More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2054 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2054  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 283 aa  566  1e-160  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0596  pantoate--beta-alanine ligase  55.8 
 
 		 278 aa  324  9e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.242968 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3186  pantoate--beta-alanine ligase  58.55 
 
 		 274 aa  317  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.722916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1155  pantothenate synthetase  60.14 
 
 		 281 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.914913 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  57.8 
 
 		 286 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2767  pantoate--beta-alanine ligase  59.64 
 
 		 275 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.1934  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  57.35 
 
 		 287 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  56.99 
 
 		 287 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  56.99 
 
 		 287 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  54.96 
 
 		 283 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  56.94 
 
 		 287 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1212  pantoate--beta-alanine ligase  51.94 
 
 		 283 aa  301  8.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0119566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0878  pantoate--beta-alanine ligase  55.43 
 
 		 279 aa  300  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  54.61 
 
 		 283 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0644  pantoate--beta-alanine ligase  51.94 
 
 		 283 aa  299  3e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4094  pantoate--beta-alanine ligase  56.47 
 
 		 283 aa  298  5e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  56.23 
 
 		 285 aa  298  6e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2387  pantoate--beta-alanine ligase  52.65 
 
 		 283 aa  297  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513339 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3488  pantoate--beta-alanine ligase  54.87 
 
 		 277 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.529268 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2197  pantoate--beta-alanine ligase  54.87 
 
 		 277 aa  296  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347128  normal  0.875229 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2774  pantoate--beta-alanine ligase  54.29 
 
 		 280 aa  295  6e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.8833 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2312  pantoate--beta-alanine ligase  53.41 
 
 		 279 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0189212  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2975  pantoate--beta-alanine ligase  53.41 
 
 		 279 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00455305  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0701  pantoate--beta-alanine ligase  53.41 
 
 		 279 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.307086  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1204  pantoate--beta-alanine ligase  53.41 
 
 		 279 aa  295  8e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1043  pantoate--beta-alanine ligase  53.41 
 
 		 279 aa  295  8e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1010  pantoate--beta-alanine ligase  54.87 
 
 		 277 aa  295  8e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1624  pantoate--beta-alanine ligase  53.41 
 
 		 279 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00769335  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1049  pantoate--beta-alanine ligase  53.41 
 
 		 279 aa  295  8e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  55.63 
 
 		 283 aa  295  9e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0848  pantoate--beta-alanine ligase  53.41 
 
 		 279 aa  294  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.889171  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0668  pantoate--beta-alanine ligase  54.26 
 
 		 282 aa  292  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1177  pantoate--beta-alanine ligase  57.89 
 
 		 286 aa  291  9e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2196  pantoate--beta-alanine ligase  51.94 
 
 		 283 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0852  pantoate--beta-alanine ligase  53.41 
 
 		 279 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2600  pantoate--beta-alanine ligase  51.94 
 
 		 283 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.174782  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2357  pantoate--beta-alanine ligase  52.33 
 
 		 279 aa  289  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.705598  normal  0.238844 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5773  pantoate--beta-alanine ligase  52.69 
 
 		 279 aa  289  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417001  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2489  pantoate--beta-alanine ligase  52.33 
 
 		 279 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  54.8 
 
 		 283 aa  286  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  54.8 
 
 		 283 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2447  pantoate--beta-alanine ligase  51.61 
 
 		 279 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.124687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1831  pantoate--beta-alanine ligase  51.61 
 
 		 279 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686834  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2442  pantoate--beta-alanine ligase  51.61 
 
 		 279 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0290531  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3034  pantoate--beta-alanine ligase  53.9 
 
 		 282 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1821  pantoate--beta-alanine ligase  54.96 
 
 		 283 aa  279  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0333652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0117  pantoate--beta-alanine ligase  50.72 
 
 		 288 aa  271  1e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  48.77 
 
 		 283 aa  271  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  50.56 
 
 		 281 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0126  pantoate--beta-alanine ligase  48.94 
 
 		 287 aa  269  5e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  55.31 
 
 		 283 aa  268  8.999999999999999e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  49.43 
 
 		 284 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0895  pantoate--beta-alanine ligase  52.84 
 
 		 282 aa  267  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136564  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  49.81 
 
 		 281 aa  267  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0933  pantoate--beta-alanine ligase  53.36 
 
 		 283 aa  266  4e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  47.5 
 
 		 282 aa  265  5e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  51.25 
 
 		 286 aa  265  5e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3853  pantoate--beta-alanine ligase  53.9 
 
 		 282 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  52.63 
 
 		 281 aa  265  8e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  56.64 
 
 		 281 aa  264  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1061  pantoate--beta-alanine ligase  48.24 
 
 		 284 aa  263  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  51.85 
 
 		 281 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  48.1 
 
 		 288 aa  262  4e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  52.63 
 
 		 281 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  52.63 
 
 		 281 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  54.14 
 
 		 281 aa  262  6e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  48.58 
 
 		 282 aa  261  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  47.35 
 
 		 282 aa  259  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  54.62 
 
 		 284 aa  260  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  51.88 
 
 		 281 aa  259  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  48.07 
 
 		 284 aa  258  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  48.07 
 
 		 283 aa  257  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  51.85 
 
 		 284 aa  256  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  51.88 
 
 		 281 aa  255  5e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  50.18 
 
 		 286 aa  255  7e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  48.39 
 
 		 283 aa  254  9e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  48.39 
 
 		 283 aa  254  9e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  48.39 
 
 		 283 aa  254  9e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  47.72 
 
 		 284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  47.72 
 
 		 284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  48.03 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  48.03 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 284 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  48.03 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 284 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  51.13 
 
 		 281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  51.13 
 
 		 281 aa  253  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  48.03 
 
 		 283 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 284 aa  252  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  47.72 
 
 		 284 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  48.03 
 
 		 283 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  48.03 
 
 		 283 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 284 aa  252  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 282 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  47.72 
 
 		 284 aa  251  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 284 aa  252  6e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  48.76 
 
 		 286 aa  249  4e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  48.23 
 
 		 301 aa  248  5e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0029  pantoate--beta-alanine ligase  51.61 
 
 		 280 aa  248  7e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  45.39 
 
 		 283 aa  248  8e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>