More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0878 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0878  Pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 286 aa  560  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  56.38 
 
 		 286 aa  309  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  57.45 
 
 		 283 aa  299  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  56.03 
 
 		 286 aa  298  8e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  57.45 
 
 		 283 aa  298  9e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  56.38 
 
 		 287 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  55.67 
 
 		 287 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  54.96 
 
 		 286 aa  296  3e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  56.03 
 
 		 287 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  56.12 
 
 		 283 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  55.76 
 
 		 287 aa  292  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  54.61 
 
 		 283 aa  290  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  55.76 
 
 		 283 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  51.42 
 
 		 301 aa  289  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  53.82 
 
 		 281 aa  287  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  50.35 
 
 		 300 aa  284  9e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  52.29 
 
 		 281 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  48.93 
 
 		 282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  53.96 
 
 		 281 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 283 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  51.42 
 
 		 284 aa  282  4.0000000000000003e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  53.58 
 
 		 281 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  53.58 
 
 		 281 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  52.13 
 
 		 284 aa  279  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  52.13 
 
 		 284 aa  279  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  53.55 
 
 		 285 aa  279  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  51.77 
 
 		 284 aa  278  6e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  51.79 
 
 		 282 aa  278  7e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 283 aa  278  8e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  52.83 
 
 		 281 aa  278  8e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 283 aa  277  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  51.06 
 
 		 293 aa  277  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  50 
 
 		 283 aa  277  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  50 
 
 		 283 aa  276  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 283 aa  276  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  50 
 
 		 283 aa  277  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 283 aa  277  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 283 aa  276  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 283 aa  276  3e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 283 aa  276  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  54.72 
 
 		 281 aa  276  4e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  48.94 
 
 		 284 aa  275  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  48.23 
 
 		 282 aa  275  5e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  57.25 
 
 		 281 aa  275  6e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  53.58 
 
 		 281 aa  275  7e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  55.47 
 
 		 281 aa  275  7e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  48.56 
 
 		 284 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  55.47 
 
 		 281 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  48.78 
 
 		 288 aa  273  3e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  51.96 
 
 		 282 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  51.13 
 
 		 284 aa  272  5.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  49.45 
 
 		 298 aa  272  6e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  48.23 
 
 		 284 aa  271  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  48.58 
 
 		 284 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  48.23 
 
 		 284 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  53.73 
 
 		 281 aa  270  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  54.2 
 
 		 284 aa  269  5e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  50.71 
 
 		 286 aa  268  8e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  53 
 
 		 283 aa  268  8.999999999999999e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1061  pantoate--beta-alanine ligase  48.58 
 
 		 284 aa  267  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  48.23 
 
 		 284 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 		 284 aa  266  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  49.62 
 
 		 284 aa  266  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  54.77 
 
 		 285 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0231  pantoate--beta-alanine ligase  43.11 
 
 		 285 aa  265  5.999999999999999e-70  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3175  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 281 aa  264  1e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2042  pantoate/beta-alanine ligase  52.26 
 
 		 293 aa  263  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  48.23 
 
 		 284 aa  262  4e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  45.77 
 
 		 283 aa  252  5.000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2054  pantoate--beta-alanine ligase  52.67 
 
 		 283 aa  248  1e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1177  pantoate--beta-alanine ligase  52.63 
 
 		 286 aa  245  6e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3186  pantoate--beta-alanine ligase  49.22 
 
 		 274 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.722916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2197  pantoate--beta-alanine ligase  50.19 
 
 		 277 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347128  normal  0.875229 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3034  pantoate--beta-alanine ligase  49.65 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2560  pantoate--beta-alanine ligase  52.33 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1010  pantoate--beta-alanine ligase  51.7 
 
 		 277 aa  239  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4542  pantoate--beta-alanine ligase  51.12 
 
 		 285 aa  238  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  50.92 
 
 		 287 aa  237  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1624  pantoate--beta-alanine ligase  50.94 
 
 		 279 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00769335  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1043  pantoate--beta-alanine ligase  50.94 
 
 		 279 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1049  pantoate--beta-alanine ligase  50.94 
 
 		 279 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0701  pantoate--beta-alanine ligase  50.94 
 
 		 279 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.307086  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2975  pantoate--beta-alanine ligase  50.94 
 
 		 279 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00455305  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1204  pantoate--beta-alanine ligase  50.94 
 
 		 279 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2312  pantoate--beta-alanine ligase  50.94 
 
 		 279 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0189212  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0596  pantoate--beta-alanine ligase  48.85 
 
 		 278 aa  237  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.242968 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2767  pantoate--beta-alanine ligase  51.55 
 
 		 275 aa  237  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.1934  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4094  pantoate--beta-alanine ligase  47.92 
 
 		 283 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0848  pantoate--beta-alanine ligase  50.56 
 
 		 279 aa  236  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.889171  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  49.28 
 
 		 285 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0579  pantoate--beta-alanine ligase  42.49 
 
 		 289 aa  235  7e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 285 aa  234  9e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1757  pantoate--beta-alanine ligase  53.9 
 
 		 279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  50.72 
 
 		 285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2495  pantoate--beta-alanine ligase  54.51 
 
 		 280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3488  pantoate--beta-alanine ligase  51.32 
 
 		 277 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.529268 
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 293 aa  233  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  50.9 
 
 		 290 aa  233  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00689  pantoate--beta-alanine ligase  48.75 
 
 		 280 aa  232  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.591476  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  51.61 
 
 		 289 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>