More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0787 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0787  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 
283 aa  584  1e-166  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.232916  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2942  pantoate--beta-alanine ligase  70.67 
 
 
283 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17212 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1498  pantoate--beta-alanine ligase  61.57 
 
 
281 aa  375  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00126611  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2286  pantoate--beta-alanine ligase  60.36 
 
 
282 aa  356  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000010295  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1683  pantoate--beta-alanine ligase  53.07 
 
 
287 aa  317  2e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.708165  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  49.64 
 
 
282 aa  287  2e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  48.57 
 
 
280 aa  279  3e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 
283 aa  278  7e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  48.57 
 
 
280 aa  278  7e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  49.11 
 
 
283 aa  276  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  47.14 
 
 
280 aa  274  1.0000000000000001e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 
283 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  48.06 
 
 
283 aa  271  6e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  45.39 
 
 
281 aa  271  9e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  46.1 
 
 
280 aa  271  1e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  50.38 
 
 
273 aa  269  4e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  49.81 
 
 
281 aa  267  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  45.68 
 
 
280 aa  265  5e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  49.81 
 
 
281 aa  265  7e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  47.89 
 
 
282 aa  265  7e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1669  pantoate--beta-alanine ligase  47.14 
 
 
282 aa  262  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  47.16 
 
 
282 aa  262  6e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  47.62 
 
 
281 aa  262  6e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  44.29 
 
 
282 aa  261  6.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  47.52 
 
 
283 aa  259  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1423  pantoate--beta-alanine ligase  46.43 
 
 
282 aa  259  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1634  pantoate--beta-alanine ligase  46.43 
 
 
282 aa  258  8e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0402516 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1422  pantoate--beta-alanine ligase  46.43 
 
 
282 aa  258  8e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  46.29 
 
 
283 aa  256  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1450  pantoate--beta-alanine ligase  46.07 
 
 
282 aa  256  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1563  pantoate--beta-alanine ligase  46.07 
 
 
282 aa  256  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.371985  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  48.59 
 
 
279 aa  255  7e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2430  pantoate/beta-alanine ligase  46.43 
 
 
288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  44.64 
 
 
282 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  43.11 
 
 
281 aa  253  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1465  pantoate--beta-alanine ligase  45.04 
 
 
282 aa  253  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  48.01 
 
 
288 aa  253  3e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1707  pantoate--beta-alanine ligase  45.71 
 
 
282 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1263  pantoate--beta-alanine ligase  44.64 
 
 
282 aa  250  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.933341  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  44.13 
 
 
282 aa  249  3e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  47.71 
 
 
283 aa  248  7e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  46.5 
 
 
279 aa  248  9e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  42.2 
 
 
282 aa  247  1e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  47.14 
 
 
284 aa  247  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  46.07 
 
 
291 aa  246  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0320  pantoate--beta-alanine ligase  42.55 
 
 
282 aa  247  2e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1596  pantoate--beta-alanine ligase  45 
 
 
282 aa  246  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0472681  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3749  pantoate--beta-alanine ligase  44.64 
 
 
282 aa  246  4e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.94763  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  49.41 
 
 
278 aa  245  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  44.84 
 
 
276 aa  245  6e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  41.26 
 
 
282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  46.79 
 
 
281 aa  243  3e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  48.25 
 
 
278 aa  240  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  46.39 
 
 
281 aa  239  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  47.86 
 
 
277 aa  238  6.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3739  pantoate--beta-alanine ligase  48.6 
 
 
289 aa  238  8e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.28887  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3822  pantoate--beta-alanine ligase  48.6 
 
 
289 aa  238  8e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3808  pantoate--beta-alanine ligase  46.55 
 
 
289 aa  238  9e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0471604 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0502  pantoate--beta-alanine ligase  45.88 
 
 
300 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  46.43 
 
 
279 aa  236  3e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  47.23 
 
 
288 aa  236  3e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  49.23 
 
 
527 aa  235  5.0000000000000005e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  46.67 
 
 
288 aa  235  6e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  45.04 
 
 
290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2891  pantoate/beta-alanine ligase  50.36 
 
 
290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150324  normal  0.438724 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  45.26 
 
 
289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  42.96 
 
 
300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  44.57 
 
 
289 aa  232  6e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.43 
 
 
511 aa  232  6e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2151  pantoate--beta-alanine ligase  40.07 
 
 
286 aa  231  8.000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.15 
 
 
528 aa  231  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3681  pantoate--beta-alanine ligase  48.25 
 
 
289 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.963286  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.59 
 
 
529 aa  229  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  48.84 
 
 
289 aa  229  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.06 
 
 
511 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  45.91 
 
 
293 aa  229  6e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  41.84 
 
 
283 aa  228  7e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  45.91 
 
 
293 aa  228  8e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  47.53 
 
 
290 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1634  pantoate--beta-alanine ligase  44.68 
 
 
283 aa  226  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  45.56 
 
 
277 aa  227  2e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  45.49 
 
 
286 aa  226  4e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  44.6 
 
 
285 aa  225  6e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  44.53 
 
 
268 aa  225  7e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  43.97 
 
 
286 aa  224  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  41.52 
 
 
309 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  45.31 
 
 
277 aa  224  1e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0117  pantoate/beta-alanine ligase  43.01 
 
 
279 aa  224  1e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  44.13 
 
 
284 aa  223  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  43.22 
 
 
283 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0600  pantoate--beta-alanine ligase  45.36 
 
 
283 aa  223  3e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  42.86 
 
 
289 aa  223  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  48.29 
 
 
296 aa  223  3e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2254  pantoate/beta-alanine ligase  46.04 
 
 
289 aa  223  3e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.63 
 
 
534 aa  222  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  44.13 
 
 
289 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0667  pantoate--beta-alanine ligase  43.37 
 
 
283 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  43.42 
 
 
291 aa  222  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0404  pantoate/beta-alanine ligase  43.46 
 
 
281 aa  221  9e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302391  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  45.59 
 
 
283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>