More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1658 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1658  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 282 aa  565  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.752293 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2560  pantoate--beta-alanine ligase  61.79 
 
 		 284 aa  325  5e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2495  pantoate--beta-alanine ligase  62.86 
 
 		 280 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3439  pantoate--beta-alanine ligase  56.07 
 
 		 280 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0403  pantoate--beta-alanine ligase  65.47 
 
 		 279 aa  316  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1757  pantoate--beta-alanine ligase  64.62 
 
 		 279 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2251  pantoate--beta-alanine ligase  56.99 
 
 		 307 aa  287  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  55.02 
 
 		 290 aa  275  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  52.35 
 
 		 281 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  52.14 
 
 		 290 aa  264  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3149  pantoate--beta-alanine ligase  51.61 
 
 		 290 aa  263  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  44.57 
 
 		 279 aa  257  2e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 288 aa  251  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  44.24 
 
 		 282 aa  246  3e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1396  pantoate--beta-alanine ligase  52.42 
 
 		 288 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.262573  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3319  pantoate--beta-alanine ligase  51.43 
 
 		 286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2314  pantoate/beta-alanine ligase  48.94 
 
 		 284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000496833  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  47.12 
 
 		 283 aa  237  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  49.28 
 
 		 284 aa  237  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  50.61 
 
 		 279 aa  236  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  52.35 
 
 		 282 aa  236  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  46.26 
 
 		 283 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  43.8 
 
 		 281 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  49.82 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 285 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  44.36 
 
 		 280 aa  231  1e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  44.36 
 
 		 280 aa  231  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  47.37 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  50.53 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2042  pantoate/beta-alanine ligase  47.39 
 
 		 293 aa  229  3e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  48.36 
 
 		 284 aa  229  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  48.9 
 
 		 285 aa  228  7e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  41.73 
 
 		 281 aa  228  8e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  41.33 
 
 		 280 aa  228  9e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  46.29 
 
 		 286 aa  228  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  45.62 
 
 		 298 aa  228  1e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  44.96 
 
 		 291 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  45.2 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  41.01 
 
 		 280 aa  227  2e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  45.2 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3835  pantothenate synthetase  41.07 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  45.2 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  44.48 
 
 		 284 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  44.48 
 
 		 284 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  44.48 
 
 		 284 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  45.2 
 
 		 284 aa  226  4e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  49.29 
 
 		 285 aa  226  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 283 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0039  pantothenate synthetase  47.1 
 
 		 289 aa  225  5.0000000000000005e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  44.84 
 
 		 283 aa  225  6e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  44.84 
 
 		 283 aa  225  6e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  44.84 
 
 		 283 aa  225  6e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  48.72 
 
 		 282 aa  225  6e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  46.64 
 
 		 284 aa  225  7e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  44.48 
 
 		 284 aa  225  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  44.48 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  44.48 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  44.13 
 
 		 284 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  46.13 
 
 		 284 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  48.16 
 
 		 291 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  44.48 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  46.13 
 
 		 284 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  46.24 
 
 		 282 aa  223  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  46.24 
 
 		 283 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  46.91 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  45.77 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  40.36 
 
 		 281 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  47.55 
 
 		 286 aa  222  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  45.19 
 
 		 281 aa  221  7e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  41.73 
 
 		 283 aa  221  8e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  44.07 
 
 		 281 aa  221  9e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 		 287 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  47.81 
 
 		 278 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1644  pantoate/beta-alanine ligase  53.21 
 
 		 295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.742057  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  45.02 
 
 		 281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  48.67 
 
 		 284 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3564  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 		 283 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  45.02 
 
 		 281 aa  219  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0476  pantoate--beta-alanine ligase  42.55 
 
 		 281 aa  219  3e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  46.18 
 
 		 289 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  42.96 
 
 		 282 aa  219  5e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  46.18 
 
 		 284 aa  219  5e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  41.45 
 
 		 284 aa  219  5e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1134  pantoate/beta-alanine ligase  46.1 
 
 		 283 aa  218  6e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  42.96 
 
 		 281 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  48.62 
 
 		 278 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  39.35 
 
 		 282 aa  217  1e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4557  pantoate/beta-alanine ligase  44.75 
 
 		 280 aa  217  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.146553  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  47.5 
 
 		 287 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  45.8 
 
 		 288 aa  217  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  44.29 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  44.4 
 
 		 289 aa  217  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2891  pantoate/beta-alanine ligase  56.99 
 
 		 290 aa  216  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150324  normal  0.438724 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0231  pantoate--beta-alanine ligase  39.86 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  41.64 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  41.43 
 
 		 282 aa  216  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  45.02 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  43.53 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>