More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1610 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 280 aa  564  1e-160  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  76.7 
 
 		 280 aa  449  1e-125  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  70.36 
 
 		 280 aa  392  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  70.36 
 
 		 280 aa  391  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  62.01 
 
 		 282 aa  355  5.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  54.12 
 
 		 283 aa  324  8.000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  58.16 
 
 		 281 aa  321  8e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  55.76 
 
 		 280 aa  314  9.999999999999999e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  53.93 
 
 		 283 aa  310  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  51.61 
 
 		 281 aa  306  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  53.02 
 
 		 281 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  53.57 
 
 		 282 aa  302  4.0000000000000003e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  51.07 
 
 		 277 aa  301  7.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  57.58 
 
 		 281 aa  300  2e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  53.74 
 
 		 281 aa  298  5e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  54.64 
 
 		 283 aa  298  5e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  52.67 
 
 		 282 aa  298  6e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  52.67 
 
 		 282 aa  297  1e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  52.14 
 
 		 283 aa  297  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0320  pantoate--beta-alanine ligase  52.31 
 
 		 282 aa  297  1e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  50.71 
 
 		 277 aa  296  2e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  52.33 
 
 		 278 aa  294  9e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  52.33 
 
 		 278 aa  294  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  51.81 
 
 		 281 aa  291  1e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 		 282 aa  290  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  49.29 
 
 		 276 aa  289  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  54.09 
 
 		 268 aa  287  2e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3749  pantoate--beta-alanine ligase  52.35 
 
 		 282 aa  286  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.94763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1596  pantoate--beta-alanine ligase  52.35 
 
 		 282 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0472681  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 		 284 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  51.97 
 
 		 281 aa  285  5e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1669  pantoate--beta-alanine ligase  52.35 
 
 		 282 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  49.1 
 
 		 291 aa  285  7e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  52.71 
 
 		 282 aa  284  9e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  51.6 
 
 		 282 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  51.97 
 
 		 283 aa  283  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  53.6 
 
 		 279 aa  282  3.0000000000000004e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  50 
 
 		 289 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  48.94 
 
 		 288 aa  282  5.000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1707  pantoate--beta-alanine ligase  51.99 
 
 		 282 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1423  pantoate--beta-alanine ligase  51.26 
 
 		 282 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1465  pantoate--beta-alanine ligase  51.6 
 
 		 282 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 		 279 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1634  pantoate--beta-alanine ligase  51.26 
 
 		 282 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0402516 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1450  pantoate--beta-alanine ligase  51.26 
 
 		 282 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1422  pantoate--beta-alanine ligase  51.26 
 
 		 282 aa  280  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1563  pantoate--beta-alanine ligase  51.26 
 
 		 282 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.371985  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2942  pantoate--beta-alanine ligase  46.1 
 
 		 283 aa  279  4e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17212 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 		 279 aa  278  5e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1263  pantoate--beta-alanine ligase  50.9 
 
 		 282 aa  278  8e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.933341  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  51.27 
 
 		 288 aa  278  8e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  50.72 
 
 		 283 aa  277  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0117  pantoate/beta-alanine ligase  52.16 
 
 		 279 aa  275  5e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1498  pantoate--beta-alanine ligase  46.07 
 
 		 281 aa  271  6e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00126611  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0787  pantoate--beta-alanine ligase  46.1 
 
 		 283 aa  271  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.232916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0101  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 327 aa  268  5e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  51.74 
 
 		 277 aa  268  5.9999999999999995e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2151  pantoate--beta-alanine ligase  49.46 
 
 		 286 aa  268  7e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0502  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 300 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  47.69 
 
 		 289 aa  266  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1683  pantoate--beta-alanine ligase  47.86 
 
 		 287 aa  266  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.708165  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  48.65 
 
 		 282 aa  263  2e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  47.67 
 
 		 309 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  48.85 
 
 		 273 aa  260  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  46.4 
 
 		 282 aa  259  4e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0039  pantothenate synthetase  48.19 
 
 		 289 aa  258  7e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.13 
 
 		 527 aa  258  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.1 
 
 		 529 aa  255  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  46.98 
 
 		 289 aa  255  6e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 		 293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  44.6 
 
 		 283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2674  pantoate--beta-alanine ligase  47.5 
 
 		 283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2430  pantoate/beta-alanine ligase  45.68 
 
 		 288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 		 293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2620  pantoate--beta-alanine ligase  47.5 
 
 		 283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  46.26 
 
 		 283 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  48.04 
 
 		 291 aa  252  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.27 
 
 		 528 aa  252  5.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2286  pantoate--beta-alanine ligase  43.57 
 
 		 282 aa  251  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000010295  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  43.88 
 
 		 283 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 		 300 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  45.58 
 
 		 290 aa  250  2e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  43.73 
 
 		 281 aa  249  5e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3319  pantoate--beta-alanine ligase  46.15 
 
 		 286 aa  247  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.11 
 
 		 511 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3808  pantoate--beta-alanine ligase  45.39 
 
 		 289 aa  246  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471604 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  46.4 
 
 		 286 aa  247  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  45.56 
 
 		 290 aa  246  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2254  pantoate/beta-alanine ligase  45.88 
 
 		 289 aa  246  3e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.11 
 
 		 511 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0667  pantoate--beta-alanine ligase  45.68 
 
 		 283 aa  246  3e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  46.59 
 
 		 539 aa  246  4e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  44.09 
 
 		 279 aa  246  4e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.32 
 
 		 534 aa  244  8e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  43.57 
 
 		 283 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.98 
 
 		 526 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  46.12 
 
 		 285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 		 289 aa  243  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  43.57 
 
 		 283 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>