More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3320 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  100 
 
 		 290 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  58.93 
 
 		 288 aa  328  6e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  60.07 
 
 		 290 aa  317  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3149  pantoate--beta-alanine ligase  57.35 
 
 		 290 aa  299  3e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1396  pantoate--beta-alanine ligase  59.06 
 
 		 288 aa  294  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.262573  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2560  pantoate--beta-alanine ligase  56.54 
 
 		 284 aa  294  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  58.06 
 
 		 282 aa  288  5.0000000000000004e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3564  pantoate--beta-alanine ligase  53.6 
 
 		 283 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  54.01 
 
 		 285 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  55.47 
 
 		 285 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  53.65 
 
 		 285 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  54.64 
 
 		 285 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3063  pantoate--beta-alanine ligase  52.52 
 
 		 283 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  56.27 
 
 		 279 aa  279  4e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  51.79 
 
 		 284 aa  278  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2423  pantoate--beta-alanine ligase  52.48 
 
 		 283 aa  277  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3319  pantoate--beta-alanine ligase  57.04 
 
 		 286 aa  276  3e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  54.68 
 
 		 287 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  52.35 
 
 		 283 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  53.19 
 
 		 283 aa  273  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4783  pantoate--beta-alanine ligase  51.44 
 
 		 283 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  54.29 
 
 		 287 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  54.35 
 
 		 287 aa  271  7e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  53.52 
 
 		 283 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4542  pantoate--beta-alanine ligase  54.35 
 
 		 285 aa  271  9e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2251  pantoate--beta-alanine ligase  52.88 
 
 		 307 aa  270  2e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  51.81 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  53.96 
 
 		 287 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  53.52 
 
 		 283 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  52.54 
 
 		 286 aa  266  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1702  pantoate--beta-alanine ligase  52.92 
 
 		 283 aa  264  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.238045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  52.52 
 
 		 287 aa  264  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4085  pantoate--beta-alanine ligase  56.83 
 
 		 282 aa  263  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0133419 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  52.19 
 
 		 282 aa  261  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2388  pantoate--beta-alanine ligase  54.09 
 
 		 283 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0472601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0198  pantoate--beta-alanine ligase  53.11 
 
 		 281 aa  259  3e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.795684  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  50.89 
 
 		 282 aa  259  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3332  pantoate--beta-alanine ligase  48.44 
 
 		 311 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  48.2 
 
 		 283 aa  258  8e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1658  pantoate--beta-alanine ligase  52.14 
 
 		 282 aa  258  9e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.752293 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2495  pantoate--beta-alanine ligase  55 
 
 		 280 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  51.28 
 
 		 281 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 283 aa  257  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  51.28 
 
 		 281 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0174  pantoate--beta-alanine ligase  52.38 
 
 		 281 aa  256  4e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  47.46 
 
 		 281 aa  255  6e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  51.28 
 
 		 281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0403  pantoate--beta-alanine ligase  54.09 
 
 		 279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  47.99 
 
 		 281 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  48.4 
 
 		 283 aa  253  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  50.92 
 
 		 281 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00689  pantoate--beta-alanine ligase  52.9 
 
 		 280 aa  252  6e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.591476  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  47.29 
 
 		 281 aa  251  7e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1721  pantothenate synthetase  50.71 
 
 		 288 aa  251  7e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.308068  normal  0.216295 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1757  pantoate--beta-alanine ligase  53.02 
 
 		 279 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  48.38 
 
 		 283 aa  250  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  43.93 
 
 		 282 aa  250  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  53.87 
 
 		 279 aa  249  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  48.93 
 
 		 286 aa  249  4e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  45.23 
 
 		 281 aa  249  4e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  47.02 
 
 		 282 aa  249  4e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3439  pantoate--beta-alanine ligase  49.11 
 
 		 280 aa  249  5e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  46.01 
 
 		 283 aa  249  5e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  49.09 
 
 		 282 aa  246  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  46.24 
 
 		 281 aa  247  2e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  45.29 
 
 		 281 aa  247  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  49.08 
 
 		 281 aa  246  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  46.57 
 
 		 281 aa  246  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  50.73 
 
 		 281 aa  246  4e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0555  pantoate--beta-alanine ligase  52.65 
 
 		 278 aa  245  6e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  50.72 
 
 		 283 aa  245  6e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  50.53 
 
 		 286 aa  244  8e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  50.55 
 
 		 284 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  47 
 
 		 288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  46.57 
 
 		 283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  49.45 
 
 		 281 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1498  pantoate--beta-alanine ligase  48.06 
 
 		 281 aa  243  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00126611  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  49.27 
 
 		 281 aa  243  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  49.45 
 
 		 281 aa  242  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  46.4 
 
 		 276 aa  242  7e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  49.27 
 
 		 281 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 285 aa  241  7.999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 284 aa  241  9e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  45.74 
 
 		 283 aa  241  9e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2430  pantoate/beta-alanine ligase  48.36 
 
 		 288 aa  241  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  44.88 
 
 		 279 aa  240  2e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  49.45 
 
 		 288 aa  240  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  44.77 
 
 		 280 aa  240  2e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  44.77 
 
 		 280 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  48.03 
 
 		 283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  48.24 
 
 		 288 aa  238  5.999999999999999e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  44.69 
 
 		 280 aa  236  2e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  44.29 
 
 		 284 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  48.55 
 
 		 282 aa  237  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  44.29 
 
 		 284 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  44.64 
 
 		 284 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  44.36 
 
 		 284 aa  235  7e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  46.21 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  48.85 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  46.21 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>