More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1707 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 
290 aa  597  1e-170  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0667  pantoate--beta-alanine ligase  65.11 
 
 
283 aa  379  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0553  pantoate--beta-alanine ligase  62.23 
 
 
283 aa  354  1e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0600  pantoate--beta-alanine ligase  60.79 
 
 
283 aa  340  2e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1634  pantoate--beta-alanine ligase  57.19 
 
 
283 aa  332  4e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0553  pantoate--beta-alanine ligase  55.87 
 
 
288 aa  301  9e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.716348  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0507  pantoate--beta-alanine ligase  52.52 
 
 
288 aa  298  6e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  47.54 
 
 
282 aa  272  5.000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  48.94 
 
 
283 aa  265  5e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  48.94 
 
 
282 aa  265  7e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  48.23 
 
 
283 aa  264  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  47.16 
 
 
281 aa  261  6.999999999999999e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  48.58 
 
 
283 aa  260  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  46.81 
 
 
280 aa  258  9e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  46.81 
 
 
280 aa  258  1e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  47.64 
 
 
279 aa  253  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  48.72 
 
 
273 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  46.1 
 
 
284 aa  251  8.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  45.74 
 
 
280 aa  250  2e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  45.58 
 
 
280 aa  250  2e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  47.64 
 
 
279 aa  249  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  46.81 
 
 
282 aa  248  6e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2430  pantoate/beta-alanine ligase  46.98 
 
 
288 aa  247  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1423  pantoate--beta-alanine ligase  45.77 
 
 
282 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1669  pantoate--beta-alanine ligase  46.32 
 
 
282 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1450  pantoate--beta-alanine ligase  45.77 
 
 
282 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1422  pantoate--beta-alanine ligase  45.77 
 
 
282 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1634  pantoate--beta-alanine ligase  45.77 
 
 
282 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0402516 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1563  pantoate--beta-alanine ligase  45.77 
 
 
282 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.371985  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  47.16 
 
 
289 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  43.93 
 
 
280 aa  244  9.999999999999999e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  47.33 
 
 
282 aa  243  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2942  pantoate--beta-alanine ligase  45.99 
 
 
283 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17212 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3808  pantoate--beta-alanine ligase  45.96 
 
 
289 aa  242  5e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0471604 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  45.36 
 
 
283 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 
278 aa  241  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  50.57 
 
 
278 aa  241  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  46.98 
 
 
282 aa  240  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1596  pantoate--beta-alanine ligase  44.72 
 
 
282 aa  240  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0472681  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1263  pantoate--beta-alanine ligase  45.91 
 
 
282 aa  240  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.933341  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  44.29 
 
 
281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  44.84 
 
 
281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  45.91 
 
 
281 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  45.96 
 
 
283 aa  239  5.999999999999999e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3681  pantoate--beta-alanine ligase  47.18 
 
 
289 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.963286  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  43.77 
 
 
291 aa  238  6.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1707  pantoate--beta-alanine ligase  44.72 
 
 
282 aa  238  8e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  45.32 
 
 
283 aa  237  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0211  pantothenate synthetase  50 
 
 
303 aa  236  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.120689 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3749  pantoate--beta-alanine ligase  44.01 
 
 
282 aa  237  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.94763  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  46.26 
 
 
283 aa  236  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1465  pantoate--beta-alanine ligase  45.07 
 
 
282 aa  236  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3739  pantoate--beta-alanine ligase  47.54 
 
 
289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.28887  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3822  pantoate--beta-alanine ligase  47.54 
 
 
289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  47.69 
 
 
289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0787  pantoate--beta-alanine ligase  45.04 
 
 
283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.232916  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  45.74 
 
 
284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  43.99 
 
 
293 aa  233  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  46.72 
 
 
277 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1498  pantoate--beta-alanine ligase  44.88 
 
 
281 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00126611  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  45.91 
 
 
282 aa  232  7.000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 
268 aa  231  1e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  42.86 
 
 
279 aa  231  1e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8383  pantoate/beta-alanine ligase  47.91 
 
 
288 aa  230  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.857994  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  45.45 
 
 
282 aa  229  4e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  43.93 
 
 
281 aa  229  5e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  45.91 
 
 
284 aa  229  5e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0126  pantoate--beta-alanine ligase  45 
 
 
287 aa  227  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  45.86 
 
 
280 aa  228  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0117  pantoate--beta-alanine ligase  45.11 
 
 
288 aa  227  2e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4557  pantoate/beta-alanine ligase  46.15 
 
 
280 aa  227  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.146553  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  47.1 
 
 
296 aa  227  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  48.09 
 
 
287 aa  227  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 
283 aa  226  4e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  45.83 
 
 
283 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  45.83 
 
 
283 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  45.83 
 
 
283 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  45.91 
 
 
284 aa  225  6e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  46.04 
 
 
283 aa  225  7e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 
283 aa  225  7e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  45.83 
 
 
283 aa  225  8e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  45.83 
 
 
283 aa  225  8e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  45.83 
 
 
283 aa  225  8e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2151  pantoate--beta-alanine ligase  41.96 
 
 
286 aa  224  1e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2254  pantoate/beta-alanine ligase  44.57 
 
 
289 aa  224  1e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  43.93 
 
 
288 aa  224  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0134  pantoate/beta-alanine ligase  39.72 
 
 
279 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  46.59 
 
 
294 aa  223  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  45.45 
 
 
281 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  46.45 
 
 
287 aa  223  4e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  45.83 
 
 
284 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  45.17 
 
 
277 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  44.84 
 
 
284 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2130  pantoate--beta-alanine ligase  46.42 
 
 
286 aa  222  6e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000332887 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  44.84 
 
 
284 aa  222  7e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  44.44 
 
 
284 aa  221  7e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4762  pantoate--beta-alanine ligase  44.68 
 
 
313 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4848  pantoate--beta-alanine ligase  44.68 
 
 
313 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0717789  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  45.45 
 
 
284 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5148  pantoate--beta-alanine ligase  45 
 
 
313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>