More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1014 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 290 aa  569  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1396  pantoate--beta-alanine ligase  86.36 
 
 		 288 aa  461  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.262573  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  65.84 
 
 		 285 aa  363  1e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  67.26 
 
 		 285 aa  363  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  64.77 
 
 		 285 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4085  pantoate--beta-alanine ligase  68.57 
 
 		 282 aa  322  6e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0133419 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  60.07 
 
 		 290 aa  317  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  60.52 
 
 		 288 aa  304  9.000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  59.34 
 
 		 282 aa  285  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3439  pantoate--beta-alanine ligase  53.62 
 
 		 280 aa  285  7e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0555  pantoate--beta-alanine ligase  62.04 
 
 		 278 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  56.41 
 
 		 279 aa  275  5e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  51.8 
 
 		 283 aa  271  9e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  54.51 
 
 		 284 aa  270  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4542  pantoate--beta-alanine ligase  52.33 
 
 		 285 aa  270  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3149  pantoate--beta-alanine ligase  54.51 
 
 		 290 aa  269  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  55.88 
 
 		 286 aa  268  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2495  pantoate--beta-alanine ligase  55.27 
 
 		 280 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2560  pantoate--beta-alanine ligase  54.04 
 
 		 284 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2423  pantoate--beta-alanine ligase  52.28 
 
 		 283 aa  266  4e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  52.54 
 
 		 282 aa  266  4e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1658  pantoate--beta-alanine ligase  55.02 
 
 		 282 aa  265  5.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.752293 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  52.69 
 
 		 281 aa  265  8e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  51.61 
 
 		 281 aa  263  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0403  pantoate--beta-alanine ligase  56.73 
 
 		 279 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  52.33 
 
 		 281 aa  263  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  51.46 
 
 		 281 aa  263  3e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3319  pantoate--beta-alanine ligase  54.74 
 
 		 286 aa  263  4e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  52.33 
 
 		 281 aa  262  4e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1757  pantoate--beta-alanine ligase  56.36 
 
 		 279 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  53.41 
 
 		 287 aa  261  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2286  pantoate--beta-alanine ligase  51.67 
 
 		 282 aa  259  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000010295  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  44.13 
 
 		 279 aa  259  4e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  48.15 
 
 		 281 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  52.33 
 
 		 281 aa  256  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2251  pantoate--beta-alanine ligase  50.34 
 
 		 307 aa  257  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4783  pantoate--beta-alanine ligase  50.72 
 
 		 283 aa  254  8e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  49.28 
 
 		 282 aa  254  8e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  47.25 
 
 		 281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3063  pantoate--beta-alanine ligase  51.46 
 
 		 283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3564  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 283 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00689  pantoate--beta-alanine ligase  52.16 
 
 		 280 aa  252  6e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.591476  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  53.79 
 
 		 283 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  52.8 
 
 		 288 aa  251  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  46.21 
 
 		 280 aa  251  1e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  53.79 
 
 		 283 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  45.59 
 
 		 281 aa  250  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1702  pantoate--beta-alanine ligase  52.71 
 
 		 283 aa  250  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.238045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  46.55 
 
 		 282 aa  250  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 281 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  45.17 
 
 		 280 aa  249  3e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 281 aa  248  6e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 281 aa  248  7e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 281 aa  248  8e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  45.99 
 
 		 281 aa  248  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  45.76 
 
 		 283 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2042  pantoate/beta-alanine ligase  53.15 
 
 		 293 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  45.56 
 
 		 280 aa  246  2e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  48.89 
 
 		 282 aa  246  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0039  pantothenate synthetase  51.28 
 
 		 289 aa  246  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  51.11 
 
 		 283 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  50.89 
 
 		 283 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  48 
 
 		 283 aa  246  4e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  43.27 
 
 		 282 aa  245  6e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  51.28 
 
 		 286 aa  245  6e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  45.68 
 
 		 283 aa  244  8e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3175  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 281 aa  244  9e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  45.32 
 
 		 283 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  50.54 
 
 		 279 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  51.77 
 
 		 283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  51.26 
 
 		 283 aa  243  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  51.23 
 
 		 286 aa  243  3e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  47.45 
 
 		 283 aa  243  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 282 aa  243  3e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0198  pantoate--beta-alanine ligase  51.82 
 
 		 281 aa  243  3e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.795684  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  46.91 
 
 		 281 aa  241  7.999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  48.36 
 
 		 293 aa  241  9e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2388  pantoate--beta-alanine ligase  52.71 
 
 		 283 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0472601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2891  pantoate/beta-alanine ligase  55.19 
 
 		 290 aa  241  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150324  normal  0.438724 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  49.09 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  47.84 
 
 		 268 aa  240  2e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  46.13 
 
 		 280 aa  241  2e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  46.13 
 
 		 280 aa  240  2e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0174  pantoate--beta-alanine ligase  50.73 
 
 		 281 aa  240  2e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  47.62 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  49.09 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  46.3 
 
 		 281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  50 
 
 		 286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  45.79 
 
 		 284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  51.1 
 
 		 281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  46.72 
 
 		 281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  50 
 
 		 288 aa  239  4e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  52.08 
 
 		 278 aa  239  4e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  49.09 
 
 		 284 aa  239  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  52.01 
 
 		 287 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  50.91 
 
 		 287 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  48.73 
 
 		 284 aa  239  5e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3332  pantoate--beta-alanine ligase  50.72 
 
 		 311 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  47.45 
 
 		 277 aa  238  9e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  49.26 
 
 		 284 aa  238  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>