More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_22955 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011688  PHATRDRAFT_22955  predicted protein  100 
 
 
311 aa  633    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.271201  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  47.62 
 
 
280 aa  256  3e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  47.62 
 
 
280 aa  247  1e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  47 
 
 
283 aa  246  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  47.62 
 
 
280 aa  246  3e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  46.32 
 
 
276 aa  246  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  46.89 
 
 
268 aa  242  6e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45 
 
 
511 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  45.59 
 
 
280 aa  240  2e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45 
 
 
511 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  48.16 
 
 
277 aa  239  4e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  49.32 
 
 
278 aa  238  8e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  47.95 
 
 
278 aa  237  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  45.96 
 
 
277 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  47.79 
 
 
281 aa  235  7e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  42.66 
 
 
277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  44.11 
 
 
281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.56 
 
 
526 aa  232  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  44.07 
 
 
288 aa  230  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  46.05 
 
 
309 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  42.36 
 
 
282 aa  230  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  44.71 
 
 
291 aa  230  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  43.37 
 
 
280 aa  229  6e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  44.85 
 
 
281 aa  228  7e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  46.39 
 
 
300 aa  228  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.31 
 
 
528 aa  226  5.0000000000000005e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57860  pantothenate synthase  40.13 
 
 
312 aa  224  2e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.355698 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  46.94 
 
 
291 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  42.09 
 
 
289 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  44.28 
 
 
283 aa  222  6e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  41.5 
 
 
281 aa  221  9e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  43 
 
 
281 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  43.53 
 
 
539 aa  221  9.999999999999999e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  41.41 
 
 
282 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  42.8 
 
 
279 aa  219  5e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.93 
 
 
534 aa  219  6e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  45.21 
 
 
289 aa  218  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  42.37 
 
 
281 aa  218  1e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  42.75 
 
 
282 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  43.9 
 
 
283 aa  216  4e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.62 
 
 
529 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1263  pantoate--beta-alanine ligase  41.22 
 
 
282 aa  216  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.933341  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  43.39 
 
 
293 aa  216  5e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  43.39 
 
 
293 aa  216  5.9999999999999996e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0101  pantoate--beta-alanine ligase  44.12 
 
 
327 aa  215  9e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0117  pantoate/beta-alanine ligase  42.86 
 
 
279 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2151  pantoate--beta-alanine ligase  42.09 
 
 
286 aa  213  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  44.59 
 
 
289 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0320  pantoate--beta-alanine ligase  38.68 
 
 
282 aa  213  3.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  38.1 
 
 
282 aa  213  4.9999999999999996e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  44.26 
 
 
280 aa  212  4.9999999999999996e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  42.12 
 
 
283 aa  212  7e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  44.98 
 
 
283 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  39.93 
 
 
282 aa  211  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  44.4 
 
 
289 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  41.81 
 
 
281 aa  211  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.03 
 
 
527 aa  210  3e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  46.04 
 
 
287 aa  209  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  43.15 
 
 
283 aa  209  5e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1423  pantoate--beta-alanine ligase  40.86 
 
 
282 aa  209  7e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2620  pantoate--beta-alanine ligase  41.28 
 
 
283 aa  208  9e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2674  pantoate--beta-alanine ligase  41.28 
 
 
283 aa  208  9e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1465  pantoate--beta-alanine ligase  41.67 
 
 
282 aa  208  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2254  pantoate/beta-alanine ligase  43.91 
 
 
289 aa  207  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1669  pantoate--beta-alanine ligase  40.86 
 
 
282 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1450  pantoate--beta-alanine ligase  40.5 
 
 
282 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1422  pantoate--beta-alanine ligase  40.5 
 
 
282 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1563  pantoate--beta-alanine ligase  40.5 
 
 
282 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.371985  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1596  pantoate--beta-alanine ligase  42.18 
 
 
282 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0472681  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1634  pantoate--beta-alanine ligase  40.5 
 
 
282 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0402516 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3749  pantoate--beta-alanine ligase  41.82 
 
 
282 aa  206  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.94763  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  41.84 
 
 
282 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  42.49 
 
 
282 aa  206  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0553  pantoate--beta-alanine ligase  41.76 
 
 
283 aa  206  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  44.17 
 
 
283 aa  206  6e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  42.11 
 
 
284 aa  205  6e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  43.88 
 
 
286 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  41.36 
 
 
282 aa  203  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1683  pantoate--beta-alanine ligase  42.76 
 
 
287 aa  202  5e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.708165  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  42.7 
 
 
279 aa  202  6e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  42.67 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  45.74 
 
 
293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  41.92 
 
 
283 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0667  pantoate--beta-alanine ligase  41.85 
 
 
283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8383  pantoate/beta-alanine ligase  44.93 
 
 
288 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.857994  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0231  pantoate--beta-alanine ligase  39.93 
 
 
285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  42.28 
 
 
279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9160  Pantoate--beta-alanine ligase  42.18 
 
 
285 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2767  pantoate--beta-alanine ligase  43.66 
 
 
275 aa  199  6e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.1934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4557  pantoate/beta-alanine ligase  40.73 
 
 
280 aa  199  6e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.146553  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  42.31 
 
 
284 aa  198  7.999999999999999e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1634  pantoate--beta-alanine ligase  41.26 
 
 
283 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  43.45 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1707  pantoate--beta-alanine ligase  39.78 
 
 
282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  43.45 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  45.77 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0361  pantoate--beta-alanine ligase  39.93 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  43.36 
 
 
283 aa  196  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0476  pantoate--beta-alanine ligase  41.22 
 
 
281 aa  195  7e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  46.13 
 
 
284 aa  195  7e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>