More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0126 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0126  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 
287 aa  586  1e-166  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0117  pantoate--beta-alanine ligase  89.16 
 
 
288 aa  528  1e-149  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2130  pantoate--beta-alanine ligase  64.64 
 
 
286 aa  380  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000332887 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 
283 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 
286 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 
283 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  49.65 
 
 
287 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  51.99 
 
 
284 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 
287 aa  268  8e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  51.27 
 
 
284 aa  265  5e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  48.74 
 
 
287 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  47.92 
 
 
282 aa  265  7e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  48.74 
 
 
287 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  46.32 
 
 
284 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  46.32 
 
 
284 aa  258  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  46.32 
 
 
284 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1061  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 
284 aa  257  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  48.74 
 
 
284 aa  257  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  46.32 
 
 
284 aa  257  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  46.32 
 
 
284 aa  257  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  48.74 
 
 
284 aa  257  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  50.19 
 
 
284 aa  257  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2054  pantoate--beta-alanine ligase  48.94 
 
 
283 aa  256  3e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  48.38 
 
 
284 aa  256  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 
283 aa  256  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  46.98 
 
 
282 aa  255  7e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  48.94 
 
 
285 aa  255  7e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  49.1 
 
 
284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  48.18 
 
 
283 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  47.48 
 
 
282 aa  253  4.0000000000000004e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  46.5 
 
 
283 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  46.5 
 
 
283 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  46.5 
 
 
283 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  46.5 
 
 
283 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  45.96 
 
 
283 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  46.5 
 
 
283 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  46.5 
 
 
283 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  47.33 
 
 
286 aa  251  8.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  47.81 
 
 
283 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  46.15 
 
 
283 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  45.33 
 
 
284 aa  250  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0231  pantoate--beta-alanine ligase  45.58 
 
 
285 aa  250  2e-65  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  46.15 
 
 
283 aa  250  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  49.47 
 
 
283 aa  248  7e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  48.38 
 
 
284 aa  248  9e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  46.07 
 
 
283 aa  247  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  46.26 
 
 
283 aa  246  4e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0596  pantoate--beta-alanine ligase  47.84 
 
 
278 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.242968 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  49.45 
 
 
283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  48.56 
 
 
284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  48.16 
 
 
285 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  48.36 
 
 
281 aa  242  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  46.43 
 
 
281 aa  242  6e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  44.28 
 
 
282 aa  240  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  48 
 
 
281 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  47.29 
 
 
287 aa  240  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  47.08 
 
 
281 aa  240  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  45.71 
 
 
281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 
283 aa  239  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  46.81 
 
 
288 aa  239  5e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  45.45 
 
 
301 aa  237  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  45.71 
 
 
281 aa  237  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  47.64 
 
 
281 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  47.64 
 
 
281 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  47.04 
 
 
289 aa  236  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  45.88 
 
 
281 aa  236  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  43.11 
 
 
298 aa  236  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  43.37 
 
 
300 aa  236  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  48 
 
 
281 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  48.73 
 
 
281 aa  234  9e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  44.93 
 
 
282 aa  234  9e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  48.19 
 
 
281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  48.19 
 
 
281 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  48.36 
 
 
281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  43.62 
 
 
286 aa  232  6e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  43.54 
 
 
282 aa  232  6e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  49.81 
 
 
279 aa  232  6e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  46.04 
 
 
283 aa  231  8.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  45.45 
 
 
288 aa  231  9e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00689  pantoate--beta-alanine ligase  46.57 
 
 
280 aa  231  9e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.591476  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  46.32 
 
 
284 aa  230  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  43.87 
 
 
293 aa  229  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  43.97 
 
 
286 aa  229  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  46.24 
 
 
283 aa  228  7e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  45 
 
 
290 aa  227  1e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3149  pantoate--beta-alanine ligase  44.72 
 
 
290 aa  227  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  47.27 
 
 
282 aa  227  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  45.36 
 
 
290 aa  227  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1134  pantoate/beta-alanine ligase  46.07 
 
 
283 aa  227  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3564  pantoate--beta-alanine ligase  45.2 
 
 
283 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3063  pantoate--beta-alanine ligase  44.09 
 
 
283 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.217741  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1683  pantoate--beta-alanine ligase  43.11 
 
 
287 aa  224  9e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.708165  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3186  pantoate--beta-alanine ligase  47.1 
 
 
274 aa  224  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.722916  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  43.07 
 
 
284 aa  224  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1634  pantoate--beta-alanine ligase  42.64 
 
 
283 aa  223  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  44.69 
 
 
280 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4783  pantoate--beta-alanine ligase  45.55 
 
 
283 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  44.73 
 
 
281 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0852  pantoate--beta-alanine ligase  44.96 
 
 
279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  43.89 
 
 
280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>