More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0579 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0579  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 289 aa  590  1e-167  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  57.2 
 
 		 300 aa  340  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  57.2 
 
 		 301 aa  339  4e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  54.93 
 
 		 284 aa  338  5.9999999999999996e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  54.93 
 
 		 284 aa  338  5.9999999999999996e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  54.23 
 
 		 284 aa  334  7.999999999999999e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  57.14 
 
 		 293 aa  333  3e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  54.51 
 
 		 298 aa  327  2.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  54.61 
 
 		 283 aa  325  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  54.96 
 
 		 283 aa  325  6e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  53 
 
 		 284 aa  325  6e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  54.96 
 
 		 283 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  54.96 
 
 		 283 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  53 
 
 		 284 aa  325  8.000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  54.96 
 
 		 283 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  54.96 
 
 		 283 aa  324  1e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  54.61 
 
 		 283 aa  323  3e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  54.61 
 
 		 283 aa  323  3e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  54.61 
 
 		 283 aa  323  3e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  54.61 
 
 		 284 aa  321  8e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  55.32 
 
 		 284 aa  320  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  53.71 
 
 		 284 aa  321  9.999999999999999e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  52.3 
 
 		 284 aa  319  3e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  54.96 
 
 		 284 aa  318  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  54.96 
 
 		 284 aa  318  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  51.59 
 
 		 284 aa  318  7.999999999999999e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  54.61 
 
 		 284 aa  316  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  54.26 
 
 		 284 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  50.35 
 
 		 288 aa  288  8e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  51.08 
 
 		 284 aa  285  5e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0231  pantoate--beta-alanine ligase  47.65 
 
 		 285 aa  281  1e-74  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  49.46 
 
 		 281 aa  280  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  46.88 
 
 		 283 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  48.89 
 
 		 283 aa  271  7e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  46.93 
 
 		 282 aa  270  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 281 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  46.93 
 
 		 281 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  50.37 
 
 		 281 aa  268  7e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  50.37 
 
 		 281 aa  268  8e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  47.58 
 
 		 283 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  50.37 
 
 		 281 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  45.19 
 
 		 287 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 281 aa  267  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  45.49 
 
 		 287 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 281 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  45.56 
 
 		 287 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  46.21 
 
 		 282 aa  266  4e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  51.49 
 
 		 282 aa  265  5e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  46.55 
 
 		 285 aa  265  5e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  50.37 
 
 		 281 aa  265  7e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  44.81 
 
 		 287 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  45.93 
 
 		 286 aa  264  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 281 aa  262  4e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  50.37 
 
 		 281 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  44.2 
 
 		 283 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  44.4 
 
 		 283 aa  261  6.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  44.2 
 
 		 283 aa  261  8e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 281 aa  260  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  44.68 
 
 		 283 aa  259  4e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3175  pantoate--beta-alanine ligase  46.57 
 
 		 281 aa  257  1e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  45.58 
 
 		 286 aa  255  5e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  46.93 
 
 		 283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  43.86 
 
 		 283 aa  250  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  44.04 
 
 		 286 aa  249  3e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2054  pantoate--beta-alanine ligase  43.01 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  43.87 
 
 		 282 aa  238  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  41.9 
 
 		 280 aa  235  8e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1061  pantoate--beta-alanine ligase  41.16 
 
 		 284 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  39.66 
 
 		 289 aa  233  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  43.06 
 
 		 282 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  41.28 
 
 		 283 aa  231  9e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3186  pantoate--beta-alanine ligase  43.89 
 
 		 274 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.722916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  41.3 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  40.7 
 
 		 309 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  41.84 
 
 		 280 aa  228  7e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2042  pantoate/beta-alanine ligase  40.49 
 
 		 293 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2767  pantoate--beta-alanine ligase  45.85 
 
 		 275 aa  227  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.1934  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  41.55 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0878  pantoate--beta-alanine ligase  44.14 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  41.82 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2130  pantoate--beta-alanine ligase  43.53 
 
 		 286 aa  223  2e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332887 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4783  pantoate--beta-alanine ligase  41.64 
 
 		 283 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  41.49 
 
 		 282 aa  224  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  38.95 
 
 		 300 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0567  pantoate/beta-alanine ligase  45.22 
 
 		 308 aa  222  7e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0117  pantoate--beta-alanine ligase  43.8 
 
 		 288 aa  221  8e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00689  pantoate--beta-alanine ligase  43.66 
 
 		 280 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.591476  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0596  pantoate--beta-alanine ligase  44.75 
 
 		 278 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.242968 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3063  pantoate--beta-alanine ligase  42.7 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0555  pantoate--beta-alanine ligase  42.35 
 
 		 278 aa  220  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  39.78 
 
 		 276 aa  219  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  39.08 
 
 		 291 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  42.8 
 
 		 279 aa  219  6e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3564  pantoate--beta-alanine ligase  41.64 
 
 		 283 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  40.93 
 
 		 282 aa  218  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0126  pantoate--beta-alanine ligase  42.01 
 
 		 287 aa  218  8.999999999999998e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  40.85 
 
 		 284 aa  218  8.999999999999998e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  40.27 
 
 		 293 aa  218  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2314  pantoate/beta-alanine ligase  39.72 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000496833  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  40.53 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>