 		 279 aa  233  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  45.42 
 
 		 286 aa  233  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  45.55 
 
 		 281 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00689  pantoate--beta-alanine ligase  47.89 
 
 		 280 aa  232  5e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.591476  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  46.79 
 
 		 301 aa  231  7.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0198  pantoate--beta-alanine ligase  49.06 
 
 		 281 aa  231  8.000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.795684  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0174  pantoate--beta-alanine ligase  48.69 
 
 		 281 aa  231  9e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 		 309 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  46.43 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  48.4 
 
 		 281 aa  229  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  45.58 
 
 		 283 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  43.77 
 
 		 281 aa  229  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  46.13 
 
 		 282 aa  229  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  45.71 
 
 		 293 aa  227  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  44.57 
 
 		 284 aa  227  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  47.33 
 
 		 281 aa  227  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  45.91 
 
 		 281 aa  226  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  44.1 
 
 		 288 aa  225  5.0000000000000005e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  45.91 
 
 		 281 aa  225  6e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  47.86 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  46.26 
 
 		 281 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  46.26 
 
 		 281 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  47.65 
 
 		 285 aa  223  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2884  pantothenate synthetase  47.67 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  43.66 
 
 		 282 aa  222  4.9999999999999996e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  45.55 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  43.82 
 
 		 282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0878  Pantoate--beta-alanine ligase  51.32 
 
 		 286 aa  219  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  45.2 
 
 		 281 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  44.84 
 
 		 281 aa  218  6e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  45.2 
 
 		 281 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  46.1 
 
 		 289 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  44.52 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  41.84 
 
 		 280 aa  216  2.9999999999999998e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  47.79 
 
 		 334 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0211  pantothenate synthetase  46.74 
 
 		 303 aa  216  4e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.120689 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  41.84 
 
 		 282 aa  215  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9160  Pantoate--beta-alanine ligase  46.39 
 
 		 285 aa  215  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  45.16 
 
 		 291 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  47.71 
 
 		 294 aa  215  8e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  45.76 
 
 		 284 aa  215  8e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  44.88 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>