More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8383 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8383  pantoate/beta-alanine ligase  100 
 
 
288 aa  580  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.857994  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2884  pantothenate synthetase  63.94 
 
 
296 aa  315  6e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  62.86 
 
 
289 aa  311  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  62.07 
 
 
294 aa  300  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  60.15 
 
 
287 aa  298  5e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4283  pantoate--beta-alanine ligase  60.49 
 
 
282 aa  291  1e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4718  pantoate--beta-alanine ligase  60.14 
 
 
282 aa  289  3e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9160  Pantoate--beta-alanine ligase  57.92 
 
 
285 aa  285  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0575  pantoate--beta-alanine ligase  60.84 
 
 
288 aa  286  4e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.447307  normal  0.0256844 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  56.99 
 
 
334 aa  278  8e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32010  pantothenate synthetase  60.84 
 
 
321 aa  270  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0200  pantoate--beta-alanine ligase  56.31 
 
 
360 aa  266  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0160  pantoate--beta-alanine ligase  49.35 
 
 
304 aa  261  6e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0323  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 
301 aa  260  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0090  pantoate/beta-alanine ligase  52.69 
 
 
273 aa  260  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8293  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0635  pantoate/beta-alanine ligase  59.93 
 
 
324 aa  254  9e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.53875  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  47.65 
 
 
281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2096  pantoate/beta-alanine ligase  54.92 
 
 
302 aa  253  3e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.985614 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  50.77 
 
 
283 aa  249  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0211  pantothenate synthetase  52.63 
 
 
303 aa  250  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.120689 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  49.22 
 
 
282 aa  245  8e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  50.38 
 
 
283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0632  pantoate/beta-alanine ligase  56.03 
 
 
276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  47.65 
 
 
281 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  44.62 
 
 
289 aa  241  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  46.93 
 
 
281 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4375  pantoate--beta-alanine ligase  55.02 
 
 
381 aa  239  5e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2620  pantoate--beta-alanine ligase  44.56 
 
 
283 aa  238  5.999999999999999e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2674  pantoate--beta-alanine ligase  44.56 
 
 
283 aa  238  5.999999999999999e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  48.63 
 
 
280 aa  238  1e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  51.89 
 
 
278 aa  236  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.01 
 
 
534 aa  235  5.0000000000000005e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  45.39 
 
 
539 aa  235  5.0000000000000005e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  49.23 
 
 
529 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  51.14 
 
 
278 aa  236  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1424  pantoate--beta-alanine ligase  52.63 
 
 
314 aa  235  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.172502 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  46.27 
 
 
282 aa  235  5.0000000000000005e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  48.24 
 
 
282 aa  233  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  46.9 
 
 
281 aa  232  4.0000000000000004e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  48.93 
 
 
283 aa  231  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.21 
 
 
511 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  47.91 
 
 
290 aa  230  2e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.86 
 
 
511 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0117  pantoate/beta-alanine ligase  49.22 
 
 
279 aa  230  2e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  45.38 
 
 
279 aa  229  3e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35550  pantoate--beta-alanine ligase  54.83 
 
 
302 aa  229  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0479281  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  48.06 
 
 
276 aa  229  5e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  45.21 
 
 
280 aa  229  6e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  43.21 
 
 
280 aa  228  6e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  43.21 
 
 
280 aa  228  9e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4007  pantoate/beta-alanine ligase  53.05 
 
 
318 aa  228  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0325  pantoate--beta-alanine ligase  51.35 
 
 
296 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  47.92 
 
 
288 aa  226  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0600  pantoate--beta-alanine ligase  49.03 
 
 
283 aa  226  3e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0716  pantoate/beta-alanine ligase  52.25 
 
 
618 aa  226  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.34765 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  47.02 
 
 
283 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  48.84 
 
 
277 aa  225  5.0000000000000005e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2151  pantoate--beta-alanine ligase  44.56 
 
 
286 aa  225  6e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4762  pantoate--beta-alanine ligase  54.14 
 
 
313 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4848  pantoate--beta-alanine ligase  54.14 
 
 
313 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0717789  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0039  pantothenate synthetase  46.04 
 
 
289 aa  225  8e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2314  pantoate/beta-alanine ligase  49.29 
 
 
284 aa  224  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000496833  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.49 
 
 
527 aa  224  1e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5148  pantoate--beta-alanine ligase  54.14 
 
 
313 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  48.88 
 
 
283 aa  223  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 
296 aa  223  4e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  50.95 
 
 
281 aa  222  4e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  45.58 
 
 
291 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  49.81 
 
 
289 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3749  pantoate--beta-alanine ligase  45.26 
 
 
282 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.94763  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  50.57 
 
 
288 aa  222  6e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  46.48 
 
 
280 aa  221  9e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  45.74 
 
 
283 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.44 
 
 
526 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  48.91 
 
 
287 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0667  pantoate--beta-alanine ligase  47.45 
 
 
283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 
286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  48.02 
 
 
283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1596  pantoate--beta-alanine ligase  44.91 
 
 
282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0472681  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1669  pantoate--beta-alanine ligase  44.56 
 
 
282 aa  219  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2254  pantoate/beta-alanine ligase  45.2 
 
 
289 aa  219  3.9999999999999997e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  50.56 
 
 
287 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1423  pantoate--beta-alanine ligase  44.91 
 
 
282 aa  219  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  43.93 
 
 
277 aa  219  5e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0553  pantoate--beta-alanine ligase  46.9 
 
 
283 aa  218  7e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1707  pantoate--beta-alanine ligase  44.21 
 
 
282 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  48.73 
 
 
287 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1422  pantoate--beta-alanine ligase  44.91 
 
 
282 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  45.59 
 
 
283 aa  218  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  49.1 
 
 
287 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3835  pantothenate synthetase  43.77 
 
 
283 aa  218  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1634  pantoate--beta-alanine ligase  44.91 
 
 
282 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0402516 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.82 
 
 
528 aa  217  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  45.32 
 
 
293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1450  pantoate--beta-alanine ligase  44.56 
 
 
282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0567  pantoate/beta-alanine ligase  52.17 
 
 
308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1563  pantoate--beta-alanine ligase  44.56 
 
 
282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.371985  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1263  pantoate--beta-alanine ligase  44.94 
 
 
282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.933341  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  44.06 
 
 
282 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  46.07 
 
 
283 aa  216  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>