More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0553 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0553  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 
283 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0600  pantoate--beta-alanine ligase  68.33 
 
 
283 aa  404  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0667  pantoate--beta-alanine ligase  68.79 
 
 
283 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  62.23 
 
 
290 aa  354  8.999999999999999e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0507  pantoate--beta-alanine ligase  57.24 
 
 
288 aa  343  1e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1634  pantoate--beta-alanine ligase  59.01 
 
 
283 aa  339  2.9999999999999998e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0553  pantoate--beta-alanine ligase  55.76 
 
 
288 aa  298  5e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.716348  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  48.92 
 
 
282 aa  258  7e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  43.93 
 
 
280 aa  239  5e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  43.93 
 
 
280 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  46.4 
 
 
281 aa  238  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  46.32 
 
 
277 aa  237  2e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  44.33 
 
 
280 aa  231  1e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  45.45 
 
 
280 aa  230  2e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  43.17 
 
 
279 aa  230  3e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  44.96 
 
 
280 aa  228  1e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  44.68 
 
 
283 aa  227  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  45.16 
 
 
284 aa  226  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  47.86 
 
 
278 aa  226  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  43.37 
 
 
282 aa  226  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  46.09 
 
 
287 aa  222  7e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  44.6 
 
 
283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  43.77 
 
 
289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  45.83 
 
 
268 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  45.35 
 
 
289 aa  219  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  44.8 
 
 
287 aa  219  6e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  42.75 
 
 
273 aa  218  7e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  42.81 
 
 
283 aa  218  7e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8383  pantoate/beta-alanine ligase  46.9 
 
 
288 aa  218  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.857994  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  44.64 
 
 
278 aa  218  7.999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  43.73 
 
 
289 aa  218  8.999999999999998e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  43.82 
 
 
282 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  43.33 
 
 
281 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  40.14 
 
 
300 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  46.18 
 
 
539 aa  217  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  44.12 
 
 
277 aa  218  1e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.9 
 
 
528 aa  217  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1669  pantoate--beta-alanine ligase  44.6 
 
 
282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  43.42 
 
 
293 aa  216  5e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  43.42 
 
 
293 aa  215  5.9999999999999996e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1596  pantoate--beta-alanine ligase  43.77 
 
 
282 aa  215  8e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0472681  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1450  pantoate--beta-alanine ligase  44.29 
 
 
282 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1423  pantoate--beta-alanine ligase  43.93 
 
 
282 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1563  pantoate--beta-alanine ligase  44.29 
 
 
282 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.371985  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3749  pantoate--beta-alanine ligase  43.77 
 
 
282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.94763  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1465  pantoate--beta-alanine ligase  44.01 
 
 
282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  41.01 
 
 
291 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1707  pantoate--beta-alanine ligase  43.88 
 
 
282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1422  pantoate--beta-alanine ligase  43.93 
 
 
282 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  43.17 
 
 
283 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1634  pantoate--beta-alanine ligase  43.93 
 
 
282 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0402516 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2151  pantoate--beta-alanine ligase  40.79 
 
 
286 aa  211  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  42.45 
 
 
284 aa  211  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  43.51 
 
 
294 aa  210  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  39.43 
 
 
309 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2884  pantothenate synthetase  44.36 
 
 
296 aa  207  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  42.47 
 
 
281 aa  208  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  41.01 
 
 
281 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4783  pantoate--beta-alanine ligase  41.13 
 
 
283 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  41.37 
 
 
282 aa  206  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  41.79 
 
 
291 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3681  pantoate--beta-alanine ligase  44.25 
 
 
289 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.963286  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1263  pantoate--beta-alanine ligase  43.53 
 
 
282 aa  206  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.933341  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22955  predicted protein  41.76 
 
 
311 aa  206  3e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.271201  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  42.14 
 
 
282 aa  205  6e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.49 
 
 
534 aa  205  7e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.58 
 
 
529 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  43.54 
 
 
334 aa  205  7e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2423  pantoate--beta-alanine ligase  42.26 
 
 
283 aa  204  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3739  pantoate--beta-alanine ligase  43.55 
 
 
289 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.28887  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3822  pantoate--beta-alanine ligase  43.55 
 
 
289 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2430  pantoate/beta-alanine ligase  41.37 
 
 
288 aa  204  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  44.14 
 
 
281 aa  204  2e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  44.31 
 
 
283 aa  203  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0126  pantoate--beta-alanine ligase  43.4 
 
 
287 aa  203  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  40.14 
 
 
289 aa  203  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35550  pantoate--beta-alanine ligase  40.99 
 
 
302 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0479281  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  42.09 
 
 
279 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  40.93 
 
 
288 aa  203  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  41.37 
 
 
282 aa  203  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  42.75 
 
 
285 aa  202  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  41.73 
 
 
279 aa  202  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0787  pantoate--beta-alanine ligase  41.7 
 
 
283 aa  202  5e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.232916  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0567  pantoate/beta-alanine ligase  41.76 
 
 
308 aa  202  6e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  42.01 
 
 
285 aa  202  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  39.86 
 
 
281 aa  202  7e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0320  pantoate--beta-alanine ligase  40.71 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  43.36 
 
 
277 aa  201  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0211  pantothenate synthetase  43.53 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.120689 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  41.52 
 
 
282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1498  pantoate--beta-alanine ligase  41.22 
 
 
281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00126611  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  42.64 
 
 
296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  40.14 
 
 
282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  42.03 
 
 
288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  42.38 
 
 
285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  40.85 
 
 
276 aa  200  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  40.29 
 
 
281 aa  199  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  41.43 
 
 
283 aa  200  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.96 
 
 
527 aa  199  3e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  42 
 
 
279 aa  199  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0849834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>