More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0329 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 
293 aa  587  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  99.66 
 
 
293 aa  585  1e-166  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  84.64 
 
 
289 aa  503  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  70 
 
 
291 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  68.57 
 
 
289 aa  395  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  64.29 
 
 
300 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  64.29 
 
 
309 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  51.08 
 
 
280 aa  294  1e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  52.86 
 
 
283 aa  283  3.0000000000000004e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  53.21 
 
 
278 aa  282  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  48.21 
 
 
282 aa  282  5.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  49.14 
 
 
289 aa  280  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 
282 aa  279  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  50.53 
 
 
280 aa  279  5e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  50.53 
 
 
280 aa  279  5e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  48.57 
 
 
281 aa  278  7e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  53.93 
 
 
278 aa  278  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0476  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 
281 aa  278  1e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  46.81 
 
 
283 aa  275  5e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  48.57 
 
 
276 aa  273  3e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  49.11 
 
 
283 aa  271  9e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  48.4 
 
 
280 aa  270  2e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  48.4 
 
 
284 aa  267  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  47.33 
 
 
282 aa  265  5.999999999999999e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  50.36 
 
 
288 aa  264  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  52.5 
 
 
277 aa  264  1e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  48.57 
 
 
281 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 
283 aa  262  4.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  47.14 
 
 
281 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  48.4 
 
 
282 aa  261  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2151  pantoate--beta-alanine ligase  45.36 
 
 
286 aa  258  9e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  48.23 
 
 
283 aa  256  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  44.4 
 
 
281 aa  255  5e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0117  pantoate/beta-alanine ligase  47.29 
 
 
279 aa  255  6e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  47.9 
 
 
288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 
280 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2254  pantoate/beta-alanine ligase  48.59 
 
 
289 aa  253  3e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  47.52 
 
 
283 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  44.4 
 
 
282 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  47.31 
 
 
279 aa  252  7e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  44.77 
 
 
281 aa  251  8.000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  46.43 
 
 
291 aa  251  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1707  pantoate--beta-alanine ligase  45.85 
 
 
282 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  49.65 
 
 
281 aa  249  3e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1596  pantoate--beta-alanine ligase  45.49 
 
 
282 aa  249  5e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0472681  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.56 
 
 
529 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3749  pantoate--beta-alanine ligase  45.13 
 
 
282 aa  246  4e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.94763  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  51.43 
 
 
287 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  46.62 
 
 
289 aa  245  6e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 
287 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1669  pantoate--beta-alanine ligase  45.85 
 
 
282 aa  245  8e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  47.86 
 
 
281 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 
287 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1423  pantoate--beta-alanine ligase  45.13 
 
 
282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  41.79 
 
 
282 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  41.43 
 
 
282 aa  242  3.9999999999999997e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1465  pantoate--beta-alanine ligase  45.85 
 
 
282 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  47.89 
 
 
283 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1422  pantoate--beta-alanine ligase  45.13 
 
 
282 aa  242  5e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  49.1 
 
 
286 aa  242  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1634  pantoate--beta-alanine ligase  45.13 
 
 
282 aa  242  5e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0402516 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  47.67 
 
 
283 aa  242  7e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1450  pantoate--beta-alanine ligase  44.77 
 
 
282 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 
287 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1563  pantoate--beta-alanine ligase  44.77 
 
 
282 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.371985  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2620  pantoate--beta-alanine ligase  43.93 
 
 
283 aa  241  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2674  pantoate--beta-alanine ligase  43.93 
 
 
283 aa  241  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0320  pantoate--beta-alanine ligase  41.43 
 
 
282 aa  241  1e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  45.61 
 
 
284 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  48.29 
 
 
273 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  47.18 
 
 
293 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  45.61 
 
 
284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  49.29 
 
 
283 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  45.61 
 
 
284 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  45.2 
 
 
279 aa  239  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1061  pantoate--beta-alanine ligase  47.52 
 
 
284 aa  239  5e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  44.8 
 
 
281 aa  239  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  46.71 
 
 
284 aa  238  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  47.35 
 
 
284 aa  238  6.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  48.93 
 
 
283 aa  238  8e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1263  pantoate--beta-alanine ligase  44.77 
 
 
282 aa  238  8e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.933341  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  45.61 
 
 
284 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  48.38 
 
 
296 aa  238  1e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  47.89 
 
 
283 aa  237  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  47.89 
 
 
283 aa  236  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  43.96 
 
 
284 aa  236  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  47.89 
 
 
283 aa  236  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  47.54 
 
 
283 aa  235  7e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  47.54 
 
 
283 aa  235  7e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  47.54 
 
 
283 aa  235  7e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  47.54 
 
 
283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  47.54 
 
 
283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  47.55 
 
 
301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 
279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0039  pantothenate synthetase  46.74 
 
 
289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  47.54 
 
 
283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  45 
 
 
282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1683  pantoate--beta-alanine ligase  44.33 
 
 
287 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.708165  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  48.07 
 
 
282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  46.48 
 
 
300 aa  233  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>