More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0960 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 283 aa  578  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  91.13 
 
 		 283 aa  528  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  78.93 
 
 		 287 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  78.21 
 
 		 286 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  77.5 
 
 		 287 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  77.14 
 
 		 287 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  77.14 
 
 		 287 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  75.71 
 
 		 283 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  75.71 
 
 		 283 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  72.14 
 
 		 283 aa  411  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  71.58 
 
 		 285 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  59.57 
 
 		 282 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  56.74 
 
 		 281 aa  325  7e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  53.9 
 
 		 284 aa  317  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  53.55 
 
 		 282 aa  316  3e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  57.55 
 
 		 283 aa  315  4e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  53.74 
 
 		 283 aa  315  7e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  55.32 
 
 		 281 aa  314  9e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  55.4 
 
 		 283 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  54.04 
 
 		 288 aa  313  1.9999999999999998e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  58.87 
 
 		 281 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  58.87 
 
 		 281 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  58.87 
 
 		 281 aa  311  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  54.09 
 
 		 284 aa  311  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  54.09 
 
 		 284 aa  310  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  55.23 
 
 		 283 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  55.23 
 
 		 283 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  55.23 
 
 		 283 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  56.68 
 
 		 284 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  55.23 
 
 		 283 aa  309  4e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  55.23 
 
 		 283 aa  308  5e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  55.23 
 
 		 283 aa  308  5e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  53.74 
 
 		 284 aa  308  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  54.87 
 
 		 283 aa  308  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  54.87 
 
 		 283 aa  308  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  53.74 
 
 		 284 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  54.87 
 
 		 283 aa  308  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  56.32 
 
 		 284 aa  308  6.999999999999999e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  56.32 
 
 		 284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  56.32 
 
 		 284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  58.51 
 
 		 281 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  57.45 
 
 		 282 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  58.63 
 
 		 281 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  55.96 
 
 		 284 aa  306  3e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  53.21 
 
 		 282 aa  306  3e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  55.23 
 
 		 284 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  53.38 
 
 		 284 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  55.67 
 
 		 281 aa  301  6.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  56.74 
 
 		 281 aa  301  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1061  pantoate--beta-alanine ligase  50.53 
 
 		 284 aa  296  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  58.37 
 
 		 284 aa  296  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  54.51 
 
 		 284 aa  294  9e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  56.03 
 
 		 281 aa  294  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  56.03 
 
 		 281 aa  293  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  52.5 
 
 		 286 aa  293  3e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  53.43 
 
 		 300 aa  291  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  53.43 
 
 		 301 aa  291  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  53.79 
 
 		 284 aa  290  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  55.67 
 
 		 281 aa  289  3e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  54.48 
 
 		 293 aa  288  5.0000000000000004e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2054  pantoate--beta-alanine ligase  54.61 
 
 		 283 aa  288  6e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3175  pantoate--beta-alanine ligase  53.55 
 
 		 281 aa  288  7e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0231  pantoate--beta-alanine ligase  48.75 
 
 		 285 aa  287  1e-76  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  51.8 
 
 		 298 aa  286  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  51.96 
 
 		 286 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  50.71 
 
 		 286 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0596  pantoate--beta-alanine ligase  51.43 
 
 		 278 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.242968 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  48.75 
 
 		 283 aa  278  1e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  51.25 
 
 		 288 aa  275  9e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  51.6 
 
 		 283 aa  274  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2130  pantoate--beta-alanine ligase  51.43 
 
 		 286 aa  273  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332887 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  52.47 
 
 		 285 aa  272  5.000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0126  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 287 aa  272  5.000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  51.81 
 
 		 290 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  51.41 
 
 		 288 aa  269  5e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0117  pantoate--beta-alanine ligase  50.72 
 
 		 288 aa  268  7e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0579  pantoate--beta-alanine ligase  47.58 
 
 		 289 aa  268  8.999999999999999e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  45.16 
 
 		 282 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  47.33 
 
 		 283 aa  263  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  48.56 
 
 		 281 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  48.92 
 
 		 283 aa  262  6e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  48.4 
 
 		 282 aa  261  8e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 279 aa  261  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  48.75 
 
 		 284 aa  261  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0878  Pantoate--beta-alanine ligase  55.76 
 
 		 286 aa  261  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  46.4 
 
 		 280 aa  260  2e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 		 283 aa  260  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 282 aa  259  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3186  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 274 aa  258  6e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.722916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  50 
 
 		 289 aa  258  8e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4542  pantoate--beta-alanine ligase  48.58 
 
 		 285 aa  258  9e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  48.4 
 
 		 283 aa  258  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  52.03 
 
 		 284 aa  257  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  51.08 
 
 		 279 aa  256  3e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  48.75 
 
 		 281 aa  255  4e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3808  pantoate--beta-alanine ligase  51.38 
 
 		 289 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471604 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00689  pantoate--beta-alanine ligase  48.93 
 
 		 280 aa  255  5e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.591476  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 		 291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  50.92 
 
 		 287 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 285 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>