More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0333 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 
278 aa  559  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  89.93 
 
 
278 aa  515  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  65.37 
 
 
277 aa  338  5e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  59.21 
 
 
276 aa  334  9e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  56.43 
 
 
281 aa  333  2e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  55.96 
 
 
289 aa  322  4e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  54.12 
 
 
280 aa  318  6e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  54.12 
 
 
280 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  57.04 
 
 
283 aa  315  4e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  53.62 
 
 
277 aa  310  2e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  53.82 
 
 
282 aa  310  2e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  53.99 
 
 
277 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  52.67 
 
 
282 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  53.76 
 
 
280 aa  306  2.0000000000000002e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  58.98 
 
 
283 aa  306  3e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  56.59 
 
 
268 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  54.8 
 
 
281 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  53.38 
 
 
281 aa  297  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  52.33 
 
 
280 aa  294  1e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  53.05 
 
 
283 aa  291  7e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  52.31 
 
 
291 aa  288  7e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  52.5 
 
 
282 aa  287  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  50.72 
 
 
281 aa  285  5e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  52.98 
 
 
288 aa  285  7e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  53.05 
 
 
283 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  53.38 
 
 
281 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  53.21 
 
 
293 aa  282  4.0000000000000003e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  53.21 
 
 
293 aa  282  4.0000000000000003e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  55.47 
 
 
283 aa  281  6.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  52.12 
 
 
282 aa  281  6.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  49.47 
 
 
281 aa  280  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  52.33 
 
 
283 aa  280  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  55.98 
 
 
281 aa  277  1e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  49.1 
 
 
280 aa  277  1e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  51.45 
 
 
279 aa  277  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  52.5 
 
 
289 aa  276  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  50.9 
 
 
300 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  45.2 
 
 
282 aa  277  2e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  56.32 
 
 
296 aa  276  2e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  51.07 
 
 
309 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  53.5 
 
 
289 aa  275  5e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  51.09 
 
 
279 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  51.53 
 
 
529 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  44.13 
 
 
282 aa  270  2e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  52.54 
 
 
288 aa  269  2.9999999999999997e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0320  pantoate--beta-alanine ligase  43.77 
 
 
282 aa  269  4e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  52.03 
 
 
283 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  51.79 
 
 
291 aa  268  5.9999999999999995e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  48.48 
 
 
279 aa  268  7e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  50.89 
 
 
527 aa  267  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 
289 aa  266  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  49.46 
 
 
284 aa  265  5e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0101  pantoate--beta-alanine ligase  53.96 
 
 
327 aa  258  7e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2254  pantoate/beta-alanine ligase  49.46 
 
 
289 aa  258  8e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1669  pantoate--beta-alanine ligase  46.59 
 
 
282 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1450  pantoate--beta-alanine ligase  46.59 
 
 
282 aa  257  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1563  pantoate--beta-alanine ligase  46.59 
 
 
282 aa  257  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.371985  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2942  pantoate--beta-alanine ligase  51.76 
 
 
283 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17212 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1707  pantoate--beta-alanine ligase  46.24 
 
 
282 aa  257  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0117  pantoate/beta-alanine ligase  50.72 
 
 
279 aa  258  1e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1423  pantoate--beta-alanine ligase  46.24 
 
 
282 aa  257  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3749  pantoate--beta-alanine ligase  46.59 
 
 
282 aa  256  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.94763  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2151  pantoate--beta-alanine ligase  44.6 
 
 
286 aa  256  3e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  49.61 
 
 
273 aa  256  3e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  49.43 
 
 
539 aa  256  3e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1422  pantoate--beta-alanine ligase  46.24 
 
 
282 aa  256  4e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1634  pantoate--beta-alanine ligase  46.24 
 
 
282 aa  256  4e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0402516 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  47.67 
 
 
282 aa  255  7e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1596  pantoate--beta-alanine ligase  46.24 
 
 
282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0472681  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2891  pantoate/beta-alanine ligase  53.93 
 
 
290 aa  253  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150324  normal  0.438724 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1465  pantoate--beta-alanine ligase  46.24 
 
 
282 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2469  pantothenate synthetase  55.26 
 
 
291 aa  250  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163424  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.11 
 
 
534 aa  247  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  50.19 
 
 
280 aa  246  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  49.42 
 
 
282 aa  246  4e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0787  pantoate--beta-alanine ligase  49.41 
 
 
283 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.232916  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1498  pantoate--beta-alanine ligase  50.98 
 
 
281 aa  245  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00126611  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1683  pantoate--beta-alanine ligase  51.18 
 
 
287 aa  245  6.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.708165  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0502  pantoate--beta-alanine ligase  51.36 
 
 
300 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2430  pantoate/beta-alanine ligase  53.12 
 
 
288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0436  pantoate/beta-alanine ligase  45.85 
 
 
273 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0476  pantoate--beta-alanine ligase  45.55 
 
 
281 aa  241  9e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 
290 aa  241  1e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0211  pantothenate synthetase  50.55 
 
 
303 aa  241  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.120689 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  51.15 
 
 
294 aa  240  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  52.08 
 
 
290 aa  239  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2620  pantoate--beta-alanine ligase  44.64 
 
 
283 aa  239  5e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2674  pantoate--beta-alanine ligase  44.64 
 
 
283 aa  239  5e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  50.92 
 
 
287 aa  238  9e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0507  pantoate--beta-alanine ligase  47.73 
 
 
288 aa  238  9e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  45.74 
 
 
283 aa  237  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1263  pantoate--beta-alanine ligase  44.44 
 
 
282 aa  236  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.933341  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8383  pantoate/beta-alanine ligase  51.89 
 
 
288 aa  236  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.857994  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22955  predicted protein  47.95 
 
 
311 aa  237  2e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.271201  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0090  pantoate/beta-alanine ligase  48.91 
 
 
273 aa  236  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8293  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  45.74 
 
 
283 aa  236  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9160  Pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 
285 aa  236  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  45.39 
 
 
283 aa  236  4e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3739  pantoate--beta-alanine ligase  53.61 
 
 
289 aa  235  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.28887  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3822  pantoate--beta-alanine ligase  53.61 
 
 
289 aa  235  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>