More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0436 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0436  pantoate/beta-alanine ligase  100 
 
 
273 aa  564  1e-160  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0252  pantoate--beta-alanine ligase  59.34 
 
 
273 aa  339  4e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.460228  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1370  pantoate--beta-alanine ligase  60.44 
 
 
273 aa  338  7e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0501  pantoate--beta-alanine ligase  56.04 
 
 
273 aa  318  3.9999999999999996e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0361  pantoate--beta-alanine ligase  53.48 
 
 
273 aa  315  3e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0583  pantoate--beta-alanine ligase  55.68 
 
 
273 aa  315  7e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  47.84 
 
 
280 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  47.84 
 
 
280 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  46.43 
 
 
282 aa  249  4e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  46.91 
 
 
276 aa  246  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  43.21 
 
 
281 aa  243  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  45.85 
 
 
278 aa  243  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  47.5 
 
 
280 aa  241  9e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  45.82 
 
 
278 aa  239  4e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  44.57 
 
 
277 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  43.64 
 
 
289 aa  231  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  44.64 
 
 
277 aa  231  1e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0090  pantoate/beta-alanine ligase  45.05 
 
 
273 aa  229  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8293  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  47.48 
 
 
281 aa  229  3e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.91 
 
 
527 aa  228  1e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  44.57 
 
 
287 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  44.6 
 
 
281 aa  224  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1669  pantoate--beta-alanine ligase  42.61 
 
 
282 aa  222  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1450  pantoate--beta-alanine ligase  42.96 
 
 
282 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1422  pantoate--beta-alanine ligase  42.96 
 
 
282 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1634  pantoate--beta-alanine ligase  42.96 
 
 
282 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0402516 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1563  pantoate--beta-alanine ligase  42.96 
 
 
282 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.371985  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2620  pantoate--beta-alanine ligase  43.1 
 
 
283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2674  pantoate--beta-alanine ligase  43.1 
 
 
283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  42.86 
 
 
280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1596  pantoate--beta-alanine ligase  42.61 
 
 
282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0472681  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  43.07 
 
 
282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3749  pantoate--beta-alanine ligase  42.61 
 
 
282 aa  219  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.94763  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1423  pantoate--beta-alanine ligase  42.61 
 
 
282 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  45.98 
 
 
268 aa  218  1e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  44.24 
 
 
281 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  43.73 
 
 
279 aa  217  1e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1707  pantoate--beta-alanine ligase  41.9 
 
 
282 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  42.81 
 
 
294 aa  215  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  41.58 
 
 
283 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.63 
 
 
529 aa  215  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  45.49 
 
 
334 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1465  pantoate--beta-alanine ligase  42.86 
 
 
282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1263  pantoate--beta-alanine ligase  41.94 
 
 
282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.933341  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  43.89 
 
 
277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  41.99 
 
 
282 aa  212  3.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0320  pantoate--beta-alanine ligase  41.64 
 
 
282 aa  212  3.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  41.64 
 
 
282 aa  211  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  41.94 
 
 
283 aa  210  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2469  pantothenate synthetase  46.15 
 
 
291 aa  210  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163424  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  41.99 
 
 
281 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  46.69 
 
 
283 aa  209  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2151  pantoate--beta-alanine ligase  41.07 
 
 
286 aa  209  5e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  43.68 
 
 
539 aa  209  5e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8383  pantoate/beta-alanine ligase  41.88 
 
 
288 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.857994  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  42.35 
 
 
293 aa  207  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  42.29 
 
 
283 aa  207  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  40.07 
 
 
289 aa  207  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  41.43 
 
 
289 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  44.96 
 
 
280 aa  206  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4094  pantoate--beta-alanine ligase  43.73 
 
 
283 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0567  pantoate/beta-alanine ligase  44.27 
 
 
308 aa  206  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0878  pantoate--beta-alanine ligase  41.82 
 
 
279 aa  206  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1212  pantoate--beta-alanine ligase  45.8 
 
 
283 aa  206  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0119566  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0211  pantothenate synthetase  42.91 
 
 
303 aa  206  4e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.120689 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  41.99 
 
 
293 aa  206  5e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  42.81 
 
 
281 aa  205  6e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  41.94 
 
 
282 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0502  pantoate--beta-alanine ligase  43.87 
 
 
300 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9160  Pantoate--beta-alanine ligase  43.19 
 
 
285 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  42.69 
 
 
273 aa  204  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2096  pantoate/beta-alanine ligase  46.39 
 
 
302 aa  202  3e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.985614 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  40.88 
 
 
296 aa  202  4e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  41.84 
 
 
289 aa  202  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0644  pantoate--beta-alanine ligase  44.41 
 
 
283 aa  202  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.62 
 
 
526 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  39.86 
 
 
309 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4007  pantoate/beta-alanine ligase  44.05 
 
 
318 aa  202  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  41.79 
 
 
291 aa  202  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  42.05 
 
 
281 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3186  pantoate--beta-alanine ligase  42.09 
 
 
274 aa  201  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.722916  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  41.76 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0596  pantoate--beta-alanine ligase  41.03 
 
 
278 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.242968 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  42.03 
 
 
284 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2975  pantoate--beta-alanine ligase  44.17 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00455305  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0701  pantoate--beta-alanine ligase  44.17 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.307086  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2884  pantothenate synthetase  40.71 
 
 
296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1204  pantoate--beta-alanine ligase  44.17 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1624  pantoate--beta-alanine ligase  44.17 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00769335  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  39.35 
 
 
300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1043  pantoate--beta-alanine ligase  44.17 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1049  pantoate--beta-alanine ligase  44.17 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2312  pantoate--beta-alanine ligase  44.17 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0189212  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0848  pantoate--beta-alanine ligase  44.13 
 
 
279 aa  199  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.889171  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3808  pantoate--beta-alanine ligase  44.74 
 
 
289 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0471604 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  39.86 
 
 
289 aa  199  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  39.29 
 
 
283 aa  199  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  41.15 
 
 
282 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.38 
 
 
528 aa  199  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0668  pantoate--beta-alanine ligase  42.96 
 
 
282 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>