More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3149 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3149  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 
290 aa  584  1e-166  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  57.35 
 
 
290 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  56.58 
 
 
288 aa  296  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  54.51 
 
 
290 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4542  pantoate--beta-alanine ligase  54.23 
 
 
285 aa  280  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246095  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1396  pantoate--beta-alanine ligase  54.83 
 
 
288 aa  276  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.262573  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  53.55 
 
 
282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3063  pantoate--beta-alanine ligase  53.33 
 
 
283 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.217741  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2560  pantoate--beta-alanine ligase  51.25 
 
 
284 aa  272  5.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3564  pantoate--beta-alanine ligase  52.04 
 
 
283 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1757  pantoate--beta-alanine ligase  55.87 
 
 
279 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  52.08 
 
 
287 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0403  pantoate--beta-alanine ligase  55.16 
 
 
279 aa  269  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1658  pantoate--beta-alanine ligase  51.61 
 
 
282 aa  267  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.752293 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2251  pantoate--beta-alanine ligase  50.53 
 
 
307 aa  266  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2495  pantoate--beta-alanine ligase  53.74 
 
 
280 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  51.76 
 
 
284 aa  265  5e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3439  pantoate--beta-alanine ligase  49.11 
 
 
280 aa  263  3e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  52.17 
 
 
285 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  51.45 
 
 
285 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  51.79 
 
 
279 aa  261  1e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  50.89 
 
 
287 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  52.17 
 
 
285 aa  259  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1721  pantothenate synthetase  51.27 
 
 
288 aa  259  4e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.308068  normal  0.216295 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  51.25 
 
 
287 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 
283 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  51.6 
 
 
283 aa  256  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  50.53 
 
 
287 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 
283 aa  255  7e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  50.89 
 
 
283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 
287 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  50.89 
 
 
283 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2388  pantoate--beta-alanine ligase  52.48 
 
 
283 aa  252  6e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0472601  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  48.75 
 
 
281 aa  251  8.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4783  pantoate--beta-alanine ligase  48.94 
 
 
283 aa  249  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2423  pantoate--beta-alanine ligase  49.65 
 
 
283 aa  249  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  49.13 
 
 
285 aa  249  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3332  pantoate--beta-alanine ligase  47.92 
 
 
311 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  48.41 
 
 
286 aa  247  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  46.01 
 
 
283 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1702  pantoate--beta-alanine ligase  49.29 
 
 
283 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.238045  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 
286 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  43.86 
 
 
281 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  45.68 
 
 
283 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  45.71 
 
 
281 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  49.09 
 
 
281 aa  242  6e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3319  pantoate--beta-alanine ligase  49.13 
 
 
286 aa  241  9e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4085  pantoate--beta-alanine ligase  54.15 
 
 
282 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0133419 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  46.38 
 
 
281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  45.61 
 
 
283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  46.1 
 
 
284 aa  238  6.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0174  pantoate--beta-alanine ligase  48.92 
 
 
281 aa  238  1e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  47.89 
 
 
276 aa  237  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0198  pantoate--beta-alanine ligase  48.92 
 
 
281 aa  237  2e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.795684  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  45 
 
 
281 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0126  pantoate--beta-alanine ligase  45.96 
 
 
287 aa  236  4e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  48.72 
 
 
279 aa  235  7e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  45.77 
 
 
282 aa  235  8e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3175  pantoate--beta-alanine ligase  46.74 
 
 
281 aa  234  9e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00689  pantoate--beta-alanine ligase  49.45 
 
 
280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.591476  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  43.73 
 
 
283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  46.45 
 
 
284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  45.74 
 
 
284 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  45.74 
 
 
284 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  46.85 
 
 
288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  44.57 
 
 
281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  47.27 
 
 
281 aa  233  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  48.92 
 
 
283 aa  233  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  45.39 
 
 
284 aa  233  3e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  45.77 
 
 
282 aa  233  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  45.04 
 
 
284 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  45.04 
 
 
284 aa  232  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  46.1 
 
 
283 aa  232  6e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  46.55 
 
 
281 aa  232  6e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  44.68 
 
 
284 aa  231  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1155  pantothenate synthetase  48.08 
 
 
281 aa  231  9e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.914913 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  46.07 
 
 
281 aa  231  9e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  46.55 
 
 
281 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  45.83 
 
 
286 aa  231  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  44.84 
 
 
283 aa  231  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  46.55 
 
 
281 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  46.1 
 
 
283 aa  231  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  42.03 
 
 
284 aa  231  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0117  pantoate--beta-alanine ligase  45.96 
 
 
288 aa  230  2e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  46.1 
 
 
283 aa  230  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  46.91 
 
 
281 aa  231  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  45.36 
 
 
284 aa  230  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  45.74 
 
 
283 aa  229  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  44.68 
 
 
284 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  45.74 
 
 
283 aa  229  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  41.13 
 
 
282 aa  229  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  44.68 
 
 
284 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  45.74 
 
 
283 aa  229  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  47.73 
 
 
284 aa  229  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  46.55 
 
 
281 aa  229  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0555  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 
278 aa  229  5e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  46.91 
 
 
281 aa  228  6e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  46.29 
 
 
286 aa  228  7e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  45.39 
 
 
283 aa  228  8e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  45.39 
 
 
283 aa  228  8e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>