More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2315 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 286 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  53.9 
 
 		 283 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  52.67 
 
 		 282 aa  301  7.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  54.96 
 
 		 285 aa  295  5e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  53.96 
 
 		 281 aa  290  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  55.12 
 
 		 283 aa  289  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  54.51 
 
 		 283 aa  289  4e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  55.12 
 
 		 283 aa  289  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  53 
 
 		 287 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  56.11 
 
 		 281 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  53.36 
 
 		 287 aa  288  7e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  52.65 
 
 		 287 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  51.96 
 
 		 283 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0878  Pantoate--beta-alanine ligase  56.03 
 
 		 286 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  53.82 
 
 		 281 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  54.96 
 
 		 281 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  51.97 
 
 		 285 aa  285  5.999999999999999e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  52.3 
 
 		 287 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  52.11 
 
 		 286 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  54.58 
 
 		 281 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  49.48 
 
 		 288 aa  284  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  53.82 
 
 		 281 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  53.82 
 
 		 281 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  51.25 
 
 		 283 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  53.44 
 
 		 281 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3175  pantoate--beta-alanine ligase  54.26 
 
 		 281 aa  281  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  54.72 
 
 		 281 aa  281  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  56.11 
 
 		 282 aa  280  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  53.05 
 
 		 281 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  51.7 
 
 		 281 aa  279  4e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  55.09 
 
 		 281 aa  276  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  50.57 
 
 		 284 aa  275  4e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  50.35 
 
 		 282 aa  275  7e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  47.37 
 
 		 286 aa  275  9e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 		 283 aa  274  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  50.35 
 
 		 284 aa  268  5e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 284 aa  268  7e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 284 aa  268  7e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  55.88 
 
 		 290 aa  268  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  48.41 
 
 		 286 aa  268  1e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  48.94 
 
 		 283 aa  265  8e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  48.94 
 
 		 283 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  48.94 
 
 		 283 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  48.94 
 
 		 283 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  48.94 
 
 		 283 aa  264  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  48.94 
 
 		 283 aa  264  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  48.58 
 
 		 283 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  48.58 
 
 		 283 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  48.58 
 
 		 283 aa  263  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 301 aa  263  3e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  49.11 
 
 		 282 aa  263  4e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  51.74 
 
 		 300 aa  261  6e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  48.24 
 
 		 284 aa  261  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  47.18 
 
 		 283 aa  261  1e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  50.35 
 
 		 283 aa  260  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  47.87 
 
 		 284 aa  259  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3186  pantoate--beta-alanine ligase  51.16 
 
 		 274 aa  259  4e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.722916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1396  pantoate--beta-alanine ligase  54.78 
 
 		 288 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.262573  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  52.12 
 
 		 284 aa  258  9e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0596  pantoate--beta-alanine ligase  47.87 
 
 		 278 aa  258  1e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.242968 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  52.11 
 
 		 293 aa  256  4e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  47.16 
 
 		 284 aa  255  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0579  pantoate--beta-alanine ligase  45.58 
 
 		 289 aa  255  5e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  47.16 
 
 		 284 aa  255  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  46.13 
 
 		 298 aa  255  7e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  47.16 
 
 		 284 aa  255  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0101  pantoate--beta-alanine ligase  49.29 
 
 		 327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  46.62 
 
 		 280 aa  253  3e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  46.62 
 
 		 280 aa  253  3e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  47.87 
 
 		 284 aa  253  3e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 288 aa  253  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  46.81 
 
 		 284 aa  252  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  50.72 
 
 		 285 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  52.17 
 
 		 285 aa  252  6e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  46.1 
 
 		 284 aa  251  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3332  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 311 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0231  pantoate--beta-alanine ligase  42.55 
 
 		 285 aa  251  1e-65  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  46.81 
 
 		 284 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  50.72 
 
 		 285 aa  251  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  48.93 
 
 		 290 aa  249  4e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1061  pantoate--beta-alanine ligase  46.84 
 
 		 284 aa  249  5e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2042  pantoate/beta-alanine ligase  48.96 
 
 		 293 aa  248  8e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  48.61 
 
 		 288 aa  248  8e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  46.1 
 
 		 284 aa  248  9e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0198  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 281 aa  247  2e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.795684  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0039  pantothenate synthetase  49.08 
 
 		 289 aa  246  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0174  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 281 aa  246  4e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  47.37 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  50.54 
 
 		 279 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  44.37 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  48.39 
 
 		 279 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  49.62 
 
 		 282 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2767  pantoate--beta-alanine ligase  52.12 
 
 		 275 aa  242  5e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.1934  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00689  pantoate--beta-alanine ligase  48.03 
 
 		 280 aa  242  5e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.591476  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  45.39 
 
 		 283 aa  241  7e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  42.76 
 
 		 281 aa  241  7e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2054  pantoate--beta-alanine ligase  48.76 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  45.83 
 
 		 283 aa  239  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1702  pantoate--beta-alanine ligase  50.19 
 
 		 283 aa  239  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.238045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  42.7 
 
 		 280 aa  239  5e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>