More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0670 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 296 aa  588  1e-167  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  56.68 
 
 		 278 aa  293  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  56.32 
 
 		 278 aa  290  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  53.87 
 
 		 281 aa  285  5e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  51.65 
 
 		 276 aa  283  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  53.52 
 
 		 283 aa  279  3e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  50.9 
 
 		 283 aa  276  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  51.25 
 
 		 281 aa  277  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  58.2 
 
 		 277 aa  276  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  47.67 
 
 		 282 aa  272  4.0000000000000004e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  49.29 
 
 		 283 aa  271  9e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  46.69 
 
 		 279 aa  267  2e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  47.67 
 
 		 280 aa  267  2e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  47.67 
 
 		 280 aa  267  2e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  52.16 
 
 		 283 aa  260  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  47.7 
 
 		 281 aa  260  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  49.12 
 
 		 291 aa  260  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  50.17 
 
 		 291 aa  260  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  51.71 
 
 		 284 aa  260  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  47.5 
 
 		 281 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  54.24 
 
 		 289 aa  258  7e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  54.62 
 
 		 288 aa  257  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  48.19 
 
 		 281 aa  257  2e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  51.94 
 
 		 281 aa  256  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  49.46 
 
 		 283 aa  256  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  47.96 
 
 		 282 aa  256  4e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  52.12 
 
 		 279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  47.37 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  52.82 
 
 		 287 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  51.35 
 
 		 279 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  52.29 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  46.91 
 
 		 282 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  52.82 
 
 		 287 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  44.17 
 
 		 280 aa  251  8.000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  47.67 
 
 		 282 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  51.45 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  45.85 
 
 		 281 aa  250  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  52.36 
 
 		 289 aa  250  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  52.46 
 
 		 287 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  51.8 
 
 		 288 aa  249  5e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  52.11 
 
 		 287 aa  248  6e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 309 aa  246  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  51.87 
 
 		 527 aa  246  3e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  52.43 
 
 		 285 aa  246  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  44.29 
 
 		 289 aa  246  4e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  46.54 
 
 		 280 aa  246  4e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  50.38 
 
 		 529 aa  245  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  51.59 
 
 		 282 aa  245  6.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  47.87 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 		 280 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  49.46 
 
 		 289 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1683  pantoate--beta-alanine ligase  51.75 
 
 		 287 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.708165  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  48.38 
 
 		 293 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2314  pantoate/beta-alanine ligase  50 
 
 		 284 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000496833  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0600  pantoate--beta-alanine ligase  50.98 
 
 		 283 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  48.84 
 
 		 281 aa  242  5e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  48.38 
 
 		 293 aa  242  5e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  53.76 
 
 		 290 aa  242  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1634  pantoate--beta-alanine ligase  48.85 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  44.09 
 
 		 277 aa  240  2e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3319  pantoate--beta-alanine ligase  49.3 
 
 		 286 aa  240  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0502  pantoate--beta-alanine ligase  51.34 
 
 		 300 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  49.04 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2891  pantoate/beta-alanine ligase  53.74 
 
 		 290 aa  239  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150324  normal  0.438724 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  53.53 
 
 		 334 aa  239  4e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  49.3 
 
 		 286 aa  239  5e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  51.89 
 
 		 287 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  51.34 
 
 		 283 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  43.73 
 
 		 277 aa  237  2e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  48.89 
 
 		 282 aa  237  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2942  pantoate--beta-alanine ligase  50.19 
 
 		 283 aa  237  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17212 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1498  pantoate--beta-alanine ligase  47.9 
 
 		 281 aa  236  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00126611  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2495  pantoate--beta-alanine ligase  51.96 
 
 		 280 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 286 aa  236  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2469  pantothenate synthetase  50.18 
 
 		 291 aa  236  4e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163424  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.08 
 
 		 526 aa  235  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  48.4 
 
 		 283 aa  234  9e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  45.02 
 
 		 268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2254  pantoate/beta-alanine ligase  47.54 
 
 		 289 aa  234  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1396  pantoate--beta-alanine ligase  55.64 
 
 		 288 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.262573  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  50.76 
 
 		 294 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1423  pantoate--beta-alanine ligase  45.83 
 
 		 282 aa  233  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9160  Pantoate--beta-alanine ligase  47.14 
 
 		 285 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  50.53 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1658  pantoate--beta-alanine ligase  47.37 
 
 		 282 aa  233  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.752293 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0667  pantoate--beta-alanine ligase  47.06 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1669  pantoate--beta-alanine ligase  46.1 
 
 		 282 aa  232  5e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1422  pantoate--beta-alanine ligase  45.83 
 
 		 282 aa  232  6e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1634  pantoate--beta-alanine ligase  45.83 
 
 		 282 aa  232  6e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0402516 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  47.1 
 
 		 290 aa  232  6e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  47.87 
 
 		 282 aa  232  6e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0090  pantoate/beta-alanine ligase  49.28 
 
 		 273 aa  231  8.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8383  pantoate/beta-alanine ligase  50 
 
 		 288 aa  231  8.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.857994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3749  pantoate--beta-alanine ligase  45.61 
 
 		 282 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.94763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  49.65 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1757  pantoate--beta-alanine ligase  52.31 
 
 		 279 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0403  pantoate--beta-alanine ligase  54.09 
 
 		 279 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1596  pantoate--beta-alanine ligase  45.96 
 
 		 282 aa  231  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0472681  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  46.84 
 
 		 539 aa  230  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  49.82 
 
 		 290 aa  230  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>