More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4313 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 288 aa  599  1e-170  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  60.78 
 
 		 284 aa  352  5e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  60.42 
 
 		 281 aa  349  3e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  62.59 
 
 		 281 aa  346  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  59.72 
 
 		 283 aa  346  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  63.29 
 
 		 281 aa  344  1e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  62.24 
 
 		 281 aa  344  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  62.94 
 
 		 281 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  61.54 
 
 		 281 aa  341  8e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  62.9 
 
 		 281 aa  340  1e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  61.19 
 
 		 281 aa  338  4e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  61.19 
 
 		 281 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  60.49 
 
 		 281 aa  335  5e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  61.19 
 
 		 281 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  55.48 
 
 		 281 aa  332  5e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  55.4 
 
 		 287 aa  325  6e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  59.03 
 
 		 282 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3175  pantoate--beta-alanine ligase  58.66 
 
 		 281 aa  321  8e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  53.66 
 
 		 286 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  51.4 
 
 		 282 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  54.04 
 
 		 282 aa  315  4e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  52.61 
 
 		 301 aa  315  6e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  52.96 
 
 		 300 aa  314  8e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  53.66 
 
 		 287 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  54.04 
 
 		 283 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  53.31 
 
 		 287 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  53.31 
 
 		 287 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  52.61 
 
 		 283 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  54.51 
 
 		 285 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  52.61 
 
 		 283 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  52.8 
 
 		 283 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  51.39 
 
 		 283 aa  308  9e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  52.43 
 
 		 283 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  55.76 
 
 		 284 aa  306  3e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  50.35 
 
 		 298 aa  305  4.0000000000000004e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  52.26 
 
 		 293 aa  302  5.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  53.6 
 
 		 284 aa  301  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  53.24 
 
 		 284 aa  299  3e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  51.57 
 
 		 284 aa  298  5e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  53.31 
 
 		 284 aa  297  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  53.31 
 
 		 284 aa  297  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  52.96 
 
 		 284 aa  296  3e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  54.28 
 
 		 284 aa  290  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  50.52 
 
 		 282 aa  289  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  48.78 
 
 		 286 aa  289  4e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  50.52 
 
 		 283 aa  288  7e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0579  pantoate--beta-alanine ligase  50.35 
 
 		 289 aa  288  8e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  49.48 
 
 		 286 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1061  pantoate--beta-alanine ligase  47.39 
 
 		 284 aa  282  5.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  49.31 
 
 		 284 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  49.31 
 
 		 283 aa  276  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  49.31 
 
 		 283 aa  276  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  49.31 
 
 		 283 aa  276  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  49.31 
 
 		 283 aa  276  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  49.31 
 
 		 283 aa  276  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  48.61 
 
 		 284 aa  275  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  49.31 
 
 		 283 aa  275  5e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  48.96 
 
 		 283 aa  275  6e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  48.96 
 
 		 283 aa  275  6e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  48.96 
 
 		 283 aa  275  6e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  48.61 
 
 		 284 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  48.61 
 
 		 284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  48.26 
 
 		 284 aa  271  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  47.74 
 
 		 286 aa  271  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  48.26 
 
 		 284 aa  271  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  44.95 
 
 		 283 aa  261  6.999999999999999e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0231  pantoate--beta-alanine ligase  45.3 
 
 		 285 aa  255  5e-67  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0596  pantoate--beta-alanine ligase  45.99 
 
 		 278 aa  253  3e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.242968 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2054  pantoate--beta-alanine ligase  47.4 
 
 		 283 aa  251  7e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  43.26 
 
 		 283 aa  251  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3186  pantoate--beta-alanine ligase  48.77 
 
 		 274 aa  249  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.722916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  45.52 
 
 		 283 aa  248  9e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00689  pantoate--beta-alanine ligase  46.83 
 
 		 280 aa  247  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.591476  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2774  pantoate--beta-alanine ligase  44.83 
 
 		 280 aa  246  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.8833 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2767  pantoate--beta-alanine ligase  49.43 
 
 		 275 aa  246  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.1934  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  45.96 
 
 		 281 aa  246  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0644  pantoate--beta-alanine ligase  46.21 
 
 		 283 aa  245  6e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  46.42 
 
 		 288 aa  244  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  43.06 
 
 		 285 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  47 
 
 		 290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4783  pantoate--beta-alanine ligase  45.26 
 
 		 283 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0117  pantoate--beta-alanine ligase  47.55 
 
 		 288 aa  243  3e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0878  Pantoate--beta-alanine ligase  46.34 
 
 		 286 aa  242  6e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  45.36 
 
 		 288 aa  241  7.999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2387  pantoate--beta-alanine ligase  45.36 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513339 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1498  pantoate--beta-alanine ligase  44.88 
 
 		 281 aa  240  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00126611  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  44.72 
 
 		 279 aa  239  2.9999999999999997e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2196  pantoate--beta-alanine ligase  45.3 
 
 		 283 aa  239  5e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2130  pantoate--beta-alanine ligase  49.62 
 
 		 286 aa  238  6.999999999999999e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332887 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2600  pantoate--beta-alanine ligase  45.3 
 
 		 283 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.174782  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  42.86 
 
 		 289 aa  238  8e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0668  pantoate--beta-alanine ligase  44.83 
 
 		 282 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1212  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 		 283 aa  238  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0119566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0174  pantoate--beta-alanine ligase  44.21 
 
 		 281 aa  237  2e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  43.01 
 
 		 280 aa  236  2e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4085  pantoate--beta-alanine ligase  46.32 
 
 		 282 aa  237  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0133419 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  45.88 
 
 		 284 aa  237  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  44.17 
 
 		 287 aa  237  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  44.72 
 
 		 284 aa  237  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  44.88 
 
 		 282 aa  236  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>