More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2314 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2314  pantoate/beta-alanine ligase  100 
 
 		 284 aa  560  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000496833  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  49.65 
 
 		 281 aa  264  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  50.53 
 
 		 283 aa  261  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1644  pantoate/beta-alanine ligase  56.54 
 
 		 295 aa  257  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.742057  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  48.58 
 
 		 280 aa  256  3e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  48.58 
 
 		 280 aa  256  4e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  50.9 
 
 		 280 aa  251  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  45.61 
 
 		 282 aa  250  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2891  pantoate/beta-alanine ligase  56.58 
 
 		 290 aa  250  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150324  normal  0.438724 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2251  pantoate--beta-alanine ligase  51.96 
 
 		 307 aa  249  3e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0403  pantoate--beta-alanine ligase  55.96 
 
 		 279 aa  245  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2495  pantoate--beta-alanine ligase  54.87 
 
 		 280 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  44.48 
 
 		 280 aa  244  9.999999999999999e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1757  pantoate--beta-alanine ligase  55.6 
 
 		 279 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  45.96 
 
 		 282 aa  242  6e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  42.55 
 
 		 280 aa  241  7.999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  47.16 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  48.95 
 
 		 288 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  47 
 
 		 291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  46.62 
 
 		 283 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  48.58 
 
 		 278 aa  237  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1658  pantoate--beta-alanine ligase  48.94 
 
 		 282 aa  237  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.752293 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2560  pantoate--beta-alanine ligase  50.54 
 
 		 284 aa  234  9e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  46.29 
 
 		 281 aa  234  9e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  44.84 
 
 		 276 aa  233  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3835  pantothenate synthetase  45.71 
 
 		 283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  50.38 
 
 		 278 aa  233  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  42.35 
 
 		 280 aa  232  5e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  42.29 
 
 		 279 aa  231  9e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  45.91 
 
 		 289 aa  231  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  44.52 
 
 		 281 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0320  pantoate--beta-alanine ligase  41.34 
 
 		 282 aa  229  4e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  46.15 
 
 		 291 aa  228  6e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  40.99 
 
 		 282 aa  228  9e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  47.33 
 
 		 279 aa  228  9e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.65 
 
 		 527 aa  227  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  45.23 
 
 		 282 aa  227  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  42.91 
 
 		 282 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  46.62 
 
 		 279 aa  226  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.24 
 
 		 529 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8383  pantoate/beta-alanine ligase  49.29 
 
 		 288 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.857994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  49.65 
 
 		 282 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.05 
 
 		 526 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  45.23 
 
 		 281 aa  223  2e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3689  pantoate/beta-alanine ligase  45.52 
 
 		 285 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141413 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3439  pantoate--beta-alanine ligase  47.48 
 
 		 280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  46.45 
 
 		 293 aa  222  6e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  49.61 
 
 		 283 aa  222  6e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.94 
 
 		 534 aa  222  7e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  49.45 
 
 		 290 aa  221  9e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4557  pantoate/beta-alanine ligase  47.69 
 
 		 280 aa  221  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.146553  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  46.1 
 
 		 293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  50.38 
 
 		 277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0502  pantoate--beta-alanine ligase  46.81 
 
 		 300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0555  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 278 aa  219  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  44.68 
 
 		 284 aa  220  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  48.38 
 
 		 281 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  45.07 
 
 		 281 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0134  pantoate/beta-alanine ligase  43.66 
 
 		 279 aa  219  5e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  39.93 
 
 		 282 aa  218  6e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  45.74 
 
 		 289 aa  218  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  41.04 
 
 		 539 aa  218  7.999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  43.16 
 
 		 277 aa  217  1e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  42.25 
 
 		 281 aa  218  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  50.35 
 
 		 287 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  44.37 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  44.76 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0579  pantoate--beta-alanine ligase  39.72 
 
 		 289 aa  217  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  48.75 
 
 		 288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  45.71 
 
 		 282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  45.58 
 
 		 283 aa  216  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  51.59 
 
 		 289 aa  215  7e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  43.51 
 
 		 277 aa  214  9e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1908  pantoate/beta-alanine ligase  49.46 
 
 		 281 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0361  pantoate--beta-alanine ligase  41.84 
 
 		 273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  44.88 
 
 		 300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  45.39 
 
 		 309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  43.16 
 
 		 284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  50.19 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1423  pantoate--beta-alanine ligase  45.04 
 
 		 282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  44.09 
 
 		 283 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  46.67 
 
 		 289 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  45.58 
 
 		 281 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  43.16 
 
 		 284 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  43.46 
 
 		 283 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  43.16 
 
 		 284 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  44.09 
 
 		 283 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  44.09 
 
 		 283 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  45.77 
 
 		 287 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  43.57 
 
 		 282 aa  212  4.9999999999999996e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  44.09 
 
 		 283 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  44.09 
 
 		 283 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1669  pantoate--beta-alanine ligase  44.01 
 
 		 282 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0117  pantoate/beta-alanine ligase  44.91 
 
 		 279 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  46.69 
 
 		 286 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  44.09 
 
 		 283 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  44.09 
 
 		 283 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1707  pantoate--beta-alanine ligase  44.33 
 
 		 282 aa  212  7e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  45.23 
 
 		 287 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>