More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1643 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 283 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  78.45 
 
 		 283 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  70.92 
 
 		 282 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  63.83 
 
 		 279 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  63.83 
 
 		 279 aa  367  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  60 
 
 		 284 aa  347  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  61.21 
 
 		 283 aa  346  3e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  58.42 
 
 		 281 aa  341  8e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  55.56 
 
 		 281 aa  331  8e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  58.39 
 
 		 283 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  54.84 
 
 		 281 aa  323  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  53.57 
 
 		 280 aa  323  2e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  53.57 
 
 		 280 aa  323  2e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  55.91 
 
 		 283 aa  321  8e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  52.86 
 
 		 280 aa  315  7e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  52.69 
 
 		 282 aa  314  9.999999999999999e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  53.21 
 
 		 282 aa  313  9.999999999999999e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  57.35 
 
 		 283 aa  313  9.999999999999999e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  53.38 
 
 		 283 aa  308  5e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  55.2 
 
 		 281 aa  302  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  54.81 
 
 		 273 aa  301  1e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  51.97 
 
 		 282 aa  299  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  52.14 
 
 		 280 aa  297  1e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  52.35 
 
 		 280 aa  293  2e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  50.72 
 
 		 281 aa  290  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  51.8 
 
 		 281 aa  288  9e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  54.12 
 
 		 278 aa  286  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  53.05 
 
 		 278 aa  283  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2430  pantoate/beta-alanine ligase  51.99 
 
 		 288 aa  283  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  52.17 
 
 		 288 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  51.79 
 
 		 277 aa  280  2e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1498  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 		 281 aa  280  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00126611  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  52.14 
 
 		 277 aa  280  2e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  50 
 
 		 289 aa  275  7e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1683  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 287 aa  275  9e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.708165  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0787  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 283 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.232916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  50.35 
 
 		 288 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  48.21 
 
 		 276 aa  273  3e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1707  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 282 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1423  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 282 aa  271  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1422  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 282 aa  270  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1634  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 282 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0402516 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 291 aa  270  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1669  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 282 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  52.67 
 
 		 281 aa  269  5e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1450  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 282 aa  268  7e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1563  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 282 aa  268  7e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.371985  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3749  pantoate--beta-alanine ligase  49.46 
 
 		 282 aa  266  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.94763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1596  pantoate--beta-alanine ligase  49.46 
 
 		 282 aa  266  4e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0472681  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2942  pantoate--beta-alanine ligase  48.06 
 
 		 283 aa  264  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17212 
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  50.92 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2674  pantoate--beta-alanine ligase  47.87 
 
 		 283 aa  262  4e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2620  pantoate--beta-alanine ligase  47.87 
 
 		 283 aa  262  4e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0117  pantoate/beta-alanine ligase  50.72 
 
 		 279 aa  261  6.999999999999999e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  45.77 
 
 		 289 aa  261  6.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  48.58 
 
 		 290 aa  260  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  48.04 
 
 		 283 aa  259  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1465  pantoate--beta-alanine ligase  48.75 
 
 		 282 aa  259  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 		 291 aa  259  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3808  pantoate--beta-alanine ligase  52.31 
 
 		 289 aa  258  6e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471604 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  48.58 
 
 		 293 aa  258  7e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1263  pantoate--beta-alanine ligase  47.31 
 
 		 282 aa  258  9e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.933341  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  48.4 
 
 		 283 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  46.24 
 
 		 282 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2151  pantoate--beta-alanine ligase  45.91 
 
 		 286 aa  257  2e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 279 aa  257  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  48.23 
 
 		 293 aa  256  3e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0101  pantoate--beta-alanine ligase  49.1 
 
 		 327 aa  256  3e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0320  pantoate--beta-alanine ligase  44.93 
 
 		 282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2286  pantoate--beta-alanine ligase  48.21 
 
 		 282 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000010295  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  44.2 
 
 		 282 aa  253  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 		 300 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0502  pantoate--beta-alanine ligase  49.46 
 
 		 300 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  47.52 
 
 		 289 aa  253  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  44.57 
 
 		 282 aa  253  4.0000000000000004e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  46.76 
 
 		 283 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  48.75 
 
 		 286 aa  251  6e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3681  pantoate--beta-alanine ligase  53.02 
 
 		 289 aa  252  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.963286  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 		 284 aa  251  7e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  49.46 
 
 		 296 aa  251  7e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  46.98 
 
 		 279 aa  249  3e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  47.37 
 
 		 284 aa  249  3e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  47.89 
 
 		 283 aa  249  4e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3822  pantoate--beta-alanine ligase  52.67 
 
 		 289 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3739  pantoate--beta-alanine ligase  52.67 
 
 		 289 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.28887  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0476  pantoate--beta-alanine ligase  45.71 
 
 		 281 aa  249  4e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  48.04 
 
 		 283 aa  248  8e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  48.04 
 
 		 283 aa  248  8e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  48.04 
 
 		 283 aa  248  8e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  47.54 
 
 		 283 aa  248  8e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  47.01 
 
 		 282 aa  248  8e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  47.02 
 
 		 284 aa  248  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  47.02 
 
 		 284 aa  248  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  48.04 
 
 		 283 aa  248  9e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  48.04 
 
 		 283 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  47.48 
 
 		 284 aa  248  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  48.04 
 
 		 283 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  48.04 
 
 		 283 aa  248  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2254  pantoate/beta-alanine ligase  47.86 
 
 		 289 aa  247  1e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  47.31 
 
 		 289 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>