More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2130 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2130  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 286 aa  586  1e-166  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332887 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0117  pantoate--beta-alanine ligase  63.76 
 
 		 288 aa  379  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0126  pantoate--beta-alanine ligase  64.64 
 
 		 287 aa  380  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  51.41 
 
 		 286 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  51.8 
 
 		 284 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  51.8 
 
 		 284 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  51.8 
 
 		 284 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  51.8 
 
 		 284 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  51.8 
 
 		 284 aa  279  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  50.88 
 
 		 283 aa  278  8e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 283 aa  276  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 283 aa  275  6e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  51.43 
 
 		 283 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  51.6 
 
 		 283 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 		 287 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  52.52 
 
 		 284 aa  271  6e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  52.52 
 
 		 284 aa  271  6e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  52.08 
 
 		 284 aa  271  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  51.07 
 
 		 287 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 		 287 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 		 287 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  50.9 
 
 		 284 aa  269  5e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  51.8 
 
 		 284 aa  268  7e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  51.08 
 
 		 283 aa  267  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  51.08 
 
 		 283 aa  267  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  51.64 
 
 		 283 aa  266  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  51.08 
 
 		 283 aa  266  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  51.08 
 
 		 283 aa  267  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  51.08 
 
 		 283 aa  267  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  50.72 
 
 		 283 aa  266  4e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  50.72 
 
 		 283 aa  266  4e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  51.13 
 
 		 284 aa  265  4e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  50.72 
 
 		 283 aa  266  4e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 282 aa  265  7e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  51.88 
 
 		 284 aa  264  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 		 285 aa  263  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  49.46 
 
 		 284 aa  260  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  50.54 
 
 		 284 aa  256  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  48.25 
 
 		 283 aa  256  4e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  49.3 
 
 		 282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  49.81 
 
 		 286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  48.58 
 
 		 281 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  48.42 
 
 		 301 aa  251  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  46.07 
 
 		 282 aa  246  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  47.37 
 
 		 300 aa  246  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  47.55 
 
 		 283 aa  246  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1061  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 		 284 aa  245  6e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  48.87 
 
 		 293 aa  243  3e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  46.76 
 
 		 280 aa  243  3e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0231  pantoate--beta-alanine ligase  47.12 
 
 		 285 aa  243  3e-63  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  49.65 
 
 		 281 aa  242  5e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2054  pantoate--beta-alanine ligase  45.71 
 
 		 283 aa  242  5e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  45.55 
 
 		 282 aa  241  7e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00689  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 280 aa  241  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.591476  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  46.76 
 
 		 280 aa  241  1e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  46.64 
 
 		 285 aa  240  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  49.65 
 
 		 281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  48.85 
 
 		 281 aa  239  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  49.65 
 
 		 281 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  49.62 
 
 		 288 aa  238  6.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  47.02 
 
 		 283 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  48.7 
 
 		 281 aa  238  8e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  48.77 
 
 		 279 aa  238  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  48.56 
 
 		 281 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  51.14 
 
 		 281 aa  238  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  46.07 
 
 		 284 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  46.48 
 
 		 280 aa  237  2e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  46.64 
 
 		 283 aa  236  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  46.64 
 
 		 281 aa  236  3e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  47.33 
 
 		 280 aa  236  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  45.74 
 
 		 283 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  48.58 
 
 		 281 aa  235  7e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  49.11 
 
 		 281 aa  235  7e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  48.58 
 
 		 281 aa  234  9e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  46.42 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  46.45 
 
 		 284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  48.75 
 
 		 281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  48.59 
 
 		 281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  46.59 
 
 		 283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  48.59 
 
 		 281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  46.62 
 
 		 282 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  46.26 
 
 		 279 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  50.19 
 
 		 282 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  44.6 
 
 		 282 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  46.82 
 
 		 289 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  48.28 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  46.44 
 
 		 280 aa  230  2e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2042  pantoate/beta-alanine ligase  45.04 
 
 		 293 aa  229  3e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0174  pantoate--beta-alanine ligase  46.99 
 
 		 281 aa  229  3e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  45.55 
 
 		 279 aa  229  5e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  44.21 
 
 		 285 aa  228  7e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  47.33 
 
 		 288 aa  228  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  48.29 
 
 		 281 aa  227  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0198  pantoate--beta-alanine ligase  46.62 
 
 		 281 aa  227  1e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.795684  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  44.33 
 
 		 282 aa  227  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  47.31 
 
 		 284 aa  228  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  44.76 
 
 		 285 aa  228  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  45.59 
 
 		 287 aa  227  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3186  pantoate--beta-alanine ligase  46.79 
 
 		 274 aa  227  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.722916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1212  pantoate--beta-alanine ligase  43.86 
 
 		 283 aa  226  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0119566  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>