More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2788 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  100 
 
 		 282 aa  551  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3319  pantoate--beta-alanine ligase  59.65 
 
 		 286 aa  305  4.0000000000000004e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  60.79 
 
 		 279 aa  297  1e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  59.34 
 
 		 290 aa  296  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  58.06 
 
 		 290 aa  296  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  57.55 
 
 		 288 aa  293  3e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2251  pantoate--beta-alanine ligase  55.9 
 
 		 307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1396  pantoate--beta-alanine ligase  58.97 
 
 		 288 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.262573  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  54.35 
 
 		 285 aa  279  4e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  54.18 
 
 		 285 aa  275  4e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3149  pantoate--beta-alanine ligase  53.55 
 
 		 290 aa  273  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  53.26 
 
 		 285 aa  273  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  54.61 
 
 		 287 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  55.67 
 
 		 287 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  54.96 
 
 		 287 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4085  pantoate--beta-alanine ligase  58.63 
 
 		 282 aa  270  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0133419 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  53.52 
 
 		 285 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0555  pantoate--beta-alanine ligase  57.71 
 
 		 278 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3564  pantoate--beta-alanine ligase  51.8 
 
 		 283 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3063  pantoate--beta-alanine ligase  51.77 
 
 		 283 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 281 aa  263  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  45.71 
 
 		 281 aa  263  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  54.68 
 
 		 287 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2560  pantoate--beta-alanine ligase  53.21 
 
 		 284 aa  262  4.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  54.58 
 
 		 283 aa  262  4.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  48.75 
 
 		 281 aa  261  8e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  53.76 
 
 		 283 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3332  pantoate--beta-alanine ligase  51.77 
 
 		 311 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2423  pantoate--beta-alanine ligase  50.35 
 
 		 283 aa  261  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  53.19 
 
 		 287 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4783  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 283 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  48.19 
 
 		 283 aa  256  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2388  pantoate--beta-alanine ligase  53.79 
 
 		 283 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0472601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  49.46 
 
 		 281 aa  255  7e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  52.69 
 
 		 283 aa  254  8e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1702  pantoate--beta-alanine ligase  53.31 
 
 		 283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.238045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  44.29 
 
 		 282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  48.57 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  53.19 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  50.92 
 
 		 281 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  52.84 
 
 		 283 aa  252  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  46.79 
 
 		 282 aa  251  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4542  pantoate--beta-alanine ligase  51.94 
 
 		 285 aa  251  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 		 284 aa  251  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  50.92 
 
 		 281 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  51.42 
 
 		 286 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  48.23 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  44.8 
 
 		 279 aa  250  2e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  50.55 
 
 		 281 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  48.4 
 
 		 300 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  51.06 
 
 		 296 aa  249  3e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 282 aa  249  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  49.82 
 
 		 281 aa  249  4e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  50.92 
 
 		 281 aa  248  6e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  44.37 
 
 		 283 aa  248  7e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  48.4 
 
 		 282 aa  248  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  52.75 
 
 		 281 aa  248  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  44.57 
 
 		 280 aa  247  1e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 281 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2495  pantoate--beta-alanine ligase  52.9 
 
 		 280 aa  247  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  48.39 
 
 		 283 aa  247  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  47.7 
 
 		 283 aa  246  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3439  pantoate--beta-alanine ligase  51.26 
 
 		 280 aa  247  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  44.57 
 
 		 280 aa  247  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  52.5 
 
 		 283 aa  246  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  46.62 
 
 		 281 aa  246  4e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  50.54 
 
 		 289 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  54.84 
 
 		 287 aa  244  8e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 288 aa  244  8e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 		 290 aa  244  9e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0403  pantoate--beta-alanine ligase  52.17 
 
 		 279 aa  244  9e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3175  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 281 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  50.92 
 
 		 281 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  47.62 
 
 		 284 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 281 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  49.81 
 
 		 282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 284 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1757  pantoate--beta-alanine ligase  51.81 
 
 		 279 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  50.92 
 
 		 281 aa  243  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  49.65 
 
 		 283 aa  243  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  48.55 
 
 		 279 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  50.88 
 
 		 282 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  49.3 
 
 		 283 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  46.79 
 
 		 276 aa  242  3.9999999999999997e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  49.3 
 
 		 283 aa  242  5e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  48.94 
 
 		 283 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2254  pantoate/beta-alanine ligase  47.65 
 
 		 289 aa  241  7.999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  48.94 
 
 		 283 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  48.94 
 
 		 283 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  48.94 
 
 		 283 aa  241  9e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  48.94 
 
 		 283 aa  241  9e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  48.94 
 
 		 283 aa  241  9e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  44.04 
 
 		 283 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  51.1 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  48.06 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  48.58 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  44.72 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  47.29 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  50.53 
 
 		 288 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  44.4 
 
 		 277 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>