More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4743 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 
291 aa  598  1e-170  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  53.02 
 
 
281 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  54.48 
 
 
280 aa  317  1e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  52.67 
 
 
282 aa  317  2e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  54.48 
 
 
280 aa  317  2e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  55.36 
 
 
283 aa  308  8e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  53.96 
 
 
283 aa  301  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 
280 aa  296  2e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  52.08 
 
 
289 aa  292  4e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  51.6 
 
 
282 aa  291  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  48.75 
 
 
280 aa  289  3e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  52.31 
 
 
278 aa  288  7e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  51.96 
 
 
281 aa  287  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  48.75 
 
 
281 aa  286  4e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  51.96 
 
 
278 aa  285  7e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  49.1 
 
 
280 aa  285  8e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 
283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 
276 aa  283  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  49.82 
 
 
281 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  51.61 
 
 
283 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  51.04 
 
 
288 aa  281  1e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 
281 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 
282 aa  280  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  49.29 
 
 
277 aa  277  2e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 
284 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0320  pantoate--beta-alanine ligase  46.43 
 
 
282 aa  272  5.000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  46.43 
 
 
282 aa  272  6e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  49.29 
 
 
277 aa  271  1e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 
283 aa  270  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  45.91 
 
 
282 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  47.86 
 
 
309 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  48.4 
 
 
281 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  49.81 
 
 
529 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  48.57 
 
 
289 aa  265  5.999999999999999e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  50.18 
 
 
288 aa  265  8.999999999999999e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  48.55 
 
 
283 aa  264  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  48.57 
 
 
289 aa  264  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0117  pantoate/beta-alanine ligase  49.82 
 
 
279 aa  263  3e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  47.86 
 
 
300 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  47.41 
 
 
273 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  48.42 
 
 
283 aa  261  6.999999999999999e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  48.42 
 
 
283 aa  261  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  48.77 
 
 
283 aa  261  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  49.46 
 
 
280 aa  261  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  48.07 
 
 
283 aa  259  4e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  48.07 
 
 
283 aa  259  4e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  48.07 
 
 
283 aa  259  4e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  48.07 
 
 
283 aa  259  4e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  48.07 
 
 
283 aa  259  4e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  48.07 
 
 
283 aa  259  4e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  48.28 
 
 
281 aa  258  9e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  48.5 
 
 
268 aa  256  4e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 
283 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  51.36 
 
 
277 aa  255  6e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0101  pantoate--beta-alanine ligase  51.04 
 
 
327 aa  255  7e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  46.64 
 
 
283 aa  254  9e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 
283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  46.76 
 
 
284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  47.39 
 
 
291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  46.76 
 
 
284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 
282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  47.12 
 
 
284 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 
289 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2254  pantoate/beta-alanine ligase  48.6 
 
 
289 aa  254  2.0000000000000002e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  46.76 
 
 
284 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  51.69 
 
 
294 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  46.76 
 
 
284 aa  252  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  47.12 
 
 
284 aa  252  7e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  48.75 
 
 
283 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  47.12 
 
 
284 aa  251  8.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 
283 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0323  pantoate--beta-alanine ligase  47.68 
 
 
301 aa  251  9.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  46.43 
 
 
293 aa  251  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2942  pantoate--beta-alanine ligase  47.86 
 
 
283 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17212 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  50.54 
 
 
287 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 
279 aa  250  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  46.43 
 
 
293 aa  250  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  49.12 
 
 
296 aa  250  2e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 
287 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 
287 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  47.31 
 
 
279 aa  249  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  51.69 
 
 
282 aa  249  3e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  48.43 
 
 
284 aa  249  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  46.59 
 
 
282 aa  249  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0502  pantoate--beta-alanine ligase  47.5 
 
 
300 aa  249  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2286  pantoate--beta-alanine ligase  48.94 
 
 
282 aa  249  5e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000010295  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  51.53 
 
 
287 aa  248  8e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.58 
 
 
528 aa  247  1e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.23 
 
 
511 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  46.01 
 
 
539 aa  247  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 
287 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0787  pantoate--beta-alanine ligase  46.07 
 
 
283 aa  246  2e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.232916  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.23 
 
 
511 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2151  pantoate--beta-alanine ligase  44.09 
 
 
286 aa  246  3e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1498  pantoate--beta-alanine ligase  45.71 
 
 
281 aa  246  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00126611  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0160  pantoate--beta-alanine ligase  46.23 
 
 
304 aa  246  3e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  47.46 
 
 
281 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2891  pantoate/beta-alanine ligase  48.77 
 
 
290 aa  245  4.9999999999999997e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150324  normal  0.438724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 
286 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  49.46 
 
 
282 aa  245  4.9999999999999997e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>