More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1683 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1683  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 287 aa  594  1e-169  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.708165  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0787  pantoate--beta-alanine ligase  53.07 
 
 		 283 aa  317  2e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.232916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2942  pantoate--beta-alanine ligase  53.79 
 
 		 283 aa  312  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17212 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  53.58 
 
 		 282 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1498  pantoate--beta-alanine ligase  52.35 
 
 		 281 aa  300  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00126611  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2286  pantoate--beta-alanine ligase  51.62 
 
 		 282 aa  297  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000010295  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  48.74 
 
 		 282 aa  281  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 281 aa  278  8e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 280 aa  275  8e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 283 aa  275  9e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  49.46 
 
 		 280 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  51.07 
 
 		 283 aa  272  5.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  49.82 
 
 		 283 aa  272  5.000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 283 aa  272  5.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  46.57 
 
 		 281 aa  271  9e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  48.4 
 
 		 280 aa  270  2e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  48.38 
 
 		 283 aa  267  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  46.93 
 
 		 281 aa  266  2e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  47.86 
 
 		 280 aa  266  2e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 283 aa  265  5e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  48.51 
 
 		 273 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  48.56 
 
 		 282 aa  264  1e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  47.65 
 
 		 280 aa  263  2e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  46.93 
 
 		 282 aa  263  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1423  pantoate--beta-alanine ligase  47.65 
 
 		 282 aa  259  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1669  pantoate--beta-alanine ligase  47.29 
 
 		 282 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  50.9 
 
 		 288 aa  258  6e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1634  pantoate--beta-alanine ligase  47.65 
 
 		 282 aa  258  9e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0402516 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1422  pantoate--beta-alanine ligase  47.65 
 
 		 282 aa  258  9e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  45.32 
 
 		 281 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1450  pantoate--beta-alanine ligase  47.29 
 
 		 282 aa  256  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1563  pantoate--beta-alanine ligase  47.29 
 
 		 282 aa  256  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.371985  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  47.29 
 
 		 281 aa  255  5e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  48.47 
 
 		 283 aa  254  8e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1263  pantoate--beta-alanine ligase  44.17 
 
 		 282 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.933341  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1707  pantoate--beta-alanine ligase  46.21 
 
 		 282 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  45.49 
 
 		 284 aa  251  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  48.29 
 
 		 282 aa  250  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1465  pantoate--beta-alanine ligase  45.85 
 
 		 282 aa  249  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  46.21 
 
 		 279 aa  249  5e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1596  pantoate--beta-alanine ligase  45.85 
 
 		 282 aa  247  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0472681  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3749  pantoate--beta-alanine ligase  45.85 
 
 		 282 aa  247  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.94763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  45.55 
 
 		 279 aa  246  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  46.57 
 
 		 281 aa  246  4e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  51.18 
 
 		 278 aa  245  6.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  48.28 
 
 		 276 aa  245  6.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  49.61 
 
 		 281 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  44.8 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  46.76 
 
 		 300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2430  pantoate/beta-alanine ligase  45.45 
 
 		 288 aa  241  7.999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  46.5 
 
 		 283 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  47.22 
 
 		 288 aa  240  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  49.41 
 
 		 277 aa  240  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  46.64 
 
 		 289 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  45.33 
 
 		 286 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  48.43 
 
 		 286 aa  240  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  48.04 
 
 		 291 aa  239  5.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  45.91 
 
 		 289 aa  238  8e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  49.04 
 
 		 290 aa  237  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3739  pantoate--beta-alanine ligase  47.24 
 
 		 289 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.28887  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  47.37 
 
 		 289 aa  237  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3822  pantoate--beta-alanine ligase  47.24 
 
 		 289 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0320  pantoate--beta-alanine ligase  40.79 
 
 		 282 aa  236  3e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  51.75 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  49.8 
 
 		 278 aa  236  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3808  pantoate--beta-alanine ligase  46.55 
 
 		 289 aa  235  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471604 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  42.96 
 
 		 283 aa  235  6e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2254  pantoate/beta-alanine ligase  47.65 
 
 		 289 aa  235  6e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  40.07 
 
 		 282 aa  234  8e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  40.79 
 
 		 282 aa  234  9e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  48.03 
 
 		 268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  45.14 
 
 		 287 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  43.94 
 
 		 288 aa  234  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  44.33 
 
 		 293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0502  pantoate--beta-alanine ligase  47.83 
 
 		 300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  44.33 
 
 		 293 aa  233  3e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  46.34 
 
 		 281 aa  233  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  46.44 
 
 		 283 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  46.37 
 
 		 283 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  45.14 
 
 		 287 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  44.1 
 
 		 287 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  46.37 
 
 		 283 aa  231  9e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0117  pantoate--beta-alanine ligase  44.24 
 
 		 288 aa  231  1e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  45.85 
 
 		 291 aa  231  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  45.88 
 
 		 279 aa  231  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  45.94 
 
 		 289 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  43.42 
 
 		 309 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2891  pantoate/beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 290 aa  229  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150324  normal  0.438724 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  44.44 
 
 		 287 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2151  pantoate--beta-alanine ligase  42.75 
 
 		 286 aa  229  4e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  48.87 
 
 		 290 aa  229  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  43.26 
 
 		 282 aa  228  7e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  47.04 
 
 		 283 aa  228  8e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  44.91 
 
 		 282 aa  226  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0101  pantoate--beta-alanine ligase  45.96 
 
 		 327 aa  226  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  45.59 
 
 		 539 aa  226  4e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1634  pantoate--beta-alanine ligase  42.07 
 
 		 283 aa  225  5.0000000000000005e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2130  pantoate--beta-alanine ligase  43.01 
 
 		 286 aa  225  7e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332887 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3681  pantoate--beta-alanine ligase  46.9 
 
 		 289 aa  225  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.963286  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0126  pantoate--beta-alanine ligase  43.11 
 
 		 287 aa  224  9e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>